学名のカナ表記は，原則としてリフォームド・アカデミック方式に従う．

生物は，大きく以下の3つのドメイン(domain/superkingdom)という ランクに分けられる．（C. ウーズ 1977）ただし，ウィルス (Virus) はこれらの外に位置づけられる．

このうち，古細菌と（真正）細菌は，あわせて真核生物に対して原核生物 (Procaryote)と呼ばれる．原核生物は全て単細胞生物で，細胞内にはDNAと リボゾーム（沈降係数80S）があるが，核膜が無く細胞の大きさは1〜10μm と小さい．一方， 真核生物には多細胞生物もいる．真核生物の細胞では，DNAは核膜に閉じ込め られて核を形成し，細胞質部分と分離される．細胞質にはリボゾーム（沈降 係数70S）の他にミトコンドリア，葉緑体，ゴルジ体などの原核生物に見られ ない細胞質構造が存在する． 真核生物の細胞内器官であるミトコンドリアや 葉緑体は，古細菌様の古代生物に原核生物が細胞内共生して生じた考えられる． (Lin Margulis, 1970) 生物の共通の祖先（コモノート）により近いのは細菌か古細菌かは意見が 分かれている．