古細菌の系譜(系統分類)

細菌の系譜

真核生物の系譜

古細菌の分類: 資料 The tree of life project <http://tolweb.org/> 『生命と地球の共進化』川上紳一 P89

古細菌 (Domain Archaea)   ss rRNA 塩基配列により分類
  クレン古細菌門 (Crenarchaeota)  好熱,好酸,あるいはS依存性古細菌
    テルモプロテウス目 (Thermoproteales)
        (Thermofilum)
          (Pyrobaculum)
          テルモプロテウス科 (Thermoproteaceae)
            テルモプロテウス (Thermoproteus)
    スルフォロバス目 (Sulforobales)
      スルフォロバス科 (硫黄代謝細菌) (Sulforobaceae)
        スルフォロバス (Sulforobus)
          (Methallosphaera)
          (Acidiuanus)
        (Desulfurolobus)
        (Stygiolobus)   

        (Thermodiscus)
        イグネオコッカス (Igneococcus) 好熱 

        (Thermosphaera)
        (Desulfurococcus)
        (Staphylothermus)
    ピロディクティウム類 (Pyrodictiumles)
        (Pyrolobus)
          (Hyperthermus)
          ピロディクティウム (Pyrodictium) 生育最適温度 105度

  ユーリ古細菌門 (Euryarchaeota)
      ハロバクテリウム目 (Halobacteriales)  [高度好塩古細菌]メタノミクロビウム目と近縁
        ハロバクテリウム科 (Halobacteriaceae)
          ハロバクテリウム (Halobacterium)
          (Haloarcula)
          (Halococcus)
          (Haloferax)
          (Natronobacterium)
          (Natronococcus)
      メタノミクロビウム目 (Methanomicrobiales) [メタン生成古細菌 (Methanogens)]ハロバクテリウムと近縁
        メタノミクロビウム科 (Methanomicrobiaceae)
          (Methanomicrobium)
          (Methanoculleus)
        メタノコルプスクルム科 (Methanocorpusculaceae)
          (Methanocorpusculum)
        メタノプラヌス科 (Methanoplanus)
          (Methanoplanus) 
      メタン細菌目 (Methanobacteriales)[メタン生成古細菌 (Methanogens)]
        メタン細菌科 (Methanobacteriaceae)
          メタン細菌 (Methanobacterium)
          (Metanobrevibacter)
          (Methanosphaera)
        メタノテルムス科 (Methanothermaceae)
          メタノテルムス (Methanothermus)
      メタノコックス目 (Methanococcales)[メタン生成古細菌 (Methanogens)]
        メタノコックス (Methanococcus)
      (Methanopyrales)[メタン生成古細菌 (Methanogens)]
          (Methanopyrus)
      ?アルカエグロブス目 (Archaeoglobales) [硫黄還元古細菌]
         アルカエグロブス (Archaeoglobus)

      テルモコックス目 (Thermococccales) [好熱,好酸古細菌]
        テルモコックス (Thermococcus)
        (Pyrococcus)
      テルモプラズマ目(無細胞壁古細菌) (Thermoplasmatales) [好熱,好酸,あるいはS依存性古細菌]
          テルモプラズマ (Thermoplasma)
      メタノサルシナ目 (Methanosarcinales) [メタン生成古細菌 (Methanogens)]

        メタノサルシナ科 (Methanosarcinaceae)
          (Methanosarcina)
          (Methanococcoides)
          (Methanohalobium)
          (Methanohalophilus)
          (Methanolobus)
      メタノスビリラム類
          メタノスビリナム () 
      その他
          (Halomethanococcus)
          (Methanosaeta)
  コル古細菌門 (Korarchaeota) 環境内のDNA塩基配列のみで存在が示唆されている
  ナノ古細菌門 (Nanoarchaeota) 海底熱水噴出孔 Nature 417, 63 (2002)
    (Nanoarchaeum equitans) 400nm 宿主古細菌 Ignicoccus の表面に付着,最小ゲノムサイズ