従来は，Cavalier-Smith 1998 Biol. Rev. 73, 203--266 Cavalier-Smith (2002) Int. J. Syst. Evol. Microbio. 2002 52, 297--354. に従っていたが，以下の分類は Adl et al. 2005 J. Eukaryot. Microbiol. 52, 399 を基本とし，いくつかの 分子生物学的知見を加えたものである．
最上位分類は，暫定的に ユニコンタ類
アメーバ動物界 (Amoebozoa)
後方鞭毛生物界(Opisthokonta)
バイコンタ類 エクスカヴァータ界 (Excavata)
超植物上界
（真正）植物界 (Archaeplastida)
リザリア界 (Rhizaria) クロマルヴェオラータ界内?
クロマルヴェオラータ界 (Chromalveolata) 多系統
の６界に分けた．この６界は，ジヒドロ葉酸還元酵素 (DHFR) とチミジル酸合成酵素(TS)の 両作用をする一つのたんぱく質をコードする融合遺伝子を持つグループと， 細菌と同様に両酵素が別々のたんぱく質によって担われるグループに分ら れる．DHFR-TS融合型は，エクスカヴァータ界（一部失っている系統あり）， リザリア界，クロマルヴェオラータ界，アーケプラスティダ界に分布し， バイコンタ類と呼ばれる． 非融合型は，アメーバ動物界と後方鞭毛生物界に分布し，ユニコンタ類と 呼ばれる．非融合型から融合型への変異が１度限りであったとし，後方 鞭毛生物界に特有のEF-1α配列挿入を考慮すると，アメーバ動物が最も 始源的と考えられる．
しかし，DHFR-TS融合型が形成が複数回が生じたり，水平転移が生じたり， DHFR-TS融合型の共通祖先から遺伝子の分離（融合遺伝子が重複した後に それぞれが機能特化する可能性がある）によって非融合型が後から生じた とすれば上記の結論には問題がある．また，クロマルヴェオラータ界の 単系統性には疑問が呈されていて，そこにリザリア界が含まれるとの考え 方も出されている．
真核生物 (Domain Eucarya) ［ユニコンタ類＋バイコンタ類］
ユニコンタ類 (Unikonta) ［アメーバ動物界＋後方鞭毛生物界］ Embley & Martin 2006 Nature 440, 623. 異説［アメーバ動物界＋｛後方鞭毛生物界＋バイコンタ類｝］ Nozaki et al. 2007
?テロネマ門 (Telonemia)
テロネマ (Telonema)
アメーバ動物界 (Amoebozoa) ［ブレヴィアタ綱＋アメーバ動物門］ Pawlowski & Burki 2009, J. Eukaryot. Microbiol. 56(1) 16-25.
ブレヴィアタ綱 (Breviatea) Minge et al. 2008
ブレヴィアタ目 (Breviatida)
ブレヴィアタ (Breviata) 旧 Mastigamoeba invertens 自由生活アメーバ鞭毛虫
アメーバ動物門（根足類） (Amoebozoa) ［雑多綱＋トゥブリナ綱＋フラベリナ綱＋コノーサ亜門］ 仮足によるアメーバ運動
?(Hartmannia)
?(Janickia)
?(Malamoeba)
?(Malpigamoeba)
?トリコスフェリウム目 (Trichosida) 有殻アメーバ亜綱?
トリコスフェリウム (Trichosphaerium) SSU rDNA変異速度大
?アカントアメーバ目 (Acanthopodida) 雑多綱?
アカントアメーバ科 (Acanthopodidae)
バラムティア (Balamuthia)
プロタカントアメーバ (Protacanthamoeba)
アカントアメーバ (Acanthamoeba/Comandonia)
?マヨレラ目 (Mayorellida)
?マヨレラ (Mayorella) 旧フラベリナ綱指足目
デルマメーバ (Dermamoeba) 旧テカメーバ目
?テカメーバ目 (Thecamoebida/Dermamoebida) フラベリナ綱?
?(Thecochaos)
ストリアメーバ科 (Striamoebidae)
ストリアメーバ (Striamoeba)
パラデルマメーバ (Paradermamoeba)
テカメーバ科 (Thecamoebidae)
パーヴァメーバ (Parvamoeba)
サッピニア (Sappinia)
テカメーバ (Thecamoeba)
(Pseudothecamoeba)
雑多綱 (Variosea) 多系統? 環境DNA配列により構成
スティガメーバ (Stygamoeba)
ステロミクサ目 (Stereomyxida) 海産
ステロミクサ (Steromyxa)
ホロマスティガ亜綱 (Holomastiga)
マルティキリア (Multicilia) 多鞭毛虫
アクラメーバ (Acramoeba) 旧 (Gephyramoeba) 旧レプトミクサ目
スポンゴモナス目 (Spongomonadida) ケルコモナス綱タウマトモナス目
ファランステリウム科 (Phalansteriidae)
ファランステリウム (Phalansterium) 単鞭毛虫
?スポンゴモナス科 (Spongomonadidae)
スポンゴモナス (Spongomonas)
リピドデンドロン (Rhipidodendron)
フィラメーバ目 (Filamoebida)
フィラメーバ科 (Filamoebidae)
フィラメーバ (Filamoeba)
("Arachnula")
トゥブリナ綱 (Tubulinea) ［レプトミクサ目＋有殻アメーバ亜綱］管状仮足・一軸細胞質流動
?(Hartmannella vermiformis)
エキナメーバ (Echinamoeba)
レプトミクサ目 (Leptomyxida) 網状仮足
?(Ripidmyxa)
レプトミクサ科 (Leptomyxidae)
レプトミクサ (Leptomyxa)
リザメーバ (Rhizamoeba)
フラベルラ科 (Flabellulidae)
フラベルラ (Flabellula)
パラフラベルラ (Paraflabellula)
有殻アメーバ亜綱 (Testacealobosia) ［ナベカムリ目＋トゥブリナ目］ 細胞を覆う殻
ナベカムリ目 (Arcellinida) ［アルケラ亜目＋ディフルギア亜目＋フリガネラ亜目］ 単系統性に疑問?
(Pseudawerintzewia)
アルケラ亜目 (Arcellina)
ミクロコリキア科 (Microcoryciidae)
(Amphizonella)
(Diplochlamys)
ミクロコリキア (Microcorycia)
(Parmulina)
(Penardochlamys)
(Zonomyxa)
ミクロクラミス科 (Microchlamyiidae)
ミクロクラミス (Microchlamys)
アルケラ科 (Arcellidae)
アルケラ (Arcella)
アンタルケラ (Antarcella)
(Pyxidicula)
ディフルギア亜目 (Difflugina)
トゲフセツボカムリ科 (Centropyxidae)
?(Oopyxis)
?(Cyclopyxis)
(Centropyxiella)
トゲフセツボカムリ (Centropyxis)
(Proplagiopyxis)
ナガツボカムリ科 (Difflugiidae)
(Cucurbitella)
ナガツボカムリ (Difflugia)
(Lagenodifflugia)
(Maghrebia)
(Pentagonia)
(Pontigulasia)
(Schwabia)
(Sexangularia)
(Suiadifflugia)
(Zivkovicia)
(Trigonopyxidae)
(Cornuapyxis)
(Cyclopyxis)
(Ellipsopyxella)
(Ellipsopyxis)
(Geopyxella)
(Trigonopyxis)
(Lamtopyxidae)
(Lamtopyxis)
(Distomatopyxidae)
(Distomatopyxis)
(Lesquereusiidae)
(Lesquereusia)
(Microquadrula)
(Netzelia)
(Pomoriella)
(Quadrulella)
(Hyalospheniidae)
(Leptochlamys)
(Hyalosphenia)
(Paraquadrulidae)
(Lamtoquadrula)
(Paraquadrula)
(Heleoperidae)
(Awerintzewia)
(Heleopera)
アミカムリ科 (Nebelidae)
?(Geamphorella)
?(Jungia)
?(Pseudonebela)
(Alocodera)
(Apodera)
(Argynnia)
(Certesella)
アミカムリ (Nebela)
(Physochila)
(Porosia)
(Schoenbornia)
フリガネラ亜目 (Phryganellina)
フリガネラ科 (Phryganellidae)
フリガネラ (Phryganella)
クリプトディフルギア科 (Cryptodifflugiidae)
クリプトディフルギア (Cryptodifflugia)
(Wailesella)
トゥブリナ目 (Tubulinida) 狭義のアメーバ，殻無し，管仮足
?(Hydramoeba)
?(Pseudothecamoeba)
ノランデラ (Nolandella)
アメーバ上科 (Amoeboidea)
サッカメーバ (Saccamoeba)
ハルトマネラ科 (Hartmannellidae) 側系統
カシア (Cashia)
ハルトマネラ (Hartmannella)
グラエセリア (Glaeseria)
アメーバ科 (Amoebidae)
カオス (Chaos)
アメーバ (Amoeba)
パラカオス (Parachaos)
トリカメーバ (Trichamoeba)
メタカオス (Metachaos)
ポリカオス (Polychaos)
フラベリナ綱 (Flabellinea) ［指足目＋ヴァネラ目＋テカメーバ目＋コクリオポディウム目］ 平板アメーバ・細胞質流動多軸，鞭毛ステージ無し
?(Pellita)
?(Hyalodiscidae)
(Flamella)
(Gibbodiscus)
(Hyalodiscus)
指足目 (Dactylopodida) 多系統?
パラメーバ科 (Paramoebidae)
(Korotnevella)
(Paramoeba)
ヴェキリフェラ科 (Vexilliferidae)
?(Dactylosphaerium)
?(Striolatus)
?(Podostoma)
?(Oscillosignum)
?(Subulamoeba)
?(Boveella)
?(Triaenamoeba)
ヴェキリフェラ (Vexillifera)
(Pseudoparamoeba)
(Neoparamoeba)
ヴァネラ目 (Vannellida) 多系統?
ヴァネラ科 (Vannellidae)
?(Pessonella)
(Platyamoeba)
ヴァネラ (Vannella)
ディスカメーバ亜科 (Discamoebinae)
ディスカメーバ (Discamoeba)
(Clydonella)
(Unda)
(Lingulamoeba)
コクリオポディウム目 (Cochliopodida/Himatismenida)
コクリオポディウム科 (Cochliopodiidae)
?パラゴケヴィア (Paragocevia)
ゴケヴィア (Gocevia)
コクリオポディウム (Cochliopodium)
(Ovalopodium)
コノーサ亜門 (Conosa) ［古アメーバ綱＋粘菌綱］
古アメーバ綱 (Archamoebea) ［ペロミキサアメーバ目＋マスティグアメーバ目］
ペロミキサアメーバ目 (Pelobiontida) Mt, peroxisome, hydrogenosomes喪失
ペロミキサ科 (Pelomyxidae)
ペロミキサ (Pelomyxa) 多鞭毛・共生
赤痢アメーバ科 (Entamoebidae) 無鞭毛，中心小体無し
赤痢アメーバ (Entamoeba) ミトコンドリア喪失，ミトソーム残存
マスティグアメーバ目 (Mastigamoebida) 多仮足・単鞭毛 下位分類不詳：分子系統的に離れたものを含む属の存在
(Mastigina)
(Mastigella)
マスティグアメーバ (Mastigamoeba)
(Phreatamoeba)
エンドリマックス (Endolimax)
(Endamoeba)
粘菌綱 (Mycetozoa) ［タマホコリカビ亜綱＋粘菌亜綱］
?コプロミクサ科 (Copromyxidae/Copromyxaceae) Mycetozoa?
コプロミクサ (Copromyxa)
(Copromyxella)
?(Fonticulidae)
(Fonticula)
?エキノステリオプシス科 (Echinosteliopsidae)
?(Bursulla)
エキノステリオプシス (Echinosteliopsis)
?プロトステリウム目 (Protostelida) 原生粘菌
(Microglomus)
(Tychosporium)
プロトステリウム科 (Protosteliidae)
(Nematostelium)
(Protostelium)
(Schizoplasmodium)
カヴォステリウム科 (Cavosteliidae)
(Cavostellium)
(Clastostelium)
(Planoprotostelium)
(Protosporangium)
ケラティオミクサ (Ceratiomyxa) 旧プロトステリウム目
タマホコリカビ亜綱 (Dictyostelia) 細胞性粘菌
タマホコリカビ目 (Dictyosteliida)
アキトステリウム科 (Acytosteliidae)
アキトステリウム (Acytostelium)
タマホコリカビ科 (Dictyosteliidae)
コエノニア (Coenonia)
タマホコリカビ (Dictyostelium)
(Polysphondylium)
粘菌亜綱 (Myxogastria) 変形菌
?ハイパーアメーバ (Hyperamoeba) モジホコリカビに近縁
ホコリカビモドキ目 (Parastelida)
ケラティオミクサ科 (Ceratiomyxidae)
ケラティオミクサ (Ceratiomyxa)
(Ceratiomyxella)
ハリホコリカビ目 (Echinosteliida)
クビナガホコリカビ科 (Clastodermidae)
(Barbeyella)
クビナガホコリカビ (Clastoderma)
ハリホコリカビ科 (Echinosteliidae)
ハリホコリカビ (Echinostelium)
コホコリカビ目 (Liceida)
コホコリカビ科 (Liceidae)
(Kelleromyxa)
コホコリカビ (Licea)
ジュズホコリカビ科 (Listerellidae)
ジュズホコリカビ (Listerella)
ドロホコリカビ科 (Enteridiidae)
アミホコリカビ (Cribraria)
(Dictydiaethalium)
(Dictydium)
ドロホコリカビ (Enteridium)
フンホコリカビ (Lindbladia)
マメホコリカビ (Lycogala)
クダホコロカビ (Tubulifera)
ケホコリカビ目 (Trichiida)
(Dianemidae)
(Calomyxa)
(Dianema)
ケホコリカビ科 (Trichiidae)
(Arcyodes)
(Arcyria)
(Arcyriatella)
(Calonema)
(Cornuvia)
(Hemitrichia)
(Metakatella)
(Minakatella)
(Oligonema)
(Perichaena)
(Prototrichia)
ケホコリカビ (Trichia)
ムラサキホコリカビ目 (Stemonitida)
ムラサキホコリカビ科 (Stemonitidae)
ムラサキホコリカビ (Stemonitis)
(Symphytocarpus)
... see Systema Naturae 2000
モジホコリカビ目 (Physarida)
(Elaeomyxidae)
(Elaeomyxa)
(Physaridae)
モジホコリカビ (Physarum)
... see Systema Naturae 2000
(Didymiidae)
(Didymium)
... see Systema Naturae 2000
後方鞭毛生物界 (Opisthokonta/Opistoconta) ［菌類＋ホロゾア］
?アフィリディウム類 (Aphelidea) 偽粘菌亜界?
アメーバアフィリディウム (Amoeboaphelidium)
アフィリディウム (Aphelidium)
プセウドフィリディウム (Pseudophelidium)
真菌様類 ［ヌクレアリア目＋真菌亜界］
ヌクレアリア目 (Nucleariida) アメーバ状（糸足）平板クリステ Amaral Zettler et al. 2001
ヌクレアリア (Nuclearia)
真菌亜界 (Fungi) Fungi ［微胞子虫門＋（狭義）菌類］
「従属栄養（非補食），細胞壁・菌糸」
?微胞子虫門 (Microsporidia) 細胞間寄生 現生200種
「繊毛・ミトコンドリアを二次喪失．二次的に大量の遺伝子を喪失しており，系統的位置は不明確．」
?ネフリディオファガ綱 (Nephridiophagea) 系統不詳
ネフリディオファガ科 (Nephridiophagidae)
ネフリディオファガ (Nephridiophaga) 甲虫・ゴキブリのマルピーギ管に寄生 胞子形成
ミニスポラ綱 (Minisporea)
ミニスポラ目 (Minisporida)
キトリディオプシス科 (Chytridiopsidae)
キトリディオプシス (Chytridiopsis)
ヘッセア科 (Hesseidae)
ヘッセア (Hessea)
(Burkeidae)
ブックステフディア科 (Buxtehudeidae)
ブックステフディア (Buxtehudia)
微胞子虫綱 (Microsporea)
プレイストフォラ亜綱 (Pleistophorea/Pansporoblastina)
グルゲア科 (Glugeidae)
グルゲア (Glugea)
プレイストフォラ科 (Pseudopleistophoridae)
プレイストフォラ (Pleistophora)
(Duboscqiidae)
(Thelohaniidae)
(Burenellidae)
アンブリオスポラ科 (Amblyosporidae)
アンブリオスポラ (Amblyospora)
(Culicosporidae)
(Gurleyidae)
(Telomyxidae)
(Tuzetiidae)
ディスポレア亜綱 (Disporea/Apansporoblastina)
(Desportesia)
エンセファリトイズーン科 (Encephalitozoonidae)
エンセファリトイズーン (Encephalitozoon) ミトコンドリア喪失
エンテロキトズーン科 (Enterocytozoonidae)
エンテロキトズーン (Enterocytozoon)
(Unikaryonidae)
スプラグエラ科 (Spraguidae)
スプラグエラ (Spraguea)
(Pereziidae)
(Cougourdellidae)
カウドスポラ科 (Caudosporidae)
カウドスポラ (Caudospora)
微粒子病原虫科 (Nosematidae)
微粒子病原虫 (Nosema)
(Culicosporellidae)
(Mrazekiidae)
?エクリナ目 (Eccrinales)
エクリナ科 (Eccrinaceae)
エクリナ (Eccrina)
(Eccrinidus)
(Enterobryus)
(Enteromyces)
パラワスキア科 (Palavasciaceae)
パラワスキア (Palavascia)
パラタエニエラ科 (Parataniellaceae)
パラタニエラ (Parataniella)
（狭義）菌類 ［ツボカビ門＋｛コウマクノウキン門＋｛接合菌門＋｛ケカビ門＋新菌類｝｝｝］
?ロゼラ (Rozella) James et al. (2006) Mycologia, 98(6), 860
ツボカビ門 (Chytridiomycota) ［ネオカリマスティクス綱＋ツボカビ亜門］葉状体の胞子嚢で鞭毛胞子（zoospores）生産 1000種
ネオカリマスティクス綱 (Neocallimastigomycetes)
ネオカリマスティクス目 (Neocallimastigales)
(Anaeromyces)
(Caecomyces)
(Cyllamyces)
ネオカリマスティクス (Neocallimastix)
(Orpinomyces)
(Piromyces)
ツボカビ亜門 (Chytridiomycotae) ［サヤミドロモドキ綱＋ツボカビ綱］
サヤミドロモドキ綱 (Monoblepharidomycetes)
サヤミドロモドキ目 (Monoblepharidales)
(Oedogoniomycetaceae) ［側］
(Oedogoniomyces)
(Harpochytrium)
ゴナポディア科 (Gonapodyaceae)
ゴナポディア (Gonapodya)
サヤミドロモドキ科 (Monoblepharidaceae)
モノベレファレラ (Monoblepharella)
サヤモドロモドキ (Monoblepharis)
ツボカビ綱 (Chytridiomycetes)
ツボカビ目 (Chytridiales)
?(Achlyogetonaceae)
(Polychytriaceae)
(Kaerlingiomyces)
(Polychytrium)
(Lacustromyces)
***
エダツボカビ科 (Cladochytriaceae)
エダツボカビ (Cladochytrium)
(Nephronchytrium)
(Nowakowskiella)
(Chytridium? lagenarium)
(Endochytrium)
***
(Allochytridium)
(Septochytrium)
(Catenochytrium)
サビツボカビ科 (Synchytriaceae)
サビツボカビ (Synchytrium) じゃがいも寄生
ツボカビ科 (Chytridiaceae)
ツボカビ (Chytridium)
フタナシツボカビ亜目 (Rhizophydiineae)
(Entophlyctis helioformis)
カエルツボカビ (Batrachochytrium) 両生類寄生（両生類数減少因）
(Entophlyctis)
フタナシツボカビ (Rhizophydium) 多系統 含む Kappamyces
スピゼロミケス目 (Spizellomycetales)
?(Karlingiomyces)
?(Kochiomyces)
(Blytiomyces)
スピゼロミケス科 (Spizellomycetaceae)
(Gaertneriomyces)
(Triparticular)
スピゼロミケス (Spizellomyces)
(Powellomyces)
リゾフリクティス科 (Rhizophlyctaceae)
リゾフリクティス (Rhizophlyctis) 耕土中
(Catenomyces)
(Entrophlyctis)
キトリオミケス目 (Chytriomycetales）
(Phlyctochytrium planicome)
(Chytriomyces JEL47/354/114)
ネツキツボカビ (Rhizidium)
***
(Asterophlyctis)
(Chytriomyces JEL155/WB235A)
(Physocladia)
(Chytriomyces JEL187)
(Entrophlyctis luteolus)
**
(Podochytrium)
(Siphonaria)
(Chytriomyces JEL378)
(Phlyctorhiza)
(Obelidium)
(Chytriomyces JEL103)
(Rhizoclosmatium)
***
(Chytriomyces hyalinus) 淡水に普通
(Chytriomyces confervae)
コウマクノウキン門 (Blastocladiomycota) James et al. 2005
コウマクノウキン綱 (Blastocladiomycetes)
コウマクノウキン目 (Blastocladiales)
ソロキトリウム (Sorochytrium) ［単］
フィソデルマ科 (Physodermataceae)
フィソデルマ (Physoderma)
(Urophlyctis)
コウマクノウキン亜目 (Blastocladiineae)
ボウフラキン科 (Coelomomycetaceae)
ボウフラキン (Coelomomyces)
コウマクノウキン科 (Blastocladiaceae)
カワリミズカビ (Allomyces)
(Blastocladia)
コウマクノウキン (Blastocladiella)
(Blastocladiopsis)
(Microallomyces)
フシフクロカビ科 (Catenariaceae)
フシフクロカビ (Catenaria)
カテノミケス (Catenomyces)
(Catenophlyctis)
接合菌門 (Zygomycota) ［キクセラ亜門＋ハエカビ亜門］ ［側］
?フクロカビ科 (Olpidiaceae) 旧スピゼロミケス目 James et al. (2006) Mycologia, 98(6), 860
カウロキトリウム (Caulochytrium)
フクロカビ (Olpidium) キュウリ根寄生
キクセラ亜門 (Kickxellomycotina)
ディマルガルス目 (Dimargaritales)
ディマルガリス (Dimargaris)
(Dispira)
(Spinalia)
(Tieghemiomyces)
キクセラ目 (Kickxellales)
ブラシカビ (Coemansia)
キクセラ (Kickxella)
(Dipsacomyes)
(Linderina)
(Martensella)
(Martensiomyces)
(Spirodactylon)
(Spiromyces)
トリコミケス上目 (Trichomycetalia) 節足動物の消化管に寄生
ハルペラ目 (Harpellales)
(Orphella)
(Smittium)
(Zygopolaris)
ハルペラ科 (Harpellaceae)
ハルペラ (Harpella)
レゲリオミケス科 (Legeriomycetaceae)
レゲリオミケス (Legeriomyces)
?アセラリア目 (Asellariales)
アセラリア (Asellaria)
トリモチカビ亜門 (Zoopagomycotina)
トリモチカビ目 (Zoopagales) 動物・原生動物に寄生
(Amoebophilus)
エダカビ (Piptocephalis)
(Rhopalomyces)
(Sigmoideomyces)
(Stylopage)
トリモチカビ (Zoopage)
バシディオボルス目 (Basidiobolales) フクロカビを含める
バシディオボルス科 (Basidiobolaceae)
バシディオボルス (Basidiobolus)
ハエカビ亜門 (Entomophthoromycotina)
ハエカビ綱 (Entomophthoromycetes) 無脊椎動物・原生動物に寄生
ハエカビ目 (Entomophthorales)
ハエカビ科 (Entomophthoraceae)
コニデォボルス (Conidiobolus)
(Completoria)
ハエカビ (Entomophthora)
(Meristacrum)
(Neozygites)
ケカビ門 (Mucoromycota)
ケカビ綱 (Mucoromycetes) ［ケカビ目＋アズキケカビ目｝
ケカビ目 (Mucorales)
(Phycomycetaceae)
(Phycomyces)
(Spinellus)
(Pilobolaceae)
(Pilaria)
(Pilobolus)
(Utharomyces)
(Syncephalastraceae)
(Dichotomocladium)
(Fennellomyces)
(Mycocladus)
(Phascolomyces)
(Protomycocladus)
(Syncephalestrum)
(Thamnostylum)
(Zychaea)
(Thamnidium)
クスダマカビ科 (Cuninghamellaceae)
クスダマカビ (Cunninghamella)
クサレケカビ下目 (Mortierellales)
クサレケカビ (Mortierella)
ギルベルテラ科 (Gilbertellaceae)
ギルベルテラ (Gilberetella)
コウガイケカビ科 (Choanephoraceae)
コウガイケカビ (Choanephora)
(Chaetocladium)
ケカビ下目
ケカビ科 (Mucoraceae)
ケカビ (Mucor)
クモノスカビ (Rhizopus)
アズキケカビ目 (Endogonales)
アズキケカビ科 (Endogonaceae)
アズキケカビ (Endogone)
(Densospora)
(Pteridiospora)
(Sclerogone)
(Youngiomyces)
新菌類 ［グロムス菌門＋二核菌下界］
グロムス菌門 (Glomeromycota)
グロムス綱 (Glomomycetes)
パラグロムス目 (Paraglomerales)
パラグロムス (Paraglomus)
アルカエオスポラ目 (Archaeosporales)
アルカエオスポラ科 (Archaeosporaceae)
アルカエオスポラ (Archaeospora)
ゲオシフォン科 (Geosiphonaceae) シアノバクテリアが細胞内共生
ゲオシフォン (Geosiphon)
ディベルシスポラ目 (Diversisporales)
ディベルシスポラ科 (Diversisporaceae)
ディベルシスポラ (Diversispora)
ギガスポラ科 (Gigasporaceae)
ギガスポラ (Gigaspora)
スクテロスポラ (Scutellospora)
アカウロスポラ科 (Acaulosporaceae)
アカウロスポラ (Acaulospora)
エントロフォスポラ (Entrophospora)
パシスポラ科 (Pacisporaceae)
パシスポラ (Pacispora)
グロムス目 (Glomerales)
グロムス科 (Glomeraceae)
グロムス (Glomus)
二核菌下界 (Dikarya) ［子嚢菌門＋担子菌門］（狭義）新菌類
子嚢菌門 (Ascomycota) 子嚢を持つ ［タフリナ菌亜門＋｛サッカロミケス亜門＋チャワンタケ亜門］
?子嚢菌門・不完全菌類 (mitosporic Ascomycota)
?(Amorphotheca)
?(Aporospora)
?(Coccotremataceae)
(Coccotrema)
?(Coniocybaceae)
?(Diehliomyces)
?(Dokmaia)
?(Flammispora)
?(Myxotrichaceae)
?(Phaeomyces)
?(Protothelenellaceae)
?(Pseudeurotiaceae)
?(Saccardoella)
?(Strigula)
?(Swampomyces)
?(Thelenellaceae)
?(Thrombiaceae)
?(Torpedospora)
?(Tromeropsis)
?(Xnthopyeniaceae)
?センニンゴケ科 (Baeomycetaceae)
センニンゴケ (Baeomyces)
(Phyllobaeis)
ヒメカンムリタケ綱 (Neolectomycetes)
ヒメカンムリタケ目 (Neolectales)
ヒメカンムリタケ (Neolecta)
タフリナ菌亜門 (Taphrinomycotina) ［タフリナ菌綱＋ヒメカンムリタケ綱＋ニューモキスティス菌綱＋シゾサッカロミケス綱］
?サイトエラ (Saitoella)
タフリナ菌綱 (Taphrinomycetes)
タフリナ菌目 (Taphrinales)
タフリナ科 (Taphrinaceae)
タフリナ (Taphrina)
プロトミケス科 (Protomycetaceae)
プロトミケス (Protomyces)
(Mixia)
(Protomycopsis)
(Taphridium)
ニューモキスティス菌綱 (Pneumocystidomycetes)
ニューモキスティス目 (Pneumocystidales)
ニューモキスティス (Pneumocystis)
シゾサッカロミケス綱 (Schizosaccharomycetes)
シゾサッカロミケス目 (Schizosaccharomycetales)
シゾサッカロミケス (Schizosaccharomyces)
サッカロミケス亜門 (Saccharomycotina)
サッカロミケス綱 (Saccharomycetes)
?ディポダスコプシス亜綱 (Dipomycetidae)
(Ascoidea)
ディポダスコプシス (Dipodascopsis)
(Dipodascus)
サッカロミコデス亜綱 (Saccharomycetidae)
?(Cyniclomyces)
?(Starmera)
?(Starmerella)
サッカロミケス目 (Saccharomycetales)
サッカロミケス科 (Saccharomycetaceae)
(Schizosaccharomycoideae)
(Schizosaccharomyces)
(Nadsonioideae)
(Nadsonia)
(Lipomycetoideae)
(Lipomyces)
サッカロミケス亜科 (Saccharomycetoideae)
サッカロミケス (Saccharomyces)
カンディダ科 (Candidaceae)
カンディダ (Candida)
エンドミケス科 (Endomycetaceae)
(Cephaloascus)
エンドミケス (Endomyces)
(Eremascus)
チャワンタケ亜門 (Pezizomycotina) ［オルビリア綱＋チャワンタケ下門］
?チャワンタケ亜門不完全菌類 (mitosporic Pezizomycotina)
?(Alysidiella)
?(Batistiaceae)
?(Phacidiella)
?(Sarcosagium)
?(Thelocarpaceae)
?ラーメア目 (Lahmiales)
?メデオライア目 (Medeolariales)
メデオライア科 (Medeolariaceae)
メデオライア (Medeolaria)
?トリブリディア目 (Triblidiales)
?ビンタマカビ目 (Coryneliales)
ビンタマカビ科 (Coryneliaceae)
(Caliciopsis)
ビンタマカビ (Corynelia)
(Coryneliospora)
(Lagenulopsis)
(Triposora)
ラボウルベニア綱 (Laboulbeniomycetes)
?ラボウルベニオプシス (Laboulbeniopsis)
ラボウルベニア目 (Laboulbeniales)
(Herpomycetaceae)
(Herpomyces)
ラボウルベニア亜目 (Laboulbeniineae)
(Euceratomycetaceae)
(Colonomyces)
(Euceratomyces)
(Euzodiomyces)
(Ceratomycetaceae)
(Tettigomycetoideae)
(Tettigomyces)
(Ceratomycetoideae)
(Ceratomyces)
ラボウルベニア科 (Laboulbeniaceae)
ラボウルベニア (Laboulbenia)
(Misgomyces)
ピクシディオフォラ目 (Pyxidiophorales)
ピクシディオフォラ科 (Pyxidiophoraceae)
ピクシディオフォラ (Pyxidiophora)
オルビリア綱 (Orbiliomycetes)
オルビリア目 (Orbiliales)
オルビリア科 (Orbiliaceae)
オルビリア (Orbilia)
(Hyalorbilia)
チャワンタケ下門 ［チャワンタケ綱＋ズキンタケ上綱］
チャワンタケ綱 (Pezizomycetes)
チャワンタケ目 (Pezizales) 旧Tuberales含む
(Caloscypha)
(Carbomyces)
(Glaziella)
(Karstenella)
(Rhizina)
(Discinaceae)
(Gymnohydnotrya)
(Gyromitra)
クルミタケ (Hydnotrya)
(Pseudorhizina)
クロチャワンタケ科 (Sarcosomataceae)
クロチャワンタケ (Sarcosoma)
ベニチャワンタケ科 (Sarcoscyphaceae)
(Microstoma)
(Phillopsia)
ベニチャワンタケ (Sarcoscypha)
アスコボルス科 (Ascobolaceae)
アスコボルス (Ascobolus)
(Ascodesmidaceae)
(Ascodesmis)
チャワンタケ科 (Pezizaceae)
(Hydnobolites)
(Pachyella)
チャワンタケ (Peziza)
(Sarcosphaera)
ピロネマキン科 (Pyronemataceae)
アリュウリナ (Aleurina)
(Otidea)
ピロネマ (Pyronema)
アミガサタケ科 (Morchellaceae)
(Disciotis)
(Fischerula)
(Leucangium)
アミガサタケ (Morchella)
(Verpa)
ノボリリュウタケ科 (Helvellaceae)
ツチクレタケ (Barssia)
(Cidaris)
ノボリリュウタケ (Helvella)
(Thelebolaceae)
?イモタケ科 (Terfeziaceae) 以下3科はTuberalesとされていた
?イモタケ (Terfezia)
?ジマメタケ科 (Geneaceae)
?ジマメタケ (Genea)
?ヒドノキスティス (Hydnocystis)
セイヨウショウロ科 (Tuberaceae)
セイヨウショウロ (Tuber)
?パキフロエウス (Pachyphloeus)
ズキンタケ上綱 (Leotiomyceta) ［｛ホシゴケ＋クロイボタケ群｝＋真ズキンタケ類］
ホシゴケ＋クロイボタケ群 ［ホシゴケ綱＋クロイボタケ綱］
?(Acrospermum)
?(Arthopyreniaceae)
?(Asterinaceae)
?(Cucurbitariaceae)
?(Dacampiaceae)
?(Diademaceae)
?(Didymosphaeriaceae)
?(Dothioraceae)
?(Eremomycetaceae)
?(Fenestellaceae)
?(Meliolinaceae)
?(Micropeltidaceae)
?(Mytilinidiaceae)
?(Naetrocymbaceae)
?(Planistromellaceae)
?(Schizothyrium)
?(Zopfiaceae)
?テングノメシガイ綱 (Geoglossomycetes)
テングノメシガイ科 (Geoglossaceae)
テングノメシガイ (Geoglossum)
(Tricoglossum)
(Sarcoleotia)
ホシゴケ綱 (Arthoniomycetes) 地衣類を構成する菌類
ホシゴケ目 (Arthoniales)
ホシゴケ科 (Arthoniaceae)
(Amazonomyces)
ホシゴケ (Arthonia)
(Arthothelium)
(Coniarthonia)
(Cryptothecia)
(Eremothecella)
(Gymnographoidea)
(Paradoxomyces)
(Sagenidiopsis)
(Sporostigma)
(Stirtonia)
(Chrysothricaceae)
(Byssocaulon)
(Chrysothrix)
(Melaspileaceae)
(Encephalographa)
(Melaspilea)
(Roccellaceae)
(Roccella)
...
クロイボタケ綱 (Dothideomycetes) ［クロイボタケ亜綱＋プレオスポラ亜綱］
?クロイボタケ綱・不完全菌類
?(Acidomyces)
?(Dangeardiella)
?(Didymella)
?(Fusculina)
?(Helicascus)
?(julella)
?(Leptospora)
?(Mycopepon)
?(Otthia)
?(Paraliomyces)
?(Thyridaria)
?(Tyrannosorus)
?(Tubeufiaceae)
?ボトリオスフェリア目 (Botryosphaewriales)
モジカビ目 (Hysteriales)
モジカビ科 (Hysteriaceae)
(Actidiographium)
(Farlowiella)
(Gloniella)
(Gloniopsis)
(Hysterium)
(Hysterocarina)
(Hysteroglonium)
(Hysterographium)
(Hysteropatella)
(Pseudoscypha)
パテラリア目 (Patellariales)
パテラリア科 (Patellariaceae)
パテラリア (Patellaria)
...
ヤーヌラ目 (Jahnulales)
(Aliquandostipitaceae)
(Aliquandostipite)
ヤーヌラ (Jahnula)
クロイボタケ亜綱 (Dothideomycetidae)
カプノディウム目 (Capnodiales)
(Antennulariellaceae)
(Achaetobotrys)
(Antennulariella)
カプノディウム科 (Capnodiaceae)
カプノディウム (Capnodium)
...
(Coccodiniaceae)
(Coccodinium)
(Metacapnodiaceae)
(Metacapnodium)
ミリアンギウム目 (Myriangiales)
(Elsinoaceae)
(Elsinoe)
...
ミリアンギウム科 (Myriangiaceae)
(Anhellia)
(Diplotheca)
(Eurytheca)
ミリアンギウム (Myriangium)
クロイボタケ目 (Dothideales)
(Dacampiaceae)
(Dacampia)
クロイボタケ科 (Dothideaceae)
クロイボタケ (Dothidea)
グィグナルディア (Guignardia)
?コタマカビ科 (Mycosphaerellaceae)
コタマカビ (Mycosphaerella)
ケルコスポラ (Cercospora)
(Pseudosphaeriaceae)
(Dothioraceae)
(Dothiora)
(Euantennariaceae)
プレオスポラ亜綱 (Pleosporomycetidae)
プレオスポラ目 (Pleosporales)
プレオスポラ科 (Pleosporaceae)
プレオスポラ (Pleospora)
コクリオボルス (Cochliobolus) Gymnoascus
レプトスファエリア科 (Leptosphaeriaceae)
レプトスファエリア (Leptosphaeria)
(Setosphaeria)
ヴェントゥリア科 (Venturiaceae)
ヴェントゥリア (Venturia)
(Pyrenophoraceae)
(Phaeosphaeriaceae)
(Mesnieraceae)
(Massarinaceae)
(Arthopyreniaceae)
(Pleomassariaceae)
(Cucurbitariaceae)
(Phaeotrichaceae)
(Dimeriaceae)
(Micropeltidaceae)
(Munkiellaceae)
真ズキンタケ類 ［（広義）ウメノキゴケ類＋（広義）ズキンタケ類］
（広義）ウメノキゴケ類 ［リキナ菌綱＋｛ケートチリウム綱＋ユーロティウム綱＋ウメノキゴケ綱｝］
リキナ菌綱 (Lichinomycetes)
リキナ目 (Lichinales)
(Gloeoheppiaceae)
(Gloeoheppia)
(Gudelia)
(Pseudopeltula)
(Heppiaceae)
(Heppia)
リキナ科 (Lichinaceae)
リキナ (Lichina)
ペルトゥラ科 (Peltulaceae)
ペルトゥラ (Peltula)
ケートチリウム菌綱 (Chaetothyriomyceties)
?(Rhynchostomataceae)
ケートチリウム目 (Chaetothyriales)
ケートチリウム (Chaetothyrium)
サネゴケ目 (Pyrenulales) クロイボタケ綱?
アナイボゴケ目（アナツブゴケ目） (Verrucariales)
アナイボゴケ（アナツブゴケ） (Verrucaria)
ユーロティウム綱 (Eurotiomycetes) ［ユーロティウム亜綱＋クギゴケ菌亜綱］
?(Calyptrozyma)
?クギゴケ目 (Mycocaliciales)
ビンゴケ (Calicium)
ヌカゴケ (Coniocybe)
ユーロティウム亜綱 (Eurotiomycetidae)
(Arachnomycetales)
(Ascosphaerales)
ユーロティウム目 (Eurotiales)
マユハキタケ科 (Trichocomaceae)
マユハキタケ (Trichocoma)
カキノミタケ (Eupenicillium) ペニシリン
エダウチホコリタケモドキ科 (Dendrosphaeraceae)
エダウチホコリタケモドキ (Dendrosphaera)
コウボウフデ (Pseudotulostoma) 日本 従来は担子菌と誤分類
アスペルギルス (Aspergillus)
ユーロティウム (Eurotium)
ホネタケ(骨茸)目 (Onygenales)
ギムノアスクス科 (Gymnoascaceae)
(Emmonsiella)
ギムノアスクス (Gymnoascus)
アルトロデルマ科 (Arthrodermataceae)
アルトロデルマ (Arthroderma)
トリコフィトン (Trichophyton)
ホネタケ科 (Onygenaceae)
ホネタケ (Onygena)
ウメノキゴケ綱（チャシブゴケ綱） (Lecanoromycetes)
?ロウソクゴケ目 (Candelariales)
?(Timdalia)
?(Brigantiaeaceae)
?(Elixiaceae)
?(Fuscideaceae)
?(Phlyctidaceae)
?イワタケ科 (Umbilicariaceae)
?(Vezdaeaceae)
ホウネンゴケ菌亜綱 (Acarosporomycetidae)
ホウネンゴケ目 (Acarosporales)
(Acarospora)
ウメノキゴケ亜綱 (Lecanoromycetidae)
?(Elixiaceae)
?(Furcaspora)
?(Fuscideacae)
?(Phlyctidaceae)
ウメノキゴケ目（チャシブゴケ目） (Lecanorales)
(Usnea)
ウメノキゴケ（チャシブゴケ） (Lecanora)
ツメゴケ目 (Peltigerales)
(Collematineae)
(Peltigerineae)
ツメゴケ (Peltigera)
ダイダイキノリ目 (Teloschistales)
(Letrouitiaceae)
(Letrouitia)
ダイダイキノリ科 (Teloschistaceae)
ダイダイキノリ (Teloschistes)
オオロウソクゴケ (Xanthoria)
...
ビンタケ亜綱 (Ostropomycetidae)
ビンタケ下綱
?(Arctomiaceae)
?(Hymeneliaceae)
アギリウム目 (Agyriales)
(Gyalectales)
(Pertusariales)
(Trichotheliales)
ビンタケ目 (Ostropales)
ビンタケ (Ostropa)
(Stictis)
トリハダゴケ目 (Pertusariales)
（広義）ズキンタケ類 ［ズキンタケ綱＋フンタマカビ綱］
ズキンタケ綱 (Leotiomycetes)
?ズキンタケ綱不完全菌類 (mitosporic Leotiomycetes)
?(Darkera)
リティスマ目 (Rhytismatales)
リスティマ科 (Rhytismataceae)
(Hypodermella)
(Lophodermella)
(Lophodermium)
(Lophomerum)
(Ceratophacidieae)
(Hypodermateae)
(Hypoderma)
ココミケス族 (Coccomyceteae)
ココミケス (Coccomyces)
リティスマ族 (Rhytismateae)
リティスマ (Rhytisma)
(Cryptomycetaceae)
(Cryptomyces)
(Potebniamyces)
(Pseudorhytisma)
(Phacidiaceae)
(Therrya)
(Coccophacidieae)
(Pseudophacidieae)
(Phacidieae)
(Phacidium)
ビョウタケ目 (Helotiales)
(Ascocorticiaceae)
(Hemiphacidiaceae)
ズキンタケ科 (Leotiaceae)
ズキンタケ (Leotia)
ヒナノチャワンタケ科 (Hyaloscyphaceae)
ハイイロチャワンタケ科 (Dermateaceae)
キンカクキン(菌核菌)科 (Sclerotiniaceae)
(Sclerotinia)
キッタリア目 (Cyttariales)
キッタリア科 (Cyttariaceae)
キッタリア (Cyttaria)
ウドンコカビ目 (Erysiphales)
ウドンコカビ科 (Erysiphaceae)
(Podosphaera)
(Microsphaera)
ウドンコカビ (Erysiphe)
(Sphaerotheca)
テレボルス目 (Thelebolale)
フンタマカビ綱 (Sordariomycetes) ［ボタンタケ亜綱＋フンタマカビ亜綱］
?フンタマカビ綱不完全菌類 (mitosporic Leotiomycetes)
?カロスフェリア目 (Calosphaeriales)
?メリオラ目 (Meliolales)
メリオラ科 (Meliolaceae)
メリオラ (Meliola)
?クロカワキン目 (Phyllachorales)
?トリコスフェリア目 (Trichosphaeriales)
ボタンタケ亜綱 (Hypocreomycetidae) ［ルルワーチア目＋ボタンタケ下綱］
ルルワーチア目 (Lulworthiales)
ボタンタケ下綱
コロノフォラ目 (Coronophorales)
コロノフォラ科 (Coronophoraceae)
コロノフォラ (Coronophora)
(Nitschkea)
ボタンタケ(肉座菌)目 (Hypocreales)
バッカクキン(麦角菌)科 (Clavicipitaceae)
トウチュウカソウ(冬虫夏草) (Cordyceps)
バッカクキン(麦角菌) (Claviceps)
トルビエラ (Torrubiella)
(Podonectria)
(Shimizuomyces)
コウヤムシタケモドキ (Neocordyceps)
ヨコバイタケ (Podonectrioides)
(Epichloe)
ボタンタケ科 (Hypocreaceae)
ボタンタケ(肉座菌) (Hypocrea)
(Hypomyces)
ツノタケ (Podostroma)
アカツブタケ科 (Nectriaceae)
アカツブタケ (Nectria)
(Giberella/Gibberella)
ヒポミケスキン科 (Hypomycetaceae)
ヒポミケス (Hypomyces)
メラノスポラ目 (Melanosporales)
ミクロアスクス目 (Microascales)
クワイカビ科 (Ophiostomataceae)
(Ceratocystis)
(Ophiostoma)
フンタマカビ亜綱 (Sordariomycetidae) ［フンタマカビ下綱＋クロサイワイタケ下綱］
フンタマカビ下綱
?(Apiosporaceae)
?(Catabotrydaceae)
?(Erythromada)
?(Hilminthosphaeriaceae)
?(Lasiosphaeriella)
?(Lentomitella)
?(Leptosporella)
?(Xylomelasma)
ボリニア目 (Boliniales)
カエトスフェリア目 (Chaetosphaeriales)
ディアポルテ目 (Diaporthales)
ディアポルテ科 (Diaporthaceae)
(Cryphonectria)
ヴァルサ (Valsa)
ディアポルテ (Diaporthe)
ハロスフェリア科 (Halosphaeriaceae)
ハロスフェリア (Halosphaeria)
リンドラ (Lindra)
ディアポルテ目 (Diaporthales)
コニオカエタ目 (Coniochaetales)
オフィオストマ目 (Ophiostomatales)
フンタマカビ(糞玉黴)目 (Sordariales)
フンタマカビ科 (Sordariaceae)
アカパンカビ (Neurospora)
フンタマカビ (Sordaria)
(Podospora)
(Diplogelasinospora)
(Gelasinospora)
クロサイワイタケ下綱 (Xylariomycetidae)
クロサイワイタケ(黒幸茸)目 (Xylariales)
クロサイワイタケ科 (Xylariaceae)
チャクブタケ (Daldinia)
クロサイワイタケ (Xylaria)
アカコブタケ (Hypoxylon)
ホウズキタケ (Entonaema)
マメザヤタケ (Xylaria)
ハチスタケ (Podosordaria)
カタツブタケ (Rosellinia)
(Monosporascus)
ポリスティグマ科 (Polystigmataceae)
(Glomerella)
(Polystigma)
(Coniochaetaceae)
(Phyllachoraceae)
(Diatrypaceae)
クロボキン門 (Ustilaginomycetes)
?(Entorrhizales)
?クリプトミココラクス (Cryptomycocolax)
マラッサジア目 (Malasseziales)
マラッサジア (Malassezia)
モチビョウキン綱 (Exobasidiomycetes)
?(Sporidiales)
ドアッサンジア目 (Doassansiales)
エンチロマ目 (Entylomatales)
モチビョウキン（餅病菌）目 (Exobasidiales)
モチビョウキン科 (Exobasidiaceae)
モチビョウキン (Exobasdium)
ゲオルゲフィシェリア目 (Georgefischeriales)
ミクロストラマ目 (Microstromatales)
ナマグサクロボキン目 (Tilletiales)
ナマグサクロボキン科 (Tilletiaceae)
ナマグサクロボキン (Tilletia)
クロボキン綱 (Ustilaginomycetes)
ウロシスティス目 (Urocystales)
クロボキン目 (Ustilaginales)
クロボキン科 (Ustilaginaceae)
(Sphacelotheca)
クロボキン (Ustilago)
(Urediniomycetes) 下位分類は未対応
?(Caeoma)
?(Rhodotorula)
?エリトロバシディウム (Erythrobasidium)
?(Naohideales)
?(Heterogastridiaceae)
(Heterogastridium)
(Hyalopycnis)
?ヘリコバシディウム科 (Helicobasidiaceae)
ヘリコバシディウム (Helicobasidium)
?プラチグロエラ科 (Platygloeaceae)
(Biatoropsis)
(Cystobasidium)
(Platygloea)
クラシックラ目 (Classiculales)
クラシックラ (Classicula)
ミクシア菌綱 (Mixiomycetes)
ミクシア目 (Mixiales)
アトラクティエラ目 (Atractiellales)
(Atractogloeaceae)
(Chionosphaeraceae)
(Hoehnelomycetaceae)
パクノシベ科 (Pachnocybaceae)
(Phleogenaceae)
モンバキン目 (Septobasidiales)
モンバキン科 (Septobasidiaceae)
モンバキン (Septobasidium)
(Uredinella)
アガリコスティルブム目 (Agaricostilbales)
?(Sterigmatomyces)
アガリコスティルブム科 (Agaricostilbaceae)
アガリコスティルブム (Agaricostilbum)
ミクロポトリウム菌目 (Microbotryales)
ミクロポトリウム科 (Microbotryaceae)
(Liroa)
ミクロポトリウム (Microbotryum)
(Sphacelotheca)
(Zundeliomyces)
(Ustilentylomataceae)
(Ustilentyloma)
スポリディウム目 (Sporidiales)
スポリディオボルス科 (Sporidiobolaceae)
スポリディオボルス (Sporidiobolus)
(Leucosporidium)
(Uredinales)
プクキニア科 (Pucciniaceae)
プクキニア (Puccinia)
(Tranzschelia)
(Gymnosporangium)
(Uromyces)
メランプソラ科 (Melampsoraceae)
(Phakospora)
メランプソラ (Melampsora)
(Endocronartium)
コレオスポリウム科 (Coleosporiaceae)
コレオスポリウム (Coleosporium)
...
担子菌門 (Basidiomycota) ［ハラタケ亜門］担子器を持つ
「菌糸体，一部酵母段階，担子体（胞子毎に水平分割）形成」
?担子菌門不完全菌 (mitosporic Basidiomycota)
?ワレミア菌綱 (Wallemiomycetes)
ワレミア目 (Wallemiales)
ワレミア (Wallemia)
?エントリザ菌綱 (Entorrhizomycetes)
エントリザ目 (Entorrhizales)
エントリザ (Entorrhiza)
?(Mycaurela)
ハラタケ亜門 (Agaricomycotina)
シロキクラゲ綱 (Tremellomycetes)
シストフィロバシディウム目 (Cystofilobasidiales)
フィロバシディウム目 (Filobasidiales)
(Filobasidiella)
シロキクラゲ（白木茸）目 (Tremellales)
シロキクラゲ（白木茸） (Tremella)
菌そう上綱 (Hymenomycetia)
アカキクラゲ綱 (Dacrymycetes)
アカキクラゲ（赤木茸）目 (Dacrymycetales)
アカキクラゲ（赤木茸） (Dacrymyces)
ハラタケ綱 (Agaricomycetes) ［スッポンタケ亜綱＋ハラタケ亜綱］
(Chondrogaster)
キクラゲ（木茸）目 (Auriculariales)
キクラゲ（木茸） (Auricularia)
ロウタケ目 (Sebacinales)
アンズタケ目 (Cantharellales)
アンズタケ (Cantharellus)
(Botrybasidium)
(Craterellus)
トゥラスネラ (Tulasnella)
トレキスポラ目 (Trechisporales)
シロソウメンタケ (Clavaria)
トレキスポラ (Trechispora)
(Sistotremastrum)
(Porpomyces)
スッポンタケ亜綱 (Phallomycetidae)
スッポンタケ目 (Phallales)
アカカゴタケ科 (Clathraceae)
カニノツメ (Linderia)
スッポンタケ科 (Phallaceae)
スッポンタケ (Phallus)
プロトファルス科 (Protophallaceae)
ニカワショウロ (Protubera)
(Protuberella)
シラタマタケ (Kobayasia)
ヒステランギウム目 (Hysterangiales)
ヒステランギウム科 (Hysterangiaceae)
ヒステランギウム (Hysterangium)
ハハジマアコウショウロ (Circulocolumella)
ヒメツチグリ目 (Geastrales)
ヒメツチグリ科 (Geasrtaceae)
ヒメツチグリ (Geastrum)
タマハジキタケ科 (Sphaerobolaceae)
タマハジキタケ (Sphaerobolus)
チャダイゴケ科 (Nidulariaceae)
チャダイゴケ (Cyathus)
ラッパタケ目 (Gomphales)
ハラタケ亜綱
タバコウロコタケ目 (Hymenochaetales)
コウヤクタケ目 (Corticiales)
キカイガラタケ目 (Gloeophyllales)
ベニタケ目 (Russulales)
ウロコタケ科 (Stereaceae)
ウロコタケ (Stereum)
サルノコシカケ上目
サルノコシカケ目 (Polyporales)
マンネンタケ科 (Ganodermataceae)
マンネンタケ（霊芝）(Ganoderma)
サルノコシカケ科 (Polyporaceae)
サルノコシカケ (Elfgingia)
ツリガネタケ (Fomes)
マイタケ (Grifola)
?(Lenzites)
イボタケ目 (Thelephorales)
ハラタケ下綱 (Agaricomycetidae)
ハラタケ目 (Agaricales)
シメジ科 (Tricholomataceae)
エノキタケ (Flammulina)
ヒラタケ (Pleurotus)
キシメジ (Tricholoma) マツタケを含む
ハラタケ科 (Agaricaceae)
アガリクス（ハラタケ） (Agaricus)
ヒトヨタケ科 (Coprinaceae)
ヒトヨタケ (Coprinus)
イグチ目 (Boletales)
イグチ科 (Boletaceae)
イグチ (Boletes)
イッポンシメジタケ科
ツチグリ科 (Astraeaceae)
ツチグリ (Astraeus)
ニセショウロ科 (Sclerodermataceae)
ニセショウロ (Scleroderma)
コツブタケ科 (Pisolithaceae)
コツブタケ (Pisolithus)
アテリア目 (Atheliales)
ホロゾア (Holozoa) ［偽粘菌亜界＋（広義）動物類］
偽粘菌亜界 (Mesomycetozoa) ［コラロキトリウム綱＋イクティオスポラ綱］
コラロキトリウム綱 (Corallochytrea) ［単］
コラロキトリウム (Corallochytrium) InS サンゴ礁，腐食性，球形，接合生殖，アメーバ状幼生
イクティオスポラ綱 (Ichthyosporea)
リノスポリディウム目 (Rhinosporideacae/Dermocystida)
アンフィビオシスティディウム (Amphibiocystidium)
デルモシスティディウム (Dermocystidium)
リノスポリディウム (Rhinosporidium)
(Sphaeroforma destruens)
イクティオフォヌス目 (Ichthyophonida/Ichthyophonae)
イクティオフォヌス (Ichthyophonus)
(Pseudoperkinsus)
(Psorospermium)
(Sphaeroforma arctica)
アモエビディウム類 (Amoebidiales)
アモエビディウム (Amoebidium)
パラモエビディウム (Paramoebidium)
(Anurofeca)
（広義）動物類 (Animalia/Filozoa) ［フィラステレア目＋｛襟鞭毛虫門＋後生動物亜界｝］
?カプサスポラ (Capsaspora) 襟鞭毛虫門? 真菌亜界?
フィラステレア目（ミニステリア目） (Filasterea/Ministeriida)
ミニステリア (Ministeria)
襟鞭毛虫門 (Choanozoa/Codosigobiotina) 淡水・海水 150種
「自由生活 １本の鞭毛基部を微絨毛が襟状に囲む 群体形成種あり」
襟鞭毛虫（エリヒゲムシ）綱 (Choanoflagellatea/Choanomonada) ［非ロリカ目＋アカンソエカ目］
非ロリカ目 (Craspedida)
モノシガ科 (Monosigidae/Codonosigidae) 裸細胞
コドノシガ (Codonosiga)
モノシガ (Monosiga)
コドノクラディウム (Codonocladium)
デスマレラ (Desmarella)
アストロシガ (Astrosiga)
スファエロエカ (Sphaeroeca)
プロテロスポンギア (Proterospongia)
(Stylochromonas)
カラエリヒゲムシ科 (Salpingoecidae) 細胞はさや(theca)に囲まれる
(Aulomonas)
コアノエカ (Chanoeca)
カラエリヒゲムシ (Salpingoeca)
パキソエカ (Pachysoeca)
ディプロエカ (Diploeca)
(Stelexomonas)
(Lagenoeca)
アカンソエカ目 (Acanthoecida)
アカンソエカ科 (Acanthoecidae) 細胞は籠状のロリカに被われる
(Bicosta)
(Calliacantha)
(Calotheca)
(Campyloacantha)
(Conion)
(Cosmoeca)
ディアファノエカ (Diaphanoeca)
(Crinolina)
(Crucispina)
(Acanthocorbis)
アカンソエカ (Acanthoeca)
アカントケプシス (Acanthocoepsis)
(Apheloecion)
(Kakoeca)
(Monocosta)
(Nannoeca)
(Platypleura)
(Polyfibula)
(Polyoeca)
(Saepicula)
(Saroeca)
(Savillea)
(Spiraloecion)
(Sportelloeca)
(Stephanacantha)
(Syndetophyllum)
(Diplotheca)
(Parvicorbicula)
(Pleurasiga)
(Stephanoeca)
後生動物亜界 (Metazoa) Animals ［海綿動物門＋平板動物門＋中生動物門＋真後生動物類］
注：Dunn et al. 2008 Nature 452, 745 では ［有櫛動物門＋｛海綿動物門＋刺胞動物門｝＋左右相称動物］
「多細胞（細胞間結合），異種上皮細胞間を結ぶ繊維タンパク質（コラーゲン等）構造（除く平板／中生動物），有性（卵細胞＋小型単毛精子），補食性／濾過食性」
海綿動物門 (Porifera) Sponges ［石灰海綿亜門＋石英海綿亜門] 現生9000種
「細胞壁欠，平板クリスタ，両性（アメーバ状卵子，精子を別時期に放出），接合子が遊走幼生を形成，親は着生，芽球による無性生殖，幼生の細胞分化（襟細胞，アメーバ状細胞，助食細胞），中胚葉・神経組織・デスモソーム・食細胞欠」
石灰海綿亜門 (Calcarea) CaCO3針骨，前部細胞群が後部細胞群に陥入，幼生：amphiblastula
カルキネア綱 (Calcinea)
ロイケッタ目 (Leucettida)
ロイケッタ (Leucetta)
クラトリナ目 (Clathrinida)
クラトリナ (Clathrina)
(Murrayona)
カルカロネア綱 (Calcaronea)
アミカイメン目 (Leucosolenida)
アミカイメン (Leucosolenia)
ツボカイメン目 (Sycettida)
グランチカイメン (Grantia)
?ファレトロニダ綱 (Pharetronida)
ペトロビオナ目 (Inozoa)
ペトロビオナ (Petrobiona)
ソラシア目 (Sphinctozoa)
ソラシア (Sollasia)
石英海綿亜門 (Silicispongia) ［同骨海綿綱＋普通海綿綱＋六放海綿綱］
同骨海綿綱 (Homoscleromorpha)
同骨海綿目（ノリカイメン類） (Homosclerophorida)
ノリカイメン (Oscarella)
普通海綿綱 (Demospongiae) 門の95%．幼生はparenchymellaと呼ばれる
四放海綿亜綱 (Tetractinomorpha)
有星海綿目（ホシカイメン類） (Choristida)
ホシカイメン (Stelletta)
螺旋海綿目（トウナスカイメン類） (Spirophorida)
トウナスカイメン (Tetilla)
イシカイメン目 (Lithisida)
イシカイメン (Discodermia)
硬海綿目（オオバンカイメン類） (Hadromerida)
バンカイメン (Spirastrella)
中軸海綿目 (Axinellida)
チュウジクカイメン (Axinella)
角質海綿亜綱 (Ceractinomorpha)
ヨドミカイメン (Yodomia)
網角海綿目（モクヨクカイメン類） (Dictyoceratida)
ユアミカイメン (Spongia)
樹状角質海綿目（エダカイメン類） (Dendroceratida)
サボテンカイメン (Dendrilla)
単骨海綿目（ザラカイメン類） (Haploscierida)
ヌマカイメン (Spongilla)
カワカイメン (Ephydatia)
イワカイメン目 (Petrociida)
多骨海綿目（コボネカイメン） (Poecilosclerida)
ジクカワカイメン (Biemna)
磯海綿目 (Halichondrida)
クロイソカイメン (Halichondria)
六放海綿綱 (Hexactinellidea) 幼生はparenchymellaと呼ばれる
両盤亜綱 (Amphidiscophora)
竜盤目（ホッスガイ類） (Amphidiscosa)
ホッスガイ (Hyalonema)
六放星亜綱 (Hexasterophora)
六放目（キヌアミカイメン類） (Dictyonina)
キヌアミカイメン (Farrea)
カイロウドウケツ目 (Lyssacina)
カイロウドウケツ (Euplectella)
アウロキスティス目 (Lycniscosa)
アウロキスティス (Aulocystis)
? 硬骨海綿綱 (Sclerospongiae)
アストロスクレラ目 (Astrosclerida)
アストロスクレラ (Astrosclera)
ケラトポレラ目 (Ceratoporellida)
ケラトポレラ (Ceratoporella)
床板海綿目 (Tabulospongida)
アカントカエテテス (Acanthochaetetes)
板形動物門 (Placozoa) （平板動物類）［単?］
「2層上皮細胞＋中層」
?(treptoplax)
センモウヒラムシ (Trichoplax adhaerans)
中生動物門 (Mesozoa) ［菱形動物綱＋直泳動物綱］前口動物? 寄生：神経系と腸を喪失
菱形動物綱 (Dicyemida) 現生3科8属90種 頭足類に寄生 細胞数43個
二胚虫科 (Dicyemidae)
ニハイチュウ (Dicyema)
(Pseudicyema)
(Dicyemennea)
コノキエマ科 (Heterocyemidae)
コノキエマ (Conocyema)
ミクロキエマ (Microcyema)
カンタレラ科 (Kantharellidae)
直泳動物綱 (Orthonectida) 現生2科5属20種 渦虫等に寄生
ロパルラ科 (Rhopaluridae)
キリオキンクタ (Ciliocincta) 日本近海
(Intoshia)
ロパルラ (Rhopalura) ［多］
ストエカルトルム (Stoecharthrum)
ペルマトスファエラ科 (Pelmatosphaeridae)
ペルマトスファエラ (Pelmatosphaera)
真後生動物類 (Eumetazoa) ［有櫛動物門＋刺胞動物門＋左右相称動物下界］Animalia sense Adl et al. 2005
注：Dunn et al. 2008 Nature 452, 745 では ［有櫛動物門＋｛海綿動物門＋刺胞動物門｝＋左右相称動物］
有櫛動物門 (Ctenophora) クシクラゲ類，デヴォン紀より，現生150種
有触手綱 (Tentaculata)
フウセンクラゲ目 (Cydippida)
カブトクラゲ目 (Lobata)
カブトクラゲ (Bolinopsis)
オビクラゲ目 (Cestida)
クシヒラムシ目 (Platyctenida)
ガネシャ目 (Ganeshida)
タラッソカリケ目 (Thalassocalycida)
無触手綱 (Nuda)
ウリクラゲ目 (Beroida)
ウリクラゲ (Beroe)
刺胞動物門 (Cnidaria) 現生7600種 ［メデューサ亜門＋花虫亜門］
メデデューサ亜門 (Medusozoa) ［粘液胞子虫下門＋ヒドロ虫綱＋箱虫綱＋鉢虫綱］
?粘液胞子虫下門 (Myxozoa) ［軟胞子虫綱＋粘液胞子虫綱］ 寄生で数個の細胞のみに退化 シスト形成 現生1000種 左右相称動物? Lom & Dykova 2006, Folia Parasitologica 53, 1
「卵形世代の胞子がイトミミズに感染し錨型世代に成長し，その胞子が魚に感染し卵形世代となる．放線胞子虫綱 (Actinosporea)は錨型世代を別動物と誤認したもの」
軟胞子虫綱 (Malacosporea) 極嚢をもつ胞子，柔らかい殻，管／袋状の栄養世代
イトクダムシ (Buddenbrockia) Orphan worm 最大の粘液胞子虫(2mm) ハネコケムシに寄生 4区画
(Tetracapsuloides) 淡水コケムシ→サケに寄生
粘液胞子虫綱 (Myxosporea) 下位分類異論多し
双殻目 (Bivalvulida)
スフェロミクサ (Sphaeromyxa)
ウナギツムガタムシ (Myxidium) ウナギ・カエルなどに寄生
フナタマホウシムシ (Sphaerospora) フナの鰓弁に寄生
ミクソボルス (Myxobolus) サケ・コイ等に寄生
多殻目 (Multivalvulida)
クドア (Kudoa) スズメダイの骨格筋に寄生
ロクノウホウシムシ (Hexacapsula)
ヒドロ虫綱 (Hydrozoa) 現生約2700種
ヒドラ (Hydra)
箱虫綱 (Cubozoa) 現生約20種
アンドンクラゲ (Carybdea)
鉢虫綱 (Scyphozoa) 鉢クラゲ類 現生約200種
ミズクラゲ (Aurelia)
花虫亜門 (Anthozoa)
花虫綱（サンゴ虫類） (Anthozoa) 現生約4700種
!ハチノスサンゴ (Favosites)
クダサンゴ (Tubipora)
ウミカラマツ (Antipathes)
左右相称動物下界 (Bilateria) ［無腸動物門＋｛旧口動物枝＋新口動物枝｝］
「ただし，［無腸動物門＋｛脊索動物門＋｛珍渦虫歩帯類＋旧口動物枝｝｝］の可能性も排除できない: CAT model by Lartillot & Philippe 2008」
?無腸動物門 (Acoelomorpha) 旧扁形動物門 海棲（自由生活／共生） 分節／体腔なし 原始的神経系
無腸目 (Acoela) ［側無腸亜目＋真無腸亜目］
側無腸亜目 (Paratomella) Ehlers 1992
(Paratomellidae)
真無腸亜目 (Euacoela) Ehlers 1992
?(Antigonaridae)
?(Antroposthiidae)
?(Diopisthoporidae)
?(Hallangiidae)
?(Hofsteniidae)
?(Myostomellidae)
?(Nadinidae)
?(Proporidae)
?(Taurididae)
(Solenofilomorphidae)
***
('Haploposthiidae I') ［側］
('Convolutidae I') ［側］
***
(Actinoposthiidae)
('Haploposthiidae II') ［側］
***
(Otocelididae)
***
(Childiidae)
(Mecynostomidae)
***
(Sagittiferidae)
('Convolutidae II') ［側］
(Anaperidae)
皮中神経目 (Nemertodermatida)
(Ascopariidae) Sterrer 1998
(Nemertodermatidae)
(Meara)
(Flagellophora)
(Nemertoderma)
旧口動物枝（前口動物類） (Protostomia) ［毛顎動物門＋螺旋動物亜枝＋脱皮動物亜枝］
?毛顎動物門 (Chaetognatha) arrow worms 現生10属130種 海中（多くは浮遊性） ?輪冠動物もしくは脱皮動物の可能性
「頭・体幹・尾」
?古毛顎動物綱 (Archisagittoidea)
?(Amiskwia) バージェス頁岩 ヒモムシ類とする説あり
毛顎動物綱 (Sagittoidea) ［膜筋目＋無膜筋目］
膜筋目 (Phragmophora) 横断筋あり
?(Krohnittellidae)
(Krohnittella)
****
エウクロニア科 (Eukrohniidae)
(Bathyspadella)
エウクロニア (Eukrohnia)
ヘテロクロニア科 (Heterokrohniidae) エウクロニア科に含有?
(Archeterokrohnia)
ヘテロクロニア (Heterokrohnia)
(Zahonya)
セノクロニア (Xenokrohnia)
****
イソヤムシ科 (Spadellidae) 旧プテロサギッタ科含む
(Paraspadella)
イソヤムシ (Spadella) ［側］ 底生
プテロサギッタ (Pterosagitta) 旧無膜筋目
無膜筋目 (Aphragmophora) 横断筋なし ただし，プテロサギッタを除く
ヤムシ科 (Sagittidae) 旧ホソヤムシ科含む
?(Caecosagitta)
?(Ferosagitta)
?(Zonosagitta)
ヤムシ亜科 (Sagittinae)
ヤムシ (Sagitta)
ホソヤムシ (Krohnitta)
(Parasagitta)
(Serratosagitta)
****
(Pseudosagitta)
****
(Aidanosagitta) ［側］
(Flaccisagitta)
(Mesosagitta)
螺旋動物亜枝（冠輪動物類） (Spiralia/Lophotrochozoa) ［｛扁形動物下枝＋苔動物上門｝＋担輪動物下枝］ 下位大分類未確定 多くが螺旋卵割をする
扁形動物下枝 (Platyzoa) ［｛扁形動物門＋腹毛動物門｝＋担顎動物門］
?スイクチムシ綱 (Myzostomida) かつて環形動物門多毛動物亜門
マトスイクチムシ (Myzostoma)
サガミスイクチムシ (Protomyzostomum)
扁形動物門 (Platyhelminthes) ［小鎖状亜門＋有棒状体亜門］ 現生2万種 3/4が寄生 下位分類異論あり
小鎖状亜門／目 (Catenulida)
(Catenulidae)
(Stenostomidae)
(Chordariidae)
(Tyrrheniellidae)
(Retronectidae)
有棒状体亜門 (Rhabditophora) ［多食綱＋卵黄皮綱＋｛多岐腸綱＋真卵黄下門］
多食綱 (Macrostomorpha) ［多食目＋単咽頭目］
多食目 (Macrostomida)
(Microstomidae)
, (Macrostomidae)
(Dolichomacrostomidae)
単咽頭目 (Haplopharyngida)
卵黄皮綱 (Lecithoepitheliata)
(Gnosonesimodae)
(Prorhychidae)
****
多岐腸綱／目 (Polycladida)
無吸盤亜目 (Acotylea)
(Hoploplana)
区 (Craspedommata)
区 (Schemmatommata)
区 (Emprosthommata)
吸盤亜目 (Cotylea)
(Pseudoceridae)
(Euryleptidae)
(Prosthiostomidae)
(Anonymidae)
(Boniniidae)
(Ditremageniidae)
(Laidlawiidae)
(Diplopharyngeatidae)
(Opisthogeniidae)
(Pericelidae)
(Chromoplanidae)
(Diphosthiidae)
真卵黄下門 (Eulectithophora) ［原順列目＋｛棒腸綱＋｛原卵黄目＋三分岐腸綱｝｝＋真皮上綱］
原順列目 (Proseriata) 順列類 (Seriata)は分子系統で否定．
****
(Unguiphora)
(Coelogynoporidae)
****
(Archimonocelididae)
(Monocelididae)
(Motoplanidae)
(Otomesostomidae)
(Otoplanidae)
?(Bothrioplanida) ［側］
棒腸類＋｛原卵黄類＋三分岐腸類｝クレード
棒腸綱 (Rhabdocoela)
棒腸目
隠吻亜目 (Kalyptorhynchia)
樽咽頭亜目 (Dalyellioida)
戴頭亜目 (Temnocephalida)
無吻亜目 ('Typhloplanoida') ［側］
'INUK clade'
(Genostomatida)
(Ichthyophaga)
(Notonteria)
(Urastomatida)
(Urastoma)
(Fecampiida)
(Kronborgia)
****
原卵黄目 (Prolectithophora)
(?Genostoma) 甲殻類に共生
(Plagiostomidae)
(Pseudostomiidae)
三岐腸目 (Tricladida) 順列類 (Seriata)は分子系統で否定
海棲三岐腸亜目 (Maricola)
地下水棲三岐腸亜目 (Cavernicola) 地下水性
(Dimarcusidae)
ブラジルウズムシ (Rodox)
大陸棲三岐腸亜目 (Continenticola)
プラナリア上科 (Planarioidae)
プラナリア科 (Planariidae) ヒラタウズムシ科
ホソウズムシ (Phagocata)
カズメウズムシ (Polycelis)
キタカズメウズムシ (Seidlia)
オオウズムシ科 (Dendrocoelidae)
サンカクアタマウズムシ科 ('Dugesiidae') ［側］
ナミウズムシ (Dugesia)
アメリカナミウズムシ (Girardia)
陸棲三岐腸下目 ('Terricola') ［側］
(Bipaliidae)
(Rhynchodemidae)
(Geoplanidae)
新皮上綱 (Neodermata) ［単生綱＋吸虫綱＋条虫綱］寄生性
単生綱 (Monogenea)
単後吸盤目 (Monopisthocotylea)
多後吸盤目 (Polyopisthocotylea)
吸虫綱 (Trematoda) 現生9000種 内部共生
盾吸虫亜綱 (Aspidogastrea)
二生亜綱 (Digenea)
三代虫 (Gyrodactylus)
住血吸虫 (Schistosoma)
カンテツ (Fasciola)
(Brachylaimoidea)
レウコクロリディウム科 (Leucochloridiidae)
レウコクロリディウム (Leucochloridium)分類
条虫綱 (Cestoda/Cestoidea) 現生5000種 内部共生
葉片条虫亜綱 (Amphilinidea)
葉片条虫 (Amphilina)
円杯条虫亜綱 (Gyrocotylidea)
円杯条虫 (Gyrocotyle)
真正条虫亜綱 (Eucestoda)
サナダムシ（日本海裂頭条虫） (Diphyllobothrium) ケンミジンコ→サクラマス→人間・海生哺乳類
有鉤条虫 (Taenia)
矮小条虫 (Hymenolepis)
腹毛動物門 (Gastrotricha) 現生14科62属750種 0.06-3mm 海底（豊富）・淡水遺骸中 自由生活 ［帯虫目＋毛遊目］
帯虫目 (Macrodasyida) 7科32属280種 ほぼ海底棲
?(Marinellina)
?(redudasys)
(Dactylopodolidae)
(Dactylopodola)
(Dendrodasys)
(Dendropodola)
(Lepidodasyidae)
(Cephalodasys)
(Dolichodasys)
(Lepidodasys)
(Megadasys)
(Mesodasys)
(Paradasys)
(Pleurodasys)
オビムシ科 (Macrodasyidae)
(Macrodasys)
(Urodasys)
(Planodasyidae)
(Crasiella)
(Planodasys)
(Thaumastodermatidae)
(Diplodasyinae)
(Acanthodasys)
(Diplodasys)
(Thaumastodermatinae)
(Hemidasys)
(Oregodasys)
(Pseudostomella)
(Ptychostomella)
イカリトゲオビムシ (Tetranchyroderma) 日本近海等
(Thaumastoderma)
(Turbanellidae)
(Desmodasys)
(Dinodasys)
(Paraturbanella)
(Prostobuccantia)
(Pseudoturbanella)
(Turbanella)
(Xenodasyidae)
(Chordodasiopsis)
(Xenodasys)
毛遊目 (Chaetonotida) イタチムシ類 7科30属470種 ボーリングのピン形 3/4が淡水棲
(Multitubulatina)
(Neodasyidae)
(Neodasys)
(Paucitubulatina)
イタチムシ科 (Chaetonotidae)
イタチムシ亜科 (Chaetonotinae)
(Arenotus)
(Aspidiophorus)
(Caudichthydium)
カエトノトゥス (Chaetonotus) 日本近海等
(Fluxiderma)
イタチムシ (Ichthydium) 日本近海等
ハリカエトノトゥス (Halichaetonotus)
(Heterolepidoderma)
(Lepidochaetus)
ウロコイタチムシ (Lepidodermella)
(Polymerurus)
(Rhomballichthys)
(Undulinae)
(Undula)
(Dasydytidae)
(Anacanthoderma)
(Chitonodytes)
(Dasydytes)
(Haltidytes)
(Ornamentula)
(Setopus)
(Stylochaeta)
(Dichaeturidae)
(Dichaetura)
(Muselliferidae)
(Diuronotus)
(Musellifer)
(Neogosseidae)
(Kijanebalola)
(Neogossea)
(Proichthydidae)
(Proichthydioides)
(Proichthydium)
(Xenotrichulidae)
(Draculiciterinae)
(Draculiciteria)
(Xenotrichulinae)
(Heteroxenotrichula)
(Xenotrichula)
担顎動物門 (Gnathifera) ［有輪動物亜門＋顎口動物亜門＋輪虫亜門］この2門のくくりは未確定で無腸動物類＋顎口動物類の考え方もある．
有輪動物亜門 (Cycliophora) 現生1種 曲形動物に近縁？
シンビオン (Symbion) 3種 ノルウェー沖のロブスターの口器に外部寄生 0.5mm
顎口動物亜門 (Gnathostomulida) jaw worms 現生12科22属100種 0.5-1mm 扁形動物門? 冠輪動物? Axが1956年に記載 海底堆積物下部に生息
糸精子目 (Filospermoidea)
ハプログナティア科 (Haplognathiidae)
ハプログナティア (Haplognathia)
(Pterognathiidae)
(Cosmognathia)
(Pterognathia)
曩腔目 (Bursovaginoidea)
(Conophoralia)
(Austrognathiidae)
(Austrognatharia)
(Austrognathia)
(Triplignathia)
(Scleroperalia)
アグナティエラ科 (Agnathiellidae)
アグナティエラ (Agnathiella)
(Paragnathiella)
(Clausognathiidae)
(Clausognathia)
(Gnathostomariidae)
(Gnathostomaria)
グナトストムラ科 (Gnathostomulidae)
グナトストムラ (Gnathostomula)
(Mesognathariidae)
(Labidognathia)
(Mesognatharia)
(Tenuignathia)
(Onychognathiidae)
(Goannagnathia)
(Nanognathia)
(Onychognathia)
(Valvognathia)
(Vampyrognathia)
(Paucidentulidae)
(Paucidentula)
(Problognathiidae)
(Problognathia)
(Rastrognathiidae)
(rastrognathia)
輪虫亜門（輪形動物類） (Syndermata) 現生3000種 ［微顎虫下門＋｛鉤頭動物綱＋輪虫上綱｝］ 下位分類流動的［｛鉤頭動物綱＋ヒルガタワムシ綱｝＋単生殖巣綱］の説もあり
「鉤頭動物以外0.5mm以下」
微顎虫下門 (Micrognathozoa) ［単］
リムノグナティア (Limnognathia maerski) 北大西洋 4-14um
****
鉤頭動物綱 (Acanthocephaia) 現生1000種 脊椎動物の腸に寄生 1mm〜1m
原鉤頭虫亜綱 (Archiacanthocephala)
大鉤頭虫目 (Oligacanthorhynchida) 終宿主: 鳥・哺乳類
ダイコウトウチュウ (Macraacanthorhynchus)
ギガントリンクス目 (Gigantorhynchida)
ギガントリンクス (Gigantorhynchus)
鎖状鉤頭虫目 (Moniliformida)
モニリフォルミス (Moniliformis)
アポロリンクス目 (Apororhynchida)
アポロリンクス (Apororhynchus)
古鉤頭虫亜綱 (Palaeacanthocephala) 終宿主: 脊椎動物全般
鉤頭虫目 (Echinorhynchida)
コリノソマ (Corynosoma) 甲殻類→魚類→鰭脚類
カツオコウトウチュウ (Rhadinorhynchus)
ポリモルフス目 (Polymorphida)
タマミコウトウチュウ (Bolbosoma)
ポリモルフス (Polumorphus)
始鉤頭虫亜綱 (Eoacanthocephala) 終宿主: 魚類・カメ類
クアドリギルス目 (Gyracanthoceohala)
クアドリギルス (Quadrigyrus)
新鉤頭虫目 (Neoechinorhynchida)
ミガルシンコウトウチュウ (Neoechinorhynchus)
輪虫上綱 (Rotifera) ［ウミヒルガタワムシ綱＋ヒルガタワムシ綱＋単生殖巣綱］
ウミヒルガタワムシ綱 (Seisonidea) 2種
ウミヒルガタワムシ目 (Seisonida)
ウミヒルガタワムシ科 (Seisonidae)
ウミヒルガタワムシ (Seison) コノハエビに寄生
ヒルガタワムシ綱 (Bdelloidea) 460種
ヒルガタワムシ目 (Bdelloida) 単為生殖 4倍体 乾燥に耐える 水平伝播遺伝子を多数保持
(Habrotrochidae)
(Habrotrocha)
(Otostephanos)
(Scepanotrocha)
(Philodinidae)
(Ceratotrocha)
(Embata)
(Macrotrachela)
(Mniobia)
(Philodina)
ヒルガタワムシ (Rotaria)
(Adinetidae)
(Adineta)
(Bradyscela)
(Philodinavidae)
(Abrochtha)
(Abrotrocha)
(Henoceros)
(Philodinavus)
単生殖巣綱 (Monogononta) 1600種
ワムシ目 (Ploimida)
ツボワムシ (Brachionus)
ハオリワムシ (Euchlanis)
フクロワムシ (Asplanchna)
マルサヤワムシ目 (Flosculariida)
マルサヤワムシ (Floscularia)
テマリワムシ (Conochilus)
ハナビワムシ目 (Collothecida)
(Collotheca)
苔動物上門 (Bryozoa/Polyzoa) ［外肛動物門（＋内肛動物門 の説:C-S）］
外肛動物門 (Ectoprocta/Bryozoa) Moss animals 現生6千種，化石1.6万種? ［掩喉綱＋狭喉綱＋裸喉綱］ Fuchs et al. 2009, Mol. Phylogenet. Evol. 52 225.
「微小ポリプ(zooids)が群体形成，触手冠（外に肛門），石灰質外骨格 」
掩喉綱 (Phylactolaemata/Lophopoda) 三畳紀〜現在 現生80種 淡水棲
?(Hyalinella) 粘液胞子虫のBuddenbrockiaが寄生
ハネコケムシ目 (Plumatellida)
(Lophopodidae)
(Asajirella)
(Lophopus)
***
カンテンコケムシ科 (Pectinatellidae)
カンテンコケムシ (Pectinatella)
(Cristatellidae)
(Cristatella)
(Fredericellidae)
(Fredericella)
ハネコケムシ科 (Plumatellidae)
ハネコケムシ (Plumatella) 粘液胞子虫のBuddenbrockiaが寄生
(Gelatinrlla)
狭喉綱 (Stenolaemata) オルドヴィス紀前期〜現在 現生700種 海棲 石灰管ポリプ
!ファヴォシテラ目 (Cystoporata) 〜ペルム紀
!変口目（ハロポラ類） (Trepostomata) 〜ペルム紀
!隠口目（ラプドメソン類） (Cryptostomata) 〜ペルム紀
!アルキメデス目 (Fenestrata) 〜ペルム紀
管口目（クダコケムシ類） (Cyclostomata/Tubuliporata)
ヒゲコケムシ科 (Crisiidae)
(Crisidia)
ヒゲコケムシ (Crisia)
***
(Diplosolen)
****
(Disporella)
(Lichenopora)
(Plagioecia)
裸喉綱 (Gymnolaemata) オルドヴィス紀前期〜現在 現生5000種 主に海棲 ［櫛口目＋唇口目］
**
(Vesiculariidae) 旧櫛口目
(Bowerbankia)
(Hippothoidae) 旧唇口目 (Ascophora)
(Celleporella)
(Securiflustra) 旧唇口目 (Anasca:Flustrellidridae)
****
('Alcyonidium gelatinosum')
櫛口目（フクロコケムシ類） (Ctenostomata)
?チャミドロコケムシ (Paludicella)
('Alcyonidium mamillatum')
(Flustrellidridae)
(Flustrellidra)
(Triticellidae)
(Triticella)
唇口目（フサコケムシ類） (Cheilostomata)
(bicellariellidae)
(Bicellariella)
(Anasca)
****
(Membraniporidae)
ヒラハコケムシ (Membranipora)
(Electridae)
(Electra)
**
(Flustridae)
(Flustra)
****
(Bugulidae)
フサコケムシ (Bugula)
(Candidae)
(Scrupocellaria)
(Ascophora)
(Escharellidae)
(Escharella)
(Phidoloporidae)
(Reteporella)
(Schizoporellidae)
(Schizomavella)
(Cryptosulidae)
(Cryptosula)
担輪動物下枝 (Trochozoa) ［内肛動物門＋｛腕／紐型動物類＋環形動物門｝＋軟体動物門｝｝｝］ Dunn et al. 2008 異論あり
?!ヒオリテス門 (Hyolitha) 軟体動物門? カンブリア紀〜ペルム紀 円錐石灰殻 底生
?内肛動物亜門 (Entoprocta) 現生4科14属150種
（曲形動物門 (Kamptozoa) ［内肛動物亜門（の他，有輪動物亜門を加える説:C-S）］）
?!(Dinomishcus) カナダ カンブリア紀後期 バージェス動物群
スズコケムシ科 (Barenrsiidae) 群生
スズコケムシ (Barentsia)
(Coriella)
(Pedicellinopsis)
(Pseudopedicellina)
ミズウドンゲ (Urnatella) 淡水性
ペディケリナ科 (Pedicellinidae) 群生
(Chitaspis)
(Loxosomatoides)
(Myosoma)
ペディケリナ (Pedicellina)
ロクソカリプス科 (Loxokalypodidae)
ロクソカリプス (Loxokalypus)
ロクソソーマ科 (Loxosomatidae) 単独生活
ロクソコア (Loxocore)
ロクソミトラ (Loxomitra)
ロクソソーマ (Loxosoma)
ロクソソメラ (Loxosomella)
ロクソソーマスピロン (Loxosomespilon)
腕／紐型動物類 (Brachiozoa/Nemertea) ［腕足動物門＋箒虫動物門＋紐形動物門］ Clade A of Dunn et al. 2008
腕足動物門 (Brachiopoda) Lamp shells カンブリア紀〜現在 現生350種，化石3万種 ［舌殻亜門＋頭殻亜門＋嘴殻亜門］
舌殻亜門 (Linguliformea)
!?(Mickwitziidae)
!パテリナ綱 (Paterinata) カンブリア紀前期〜オルドヴィス紀後期
!パテリナ目 (Paterinida)
!パテリナ科 (Paterinidae)
!(Cryptotretidae)
!(Tianzhushanellidae)
舌殻綱 (Lingulata)
!(Siphonotretidae) カンブリア紀中期〜オルドヴィス紀後期
舌殻目（シャミセンガイ類） (Lingulida) カンブリア紀前期〜現在
シャミセンガイ上科 (Linguloidea)
!?(Rowellella)
!(Pseudolingulidae)
シャミセンガイ科 (Lingulidae)
シャミセンガイ (Lingula)
(Glottidia)
(Lingularia)
(Credolingula)
!(Semilingula)
!オボルス科 (Obolidae) カンブリア紀前期〜石炭紀前期
!(Obolus)
!(Eoobolidae)
!(Zhanatellidae)
!(Elkaniidae)
!(Aulonotretidae)
!(Lingulellotretidae)
!(Lingulasmatidae)
!(Paterulidae)
!(Dysoristidae)
(Discinoidea) オルドヴィス紀後期〜現在
(Discinacea)
(Discinidae)
(Discina)
(Discinisca)
(Discradisca)
(Pelagodiscus)
!(Acrotheloidea) カンブリア紀前期〜オルドヴィス紀前期
!(Acrothelidae)
!(Botsfordiidae)
(Acrotretida) カンブリア紀前期〜オルドヴィス紀後期
!Acrotretidae
!Scaphelasmatidae
!Torynelasmatidae
!Ephippelasmatidae
!Biernatiidae
!(Eoconulidae)
!Curticiidae)
頭殻亜門 (Craniiformea)
頭殻綱 (Craniata) カンブリア紀中期〜現在
!(Craniopsida)カンブリア紀中期〜石炭紀前期
!(Craniopsidae)
頭殻亜目 (Craniida) オルドヴィス紀後期〜現在
(Cranioidea)
イカリチョウチンガイ科 (Craniidae)
(Acanthocrania)
(Crania)
イカリチョウチンガイ (Craniscus)
(Novocrania)
(Philhedra)
(Valdiviathyris)
(Neoancistrocrania)
!(Trimerellida) オルドヴィス紀前期〜シルル紀後期
!(Trimerellidae)
!(Adensuidae)
!(Ussuniidae)
嘴殻亜門（有関節類） (Rhynchonelliformea/Articulata) カンブリア紀前期〜現在
!(Chileata) カンブリア紀前期〜ペルム紀後期
!(Chileida)
!(Eichwaldioidea)
!オボレラ綱 (Obolellata) カンブリア紀前期・中期
!オボレラ目 (Obolellida)
!(Naukatida)
!(Kutorginata) カンブリア紀前期・中期
!(Kutorgnida)
!(Kutorginoidea)
!(Nisusioidea)
!ストロフォメナ綱 (Strophomenata) カンブリア紀中期〜三畳紀後期
!ストロフォメナ目 (Strophomenida)
!(Strophomenoidea)
!(Plectambonitoidea)
!(Productida)
!(Chonetidina)
!(Chonetoidea)
!(Chonetidae)
!(Archeochonetes)
!(Productidina)
!(Productellidae)
!(Productininae)
!?(Haydenoides)
!(Chonetella)
!(Marginiferinae)
!(Marginifera)
!(Spinomarginifera)
!(Retimarginifera)
!(Jinomarginifera)
!(Overtoniinae)
!(Echinauris)
!(Incisius)
!(Dictyoclostinae)
!(Stereochia)
!(Strophalosiidina)
!(Strophalosioidea)
!(Aulostegoidea)
!(Richthofenioidea)
!(Lyttoniidina)
!(Lyttonioidea)
!(Permianelloidea)
!(Orthotetida)
!(Orthotetidina)
!(Orthotetoidea)
!(Chilidiopsoidea)
!(Triplesiidina)
!(Billingsellida)
!(Billingsellidina)
!(Clitambonitidina) オルドヴィス紀
!(Clitambonitoidea)
!(Polytoechioidea)
嘴殻綱 (Rhynchonellata) 2つの殻が蝶番で連結
!(Protorthida)
!(Protorthoidea)
!(Skenidoidea)
!オルチス目 (Orthida) カンブリア紀前期〜ペルム紀後期
!ベティア (Bethia) シルル紀前期 英 Herefordshire 柔組織保存
!(Orthodina) カンブリア紀前期〜デヴォン紀前期
!(Orthoidea)
!(Plectorthoidea)
!(Dalmanellidina) カンブリア紀前期〜シルル紀後期
!(Dalmanelloidea)
!(Enteletoidea)
!ペンタメルス目 (Pentamerida) カンブリア紀中期〜デヴォン紀後期
!(Syntrophiidina)
!(Pentameridina)
嘴角目（クチバシチョウチン類） (Rhynchonellida) オルドヴィス紀前期〜現在
!(Ancistrorhynchoidea)
!(Rhynchotrematoidea)
!(Uncinuloidea)
!(Camarotoechioidea)
(Pugnacoidea) デヴォン紀前期〜現在
!(Pugnacidae)
!(Plectorhynchellidae)
!(Ladogiidae)
!(Rozmanariidae)
!(Aseptirhynchiidae)
!(Petasmariidae)
!(Camarophorinidae)
!(Yunnanellidae)
!(Paranorellidae)
テリチョウチンガイ科 (Basiliolidae)
?(Striarina)
(Acanthobasiliolinae)
(Acanthobasiliola)
(Basiliolinae)
(Basiliola)
(Basiliolella)
(Eohemithiris)
(Rhytirhynchia)
!(Erymnariidae)
!(Stenoscismatoidea) デヴォン紀後期〜ペルム紀後期
!(Lambdarinoidea) ペルム紀後期〜石炭紀後期
!(Rhynchoporoidea) 石炭紀前期〜ペルム紀後期
(Dimerelloidea) デヴォン紀後期〜現在
!(Dimerellidae)
!(Pergrinellidae)
?(Cryptoporidae)
(Aulites)
(Cryptopora)
!(Rhynchotetradoidea) デヴォン紀後期〜ジュラ紀中期
!(Wellerelloidea) 石炭紀前期〜ジュラ紀前期
(Norelloidea) ジュラ紀前期〜現在
!(Norellidae)
?!(Ochotorhynchiidae)
フリエレイア科 (Frieleiidae)
(Freileiinae)
(Frieleia)
(Compsothyris)
(Grammetaria)
(Sphenarina)
(Hispanirhynchiinae)
(Abyssorhynchia)
(Hispanirhynchia)
(Manithyris)
(Parasphenarina)
(Neorhynchiinae)
(Neorhynchia)
(Tethyrhynchiidae)
(Tethyrhynchia)
クチバシチョウチンガイ上科 (Hemithiridoidea) ジュラ紀中期〜現在
クチバシチョウチンガイ科 (Hemithyrididae)
(Hemithiris)
(Pemphixina)
!(Cyclothyrididae)
?!(Triasorhynchiidae)
!(Tetrarhynchiidae)
(Notosariidae) ジュラ紀前期〜現在
(Notosaria)
?(Septirhynchiidae)
!アトリパ目 (Atrypida) オルドヴィス紀後期〜ジュラ紀前期
!(Atrypidina)
!(Anazygidina)
!(Davidsoniidina)
!(Lissatrypidina)
!スピリフェル目 (Spiriferida) デヴォン紀前期〜ジュラ紀前期
!(Delthyridina)
!(Spiriferidina)
穿殻目（ホウズキガイ類） (Terebratulida) デヴォン紀前期〜現在
(Terebratulidina)
カンケロチリス科 (Cancellothyrididae)
(Chlidonophoridae)
(Cnismatocentridae)
(Dyscoliidae)
テレブラトゥラ科 (Terebratulidae)
(Terebratellidina)
ダリナ科 (Dallinidae)
(Kraussinidae)
ラクエウス科 (Laqueidae)
(Megathyrididae)
プラティディア科 (Platidiidae)
(Terebratellidae)
(Thaumatosiidae)
(Thecideida) 三畳紀後期〜現在
(Thecideidina)
!(Thecospiroidea)
(Thecideoidea)
(Thecideidae)
(Thecidellinidae)
箒虫動物門 (Phoronida) 現生2属14種
!化石種 デヴォン紀後期
ホウキムシ (Phoronis)
フォロノプシス (Phoronopsis)
紐形動物門（ヒモムシ類） (Nemertea) Ribbon worms 現生41科247属1400種 吻腔，海底 一部寄生
無針類 (Anopla) 現生610種
原始紐虫目（ホソヒモムシ類） (Archinemertea)
ホソヒモムシ (Cephalothrix)
古紐虫目（クリゲヒモムシ類） (Palaeonemertea)
クリゲヒモムシ (Tubulanus)
異紐虫目（ヒモムシ類） (Heteronemertea)
オロチヒモムシ (Cerebratulus)
有針類 (Enopla) 現生790種
針紐虫目 (Hoplonemertea)
多針亜目（オヨギヒモムシ類） (Polystyliferoidea)
ホソオヨギヒモムシ (Nectonemertes)
オトティフロネメルテス (Ototyphlonemertes)
単針亜目（ハリヒモムシ類） (Monostyliferoidea)
ヒカリヒモムシ (Emplectonema)
蛭紐虫目 (Bdellonemertea)
ヒモビル (Malacobdella)
ミミズヒモムシ (Prostoma)
環形動物門 (Annelida|Vermizoa) 現生12000種 ［星口動物亜門＋多毛動物亜門＋環帯亜門（含む，有鬚動物綱，ユムシ綱）］
星口動物亜門 (Sipunculoidea) 現生6科17属200種 ツバサゴカイに近縁?
スジホシムシ綱 (Sipunculida)
スジホシムシ目 (Sipunculiformes) 触手が口を囲む
スジホシムシ科 (Sipunculidae)
スジホシムシ (Sipunculus)
スジホシムシモドキ (Siphonosoma)
フクロホシムシ目 (Golfingiiformes) 触手は口を囲まない
フクロホシムシ科 (Golfingiidae)
フクロホシムシ (Golfingia)
マキガイホシムシ科 (Phascolionidae)
マキガイホシムシ (Phascolion)
エダホシムシ科 (Themistidae)
エダホシムシ (Themiste)
サメハダホシムシ綱 (Phascolosomatidea)
サメハダホシムシ目 (Phascolosomatiformes)
サメハダホシムシ科 (Phascolosomatidae)
サメハダホシムシ (Phascolosoma)
タテホシムシ目 (Apsidosiphoniformes)
タテホシムシ科 (Aspidosiphonidae)
タテホシムシ (Aspidosiphon)
多毛動物亜門 (Polychaeta) Segmented worms 現生8500種 準系統 有鬚動物・ユムシ類含む 目も不安定
サシバゴカイ目 (Phyllodocida) 31科 準系統
ピシオネ上科 (Pisionoidea)
ウロコムシ上科 (Aphroditoidea)
サシバゴカイ上科 (Phyllodocoidea)
イオスピルス上科 (Iospiloidea)
ヤムシゴカイ上科 (Typhloscolecoidea)
オヨギゴカイ上科 (Tomopteroidea)
チロリ上科 (Glyceroidea)
チロリ (Glycera)
コブゴカイ上科 (Sphaerodoroidea)
ゴカイ上科 (Nereidoidea)
ゴカイ科 (Nereididae)
フツウゴカイ (Nereis)
ゴカイ (Neanthes)
イトメ (Tylorhynchus) 生殖群泳
シロコガネガイ上科 (Nephtyoidea)
ユンドラシア目 (Yndolacida)
ユンドラシア科 (Yndolacidae)
ウミケムシ目 (Amphinomida) 2科
ウミケムシ科 (Amphinomidae)
ヒレアシゴカイ目 (Apintherida) 1科
ヒレアシゴカイ科 (Apintheridae)
イソメ目 (Eunicida) 10科
イソメ上科 (Eunicoidea) 8科
イソメ科 (Eunicidae)
イソメ (Eunice) オニイソメは1mに
タイヘイヨウパロロ (Palola) 生殖群泳
ギボシイソメ科 (Lumbrineridae)
ノリコイソメ科 (Dorvilleidae)
サカナヤドリゴカイ上科 (Ichtyotomoidea)
サカナヤドリゴカイ科 (Ichtyotomidae)
エビヤドリゴカイ上科 (Histriobdelloidea) 寄生
エビヤドリゴカイ科 (Histriobdellidae)
ディウロドリルス目 (Diurodrilida)
ディウロドリルス科 (Diurodrilidae)
ホコサキゴカイ目 (Orbiniida)
ホコサキゴカイ科 (Orbiniidae)
クエスタ目 (Questida)
クエスタ科 (Questidae)
スピオ目 (Spionida) 8科 準系統
スピオ上科 (Spionoidea) 5科
モロテゴカイ上科 (Magelonoidea)
ツバサゴカイ上科 (Chaetopteroidea)
ツバサゴカイ (Chaetopterus)
ミズヒキゴカイ上科 (Cirratuloidea)
クテノドリルス目 (Ctenodrilida)
クテノドリルス科 (Ctenodrilidae)
クシイトゴカイ (Ctenodrilus)
パレルゴドリルス目 (Parergodrilida)
パレルゴドリルス科 (Parergodrilidae)
ギボシゴカイ目 (Psammodrilida)
ギボシゴカイ科 (Psammodrilidae)
コスラ目 (Cossurida)
コスラ科 (Cossuridae)
コスラ (Cossura)
ハボウキゴカイ目 (Flabelligerida)
ハボウキゴカイ科 (Flabelligeridae)
ウキナガムシ目 (Poeobiida)
ウキナガムシ科 (Poeobiidae)
ダルマゴカイ目 (Sternapida) ユムシ類に近縁か?
ダルマゴカイ科 (Sternapidae)
ダルマゴカイ (Sternaspis)
イトゴカイ目 (Capitellida) 4科 ユムシ動物に近縁?
イトゴカイ科 (Capitellidae)
タマシキゴカイ科 (Arenicolidae) 有鬚動物に近縁?
タマシキゴカイ (Arenicola)
タケフシゴカイ科 (Maldanidae) 有鬚動物に近縁?
ホソタケフシ (Maldane)
(Axiothella)
オフェリアゴカイ目 (Opheliida)
オフェリアゴカイ科 (Opheliidae)
ホラアナゴカイ目 (Nerillida)
ホラアナゴカイ科 (Nerillidae)
イイジマムカシゴカイ目 (Polygordiida)
イイジマムカシゴカイ目 (Polygordiidae)
フサゴカイ目 (Terebellida) 7科
フサゴカイ科 (Terebellidae)
ウミイソゴムシ科 (Pectinariidae)
カンムリゴカイ科 (Sabellariidae)
カンムリゴカイ (Sabellaria)
カザリゴカイ科 (Amphictenidae)
エラゴカイ科 (Alvinellidae)
イトエラゴカイ (Paralvinella) 熱水生態系
トリコブランクス科 (Trichobranchidae)
ラエトモネクティス科 (laetmonectidae)
ケヤリムシ目 (Sabellida) 4科
ケヤリムシ科 (Sabellidae)
カオバンギア科 (Caobangiidae)
カンザシゴカイ科 (Serpulidae)
ウズマキゴカイ科 (Spirorbidae)
有鬚（ゆうしゅ）動物綱 (Pogonophora) 現生12科25属110種 ［ヒゲムシ亜綱＋ハオリムシ亜綱）
ヒゲムシ亜綱 (Frenulata/Perviata) beard worms 10〜100cm
無鞘腎目（ヒトツヒゲムシ類） (Athecaneohria) 準系統
マシコヒゲムシ科 (Oligobrachiidae)
マシコヒゲムシ (Oligobrachia)
(Birsteinia)
(Crassibrachia)
(Nereilinum)
(Unibrachium)
ヒトツヒゲムシ科 (Siboglinidae)
ヒトツヒゲムシ (Siboglinum)
有鞘腎目（クダヒゲムシ類） (Thecanephria)
ラメリサベラ科 (Lamellisabellidae)
(Lamellisabella)
ポリブラキア科 (Polybrachiidae)
(Polybrachia)
スクレロリナム科 (Sclerolinidae)
スピロブラキア科 (Spirobrachiidae)
スピロブラキア (Spirobrachia)
ハオリムシ亜綱 (Vestimentifera/Afrenulata) tube worms 30〜200cm
「熱水生態系 キチン質生管(tube)内に赤い鰓＋管結合用の羽織状筋肉＋トロフォソーム（イオウ酸化細菌）共生，消化管消失 H2SとO2を運ぶ特殊ヘモグロビン」
軸鰓目（ラメリブラキア類） (Axonobranchia) 海底熱水孔・メタン孔
ガラパゴスハオリムシ科 (Rifriidae)
ガラパゴスハオリムシ (Riftia)
基鰓目（ハオリムシ類） (Basibranchia)
サツマハオリムシ科 (Lamellibrachiidae)
サツマハオリムシ (Lamellibrachia) 太平洋・大西洋 500m以浅
エスカルピア科 (Escarpiidae) 太平洋・大西洋 2属
エスカルピア (Escarpia)
アレイシア科 (Alaysiidae) 日本近海等
アレイシア (Alaysia)
アルコヴェスティア科 (Arcovestiidae) 西太平洋
アルコヴェスティア (Arcovestia)
テヴニア科 (Tevniidae)
テヴニア (Tevnia)
オアシシア (Oasisia)
リッジイア科 (Ridgeiidae)
リッジイア (Ridgeia)
ユムシ動物綱（ヰムシ類） (Echiura) spoon worms 現生4科37属150種 海底
キタユムシ目 (Echiuroinea)
キタユムシ科 (Echiuridae)
キタユムシ亜科 (Echiurinae)
キタユムシ (Echiurus)
ミドリユムシ亜科 (Thalassematinae)
サビネミドリユムシ (Anelassorhynchus)
ドチクチユムシ (Arhychus)
サナダユムシ (Ikeda) 吻が1.5m 日本
ユメユムシ (Ikedosoma) シアノバクテリア共生
(Lissomyema)
タテジマユムシ (Listriolobus)
スジユムシ (Ochetostoma)
コゲミドリユムシ (Thalassema) 釣餌
ボネリムシ科 (Bonelliidae) 雄は数mmで雌の体内に寄生 深海性が多い
ミヤジマボネリムシ (Acanthobonellia)
オオトゲボネリムシ (Acanthohamingia) 日本
ボネリムシ (Bonellia)
トゲナシボネリムシ (Ikedella)
(Hamingia)
オオボネリムシ (Parabonellia)
...
ユムシ目 (Xenopneusta)
ユムシ科 (Urechidae) 1属
ユムシ (Urechis) 4種 日本他 潮間帯から浅海底
アブラミミズ綱 (Archipora) 環帯を欠く 環帯亜門の姉妹群
アブラミミズ科 (Aeolosomatidae) 水生
アブラミミズ (Aeolosoma)
環帯亜門 (Clitellate) ［貧毛綱＋ヒル綱］
貧毛綱 (Oligochaeta) Earthworms 現生26科280属3000種 準系統
ナガミミズ目 (Haplotaxida)
ナガミミズ (Haplotaxis)
ツリミミズ目 (Lumbricida)
(Lumbricus)
フツウミミズ (Pheretima)
オヨギミミズ目 (Lumbriculida)
オヨギミミズ (Lumbriculus)
イトミミズ目 (Tubificida)
イトミミズ (Tubifex)
ミズミミズ (Nais)
ヒル綱 (Hirudinoidea) Leeches 現生14科140属500種
ケヒル亜綱 (Acanthobdellida) 準系統
(Acanthobdella)
ヒルミミズ亜綱 (Branchiobdellida) 準系統
ザリガニミミズ (Branchiobdella)
ヒル亜綱 (Euhirudinea) True leeches
吻蛭目（ウオビル類） (Rhynchobdellae) 3科 準系統
ヒラタビル (Glossiphonia)
無吻蛭目（ヒル類） (Arhynchobdellae) 8科
(Nephelopsis)
(Erpobdella)
ヤマビル (Haemadipsa)
(Chtonobdella)
(Macrobdella)
(Haemopis)
チスイビル (Hirudo)
軟体動物門 (Mollusca) Mollusks 現生9.3万種，化石種3.5万種 ［掘足亜門＋介殻亜門］ 下位分類不詳
!?キムベレア (Kimberella) ヴェンド紀 ロシア Nature 388, 868.
!?(Sachitida/Halkieriida) 腕動物門?
!?ハルキエリア (Halkieria) カンブリア紀中期 シリウスパセット動物群
!?ウィワクシア (Wiwaxia) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群
!ミクリナ (Micrina)
!タンヌオリナ (Tannuolina)
!マッテヴィア (Matthevia) カンブリア紀〜オルドヴィス紀 米
!チェロデス (Chelodes) カンブリア紀〜オルドヴィス紀 米
!(Acaenoplax) シルル紀 英
掘足亜門 ［掘足綱＋溝腹綱＋尾腔綱＋頭足綱］
掘足綱 (Scaphopoda) tusk shells 現生500種
ツノガイ亜綱 (Dentaliida)
(Anulidentaliidae)
(Anulidentalium)
(Epirhabdoides)
(Calliodentaliidae)
(Calliodentalium)
ツノガイ科 (Dentaliidae)
(Antalis)
(Coccodentalium)
(Compressidentalium)
ツノガイ (Dentalium)
(Eudentalium)
(Fissidentalium)
(Graptacme)
(Paradentalium)
(Pictodentalium)
(Plagioglypta)
(Schizodentalium)
(Striodentalium)
(Tesseracme)
(Fustiariidae)
(Fustiaria)
(Gadilinidae)
(Episiphon)
(Gadilina)
(Laevidentaliidae)
(Laevidentalium)
(Omniglyptidae)
(Omniglypta)
(Rhabdidae)
(Rhabdus)
(Gadilida)
ミカドツノガイ科 (Entalinidae)
ミカドツノガイ (Entalina)
(Gadilimorpha)
?(Compressidens)
?(Megaentalina)
(Gadilidae)
(Gadilinae)
(Bathycadulus)
(Cadulus)
(Gadila)
クチキレツノガイ亜科 (Siphonodentaliinae)
(Dischides)
(Polyschides)
(Sagamicadulus)
クチキレツノガイ (Siphobodentalium)
(Striocadulus)
(Pulsellidae)
(Annulipulsellum)
(Pulsellum)
(Striopulsellum)
(Wemersoniellidae)
(Chistikovia)
(Wemersoniella)
溝腹綱 (Solenogastres/Neomeniomorpha) 現生200種
フォリドスケピア目 (Folidoscepia)
ネオメニアフォルマ目 (Neomeniaforma)
サンゴノフトヒモ (Neomenia)
カセミミズ (Epimenia)
ステルロフスティア目 (Sterrofustia)
カビベロニア目 (Cavibelonia)
尾腔綱 (Caudofoveata) 現生120種
ケハダウミヒモ目 (Chaetodermatida) 現生1目3科70種
ケハダウミヒモ (Chaetoderma)
頭足綱 (Cephalopoda) 現生900種
オウムガイ亜綱 (Nautiloidea) オルドヴィス紀〜現在
オウムガイ目 (Nautiloida) 現生10種
!直角貝（直角石） (Orthoceras) オルドヴィス紀〜シルル紀
オウムガイ科 (Nautilidae) 殻：体を入れる室の奥に多くの空室：その空気量で浮力調整
オウムガイ (Nautilus)
(Allonautlis)
!アンモナイト亜綱 (Ammonoidea)
!アナルケステス目 (Anarcestida) デヴォン紀〜ペルム紀
!バクトリーテス亜目 デヴォン紀〜ペルム紀
!バクトリーテス (Bactrites)
!アゴニアタイト亜目 デヴォン紀前期
!アゴニアタイト (Agoniatites)
!アナルケステス亜目 デヴォン紀
!アナルケステス (Anarcestes)
!ゲフロケラス亜目 デヴォン紀後期
!クリメニア目 (Clymeniida) デヴォン紀後期
!クリメニア亜目 デヴォン紀後期
!クリメニア (Clymenia)
!ゴニオクリメニア亜目 デヴォン紀後期
!ゴニオクリメニア (Gonioclymenia)
!ゴニアタイト目 (Goniatitida) 石炭紀・ペルム紀
!トルノケラス亜目 石炭紀
!トルノケラス (Tornoceras)
!ゴニアタイト亜目 石炭紀・ペルム紀
!ゴニアタイト (Goniatites)
!プロレカニテス目 (Prolecanites) 石炭紀・ペルム紀
!プロレカニテス (Prolecanites)
!メドリコッティア (Medlicottia)
!ケラタイト目 (Ceratitida) 三畳紀
!ケラタイト (Ceratites)
!フィロケラス目 (Phylloceratida) 三畳紀〜白亜紀
!フィロケラス亜目 三畳紀〜白亜紀
!フィロケラス (Phylloceras)
!アンキロケラス亜目 白亜紀
!アンキロケラス (Ancyloceras)
!リトケラス目 (Lytoceratida) ジュラ紀・白亜紀
!リトケラス (Lytoceras)
!アンモナイト目 (Ammmonitida) ジュラ紀・白亜紀
!プシロケラス (Psiloceras)
!ストリゴケラス (Strigoceras)
鞘形亜綱 (Coleoidea)
!アウラコケラス目 (Aulacoceratida)
!アウラコケラス (Aulacoceras)
!矢石（ベレムナイト）目 (Belemnitida) 石炭紀〜白亜紀
!ベレムニテラ (Belemnitella)
!ベレムニテス (Belemnites)
八腕形目（タコ類） (Octopoda) ［側］
ヒゲダコ亜目 (Cirrata)
ヒゲダコ科 (Cirroteuthidae)
ジュウモンジダコ科 (Stauroteuthidae)
ジュウモンイダコ (Stauroteuthis)
メンダコ科 (Opisthoteuthidae)
メンダコ (Opisthoteuthis) 耳状のヒレ
マダコ亜目 (Incirrata)
フクロダコ科 (Bolitaenidae)
ナツメダコ (Japetella)
クラゲダコ科 (Amphitretidae)
クラゲダコ (Amphitretus)
カイダコ科 (Argonautidae) メスは貝殻を持つ
!ミズホタコブネ (Mizuhobaris) 日本
アオイガイ（タコブネ） (Argonauta) オスはメスの1/20でオスの交接腕は交接後切断される
マダコ科 (Octopodidae)
マタゾコダコ (Bathypolypus)
マダコ亜科 (Octopodinae)
マダコ (Octopus)
チヒロダコ (Benthoctopus)
ミズダコ (Paroctopus)
ヒョウモンダコ (Hapalochlaena)
アミダコ科 (Ocythoidae)タコブネ
コウモリダコ目 (Vampyromorpha)
コウモリダコ (Vampyroteuthis) 30cm 深海 触手1m 全身裏返しトゲまんじゅうに 頭部発光器
コウイカ目 (Sepiida)
コウイカ科
コウイカ (Sepia)
ダンゴイカ目 (Sepiolida)
ダンゴイカ (Sepiola)
ツツイカ目 (Teuthoidea)
ヤリイカ亜目 (Myopsida)
ヤリイカ科 (Loliginidae)
ヤリイカ (Loligo)
アオリイカ (Sepioteuthis)
(Spirulidae)
(Spirula)
アカイカ科 (Ommastrephidae)
アカイカ (Ommastrephes)
ツメイカ科 (Onychoteuthidae)
ニュウドウイカ (Moroteuthis)
スルメイカ亜目 (Oegopsida)
ホタルイカ (Watasenia)
スルメイカ (Todarodes)カイダコ科
ゴマフイカ科 (Histioteuthidae)
ゴマフイカ (Histioteuthis)
ウロコイカ科 (Lepidoteuthidae)
ウロコイカ (Lepidoteuthis)
ダイオウイカ科 (Architeuthidae)
ダイオウイカ (Architeuthis)
介殻亜門 (Conchifera) ［二枚貝綱＋多板綱＋単板綱＋腹足綱］
二枚貝綱（斧足類） (Bivalvia/Pelecypoda) 現生20000種
原鰓亜綱 (Protobranchia)
キヌダレガイ目 (Solemyoida)
キヌダレガイ (Petrasma)
クルミガイ目 (Nuculoida)
クルミガイ (Ennucula)
翼形亜綱 (Pterimorpha)
フネガイ目 (Arcoida)
フネガイ (Arca)
リュウキュウサルボウ亜科 (Anadarinae)
アカガイ (Scapharca)
リュウキュウサルボウ (Anadara)
イガイ目 (Mytiloida)
イガイ (Mytilus)
シンカイヒバリガイ () 熱水生態系
ウグイスガイ目 (Pterioida)
ウグイスガイ亜目 (Pteriina)
ウグイスガイ (Pteria)
アコヤガイ (Pinctada)
イタヤガイ亜目 (Pectinina)
イタヤガイ (Pecten)
ホタテガイ (Patinopecten)
ミノガイ目 (Limoida)
ミノガイ (Lima)
カキ目 (Ostreoida)
イタボガキ (Ostrea)
マガキ (Crassostrea)
古異歯亜綱 (Palaeoheterodonta)
サンカクガイ目 (Trigonioida)
!サンカクガイ (Trigonia) 絶滅
シンサンカクガイ (Neotrigonia)
イシガイ目 (Unionoida)
イシガイ (Unio)
カラスガイ (Cristaria)
異歯亜綱 (Heterodonta)
マルスダレガイ目（ハマグリ類） (Veneroida)
オトヒメハマグリ科
シロウリガイ (Calyptogena) 熱水生態系 消化器退化 硫化水素酸化型細菌（母系遺伝）と共生
(Arcoivesica)
アケビガイ (Akebiconcha) 相模湾・鹿島灘
マシジミ (Corbicula)
アサリ (Ruditapes)
ハマグリ (Meretrix)
オオノガイ目 (Myoida)
オオノガイ亜目 (Myoina)
オオノガイ (Mya)
ニオガイ亜目 (Pholadina)
ニオガイ (Pholas)
異靭帯亜綱 (Anomalodesmacea)
ウミタケガイモドキ目 (Pholadomyoida)
ウミタケガイモドキ (Pholadomya)
スナメガイ (Poromya)
直列上綱 (Serialia) Giribet et al. 2006, PNAS 103(20), 7723
多板綱 (Polyplacophora) Chitons カンブリア紀後期〜現在 現生1000種 articulamentumの突起
!?(Echinochiton) オルドヴィス紀
!(Multiplacophora) デヴォン紀〜ペルム紀
!ストロビレプス (Strobilepis)
!(Diadeloplax)
!(Aenigmatectus)
!(Protobalanus)
!(Hercolepas)
!ポリサコス (Polysacos) 米 Nature 429,288 (2004)
ヒラザガイ目 (Neoloricata)
!グラフロキトン (Glaphurochiton) 石炭紀
サメハダヒラザガイ亜目 (Lepidopleurina)
サメハダヒラザガイ (Lepidopleurus)
ウスヒラザガイ亜目 (Ischnochitonina)
モトヤスリヒラザガイ (Lepidozona)
ウスヒラザガイ (Ischnochiton)
ケハダヒラザガイ亜目 (Acanthochitonina)
ケハダヒラザガイ (Acanthochitona)
単板綱 (Monoplacophora) 現生31種
ネオピリナ目 (Tryblidioidea)
ネオピリナ (Neopilina)
ヴェマ (Vema)
ミクロピリナ (Micropilina)
腹足綱 (Gastropoda) 現生7万種
!ベレロフォン目 (Bellerophontida)
!ベレロフォン (Bellerophon)
!ミモスピリナ目 (Mimospirina)
始腹足亜綱 (Eogastropoda) 始祖腹足亜綱
!ユーオンファルス目 (Euomphalida)
カサガイ目１ (Patellogastropoda) カサガイ類
ユキノカサ科 (Acmaeidae)
(Patelloida)
(Collisella)
ツタノハガイ科 (Pattelloidae)
マゼランカサガイ (Nacella)
(Scutellastra)
(Cymbula)
アフリカボウシ (Helcion)
ツタノハガイ (Patella)
カサガイ (Cellana)
(Lottia)
(Nipponacmea)
直腹足亜綱 (Orthogastropoda)
!(Murchisoniina)
ネオンファルス目 (Neomphaloida) 熱水鉱床分類群
アマオブネガイ上目 (Neritaemorphi)
!(Cyrtoneritomorpha)
アマオブネ目 (Neritopsina)
アマオブネ (Nerita)
ワタゾコシロガサ目 (Cocculiniformia)
ワタゾコシロガサ (Cocculina/Pectinodonta)
古腹足目 (Vetigastropoda)
サザエ科１ (Turbinidae)
スカシガイ超科 (Fissurelloidae)
フネカサガイ科 (Lepetodrilidae)（熱水生態系）
フネカサガイ (Lepetodrilus) 熱水噴出孔
スカシガイ科 (Fissurellidae)
ミミガイ超科
ミミガイ科 (Haliotidae)
ミミガイ (Haliotis)
クロアワビ (Nordotis)
トコブシ (Sulculus)
オキナエビス科
オキナエビス (Pleurotomaria)
ベニオキナエビス (Mikadotrochus)
(Perotrochus)
ニシキウズガイ科１ (Trochidae)
ニシキウズガイ超科 (Trochoidae) （多系統）
ニシキウズガイ科２ (Trochidae)
サザエ科２ (Turbinidae)
ワタゾコシタダミ科 (Skeneidae)
ニシキウズガイ科３ (Trochidae)
ニシキウズガイ (Trochus)
ネオンファルス科 (Neomphalidae) （熱水生態系）
シンメトロンファルス (Symmetromphalus) マリアナ
カサガイ目２ (Patellogastropoda)
ツタノハガイ超科 (Pattelloidea)
ツタノハガイ科 (Patellidae)
ツタノハガイ (Patella)
アフリカボウシ (Helcion)
ユキノカサガイ科 (Patellogastropoda)
(Patelloida)
エンスイカサガイ科 (Acmaeidae)
ワタゾコシロアミガサ (Pectinodonta)
シロガサガイ科 (Lepetidae)
スゲガサ (Lepeta)
サガミシロガサ (Sagamilepeta)
原始紐舌目 (Architaenioglossa)
ヤマタニシ科 (Cyclophoridae)
ヤマタニシ (Cyclophorus)
タニシ科 (Viviparidae)
タニシ (Viviparus)
カワニナ (Semisulcospira)
吸腔目 (Sorbeoconcha)
タマビキ科 (Littoniridae)
タマビキ (Littonira)
アクキガイ科 (Muricidae)
アクキガイ (Murex)
バイ (Balylonia)
エゾバイ科 (Buccinidae)
ミクリガイ (Siphonalia)
イトカケガイ科 (Epitoniidae)
イトカケガイ (Epitonium)
異鰓上目 (Heterobranchia)
異旋目 (Heterostropha)
ミズシタダミ上科 (Valvatoidea)
クルマガイ上科 (Architectonicoidea)
ガラスツボ上科 (Rissoelloidea)
ミジンワダチガイ上科 (Omalogyroidea)
トウガタガイ上科 (Pyramidelloida)
クチキレガイ (Tiberia)
後鰓目 (Opisthobranchia) 心臓の後ろに一対の鰓 貝殻無し
無楯亜目 (Anaspidea)
アメフラシ科 (Aplysiidae)
アメフラシ (Aplysia) sea hares
頭楯亜目 (Cephalaspidea) headshield slugs
ブドウガイ科 (Haminoeidae)
ブドウガイ (Haloa)
裸殻翼足亜目 (Gymnosomata)
ハダカカメガイ (Clione) sea angels
背楯亜目 (Notaspidea) sidegill slugs
ヒトエガイ科 (Umbraculidae)
カメノコフシエラガイ科 (Pleurobranchidae)
裸鰓亜目 (Nudibranchia) nudibranchs ウミウシ類
下目 (Anthobranchia)
下目 (Cladobranchia)
嚢舌亜目 (Sacoglossa) sap-sucking slugs
ユリヤガイ科 (Juliidae)
ナギサノツユ科 (Oxynoidae)
チドリミドリガイ科 (Plakobranchidae)
ゴクラクミドリガイ科 (Elysoidea)
カンランウミウシ科 (Caliphyllidae)
ハダカモウミウシ科 (Limapontiidae)
有殻翼足亜目 (Thecosomata)
(Euthecosomata)
(Limacinoidea)
(Limacinidae)
(Cavolinioidea)
カメガイ科 (Cavoliniidae)
カメガイ (Cavolinia)
(Clioidae)
(Creseidae)
(Cuvierinidae)
(Praecuvierinidae)
(Pseudothecosomata)
(Peraclidoidea)
(Peraclididae)
(Cymbulioidea)
(Cymbuliidae)
(Desmopteridae)
有肺目 (Pulmonata) 陸生
基眼亜目 (Basommatophora)
(Acroloxoidea)
(Amphiboloidea)
(Chilinoidea)
(Glacidorboidea)
(Lymnaeoidea)
(Planorboidea)
(Siphonarioidea)
モノアラガイ (Radix)
柄眼亜目 (Systellommatophora)
(Onchidioidea)
イソアワモチ (Onchidium)
(Otinoidea)
(Rathouisioidea)
真有肺亜目 (Eupulmonata)
(Acteophila)
(Melampoidea)
(Trimusculiformes)
(Trimusculoidea)
(Stylommatophora)
(Orthurethra)
(Achatinelloidea)
(Cochlicopoidea)
(Partuloidea)
(Pupilloidea)
(Sigmurethra)
(Acavoidea)
アフリカマイマイ上科 (Achatinoidea)
アフリカマイマイ (Achatina)
(Aillyoidea)
(Arionoidea)
(Buliminoidea)
(Camaenoidea)
(Clausilioidea)
(Dyakioidea)
(Gastrodontoidea)
(Helicoidea)
(Helixarionoidea)
(Limacoidea)
(Oleacinoidea)
(Orthalicoidea)
(Plectopylidoidea)
(Polygyroidea)
(Punctoidea)
(Rhytidoidea)
(Sagdidoidera)
(Staffordioidea)
(Streptaxoidea)
(Strophocheiloidea)
(Succineacea)
オカモノアラガイ科 (Succineidae)
オカモノアラガイ (Succinea) レウコクロリディウムの中間寄主
(Trigonochlamydoidea)
(Zonitoidea)
アシヒダナメクジ (Laevicaulis)
ナメクジ (Meghimatium)
ニッポンマイマイ (Satsuma)
オナジマイマイ (Bradybaena)
脱皮動物亜枝 (Ecdysozoa) ［｛頭吻動物門＋｛線形動物門＋緩歩動物門｝｝＋汎節足動物上門｝］
頭吻動物門 (Scalidophora/Cephalorhyncha) ［｛動吻動物亜門＋鰓曵動物亜門｝＋胴甲動物亜門］
!(Ancalagon)
!(Fieldia)
!マルクエリア (Markuelia) カンブリア紀前期 湖南省 胚化石 Nature 247, 237.
”真頭吻動物類” ('Euscalidophora')
動吻動物亜門 (Kinorhyncha) mud dragons 現生10科16属160種
「海底砂泥中，頭・脛・腹（11節）
キクロラグ目 (Cyclorhagida)
コンコラグ亜目 (Conchorhagae)
(Cephalorhynchidae)
(Cephalorhyncha)
(Semnoderidae)
(Semnoderes)
(Sphenoderes)
クリプトラグ科 (Cryptorhagae)
(Cateriidae)
(Carteria)
キクロラグ亜目 (Cyclorhagae)
トゲカワムシ科 (Echinoderidae)
トゲカワムシ (Echinoderes)
(Centroderidae)
(Campyloderes)
(Centroderes)
(Condyloderes)
(Dracoderidae)
(Dracoderes)
プロトラグ亜目 (Protorhagae)
(Antygomonidae)
(Antygomonas)
(Zelinkaderidae)
(Zelinkaderes)
ホマロラグ目 (Homalorhagida)
ネオケントロフィエス科 (Neocentrophyidae)
ネオケントロフィエス (Neocentrophyes)
パラケントロフィエス (Paracentrophyes)
ピクノフィエス科 (Pycnophyidae)
ピクノフィエス (Phcnophyes) 23種
キノリンクス (Kinorhynchus)
?(Trachydermus)
鰓曵動物亜門 (Priapulida) 現生3科7属14種 化石種あり
!(Selkirkia)
!(Maotianshania)
!(Cricocosmia)
!(Palaeoscolex)
!(Ottoia)
!(Louisella)
!(Scolecofurca)
(Chaetostephanidae)
マッカベウス (Maccabeus)
プリアプルス科 (Priapulidae)
!(Priapulites)
(Acanthopriapulus)
(Halicryptus)
フタツエラヒキムシ (Priapulopsis) 日本海他
エラヒキムシ (Priapulus)
トゥービルクス科 (Tubiluchidae)
(Meiopriapulus)
トゥービルクス (Tubiluchus)
胴甲動物亜門 (Loricifera) 現生2科6属50種以上? 海底 寄生?
コウラムシ目 (Nanaloricida)
コウラムシ科 (Nanoloricidae) クチクラ板少ない
(Armorloricus)
コウラムシ (Nanaloricus)
(Phoeniciloricus)
シワコウラムシ科 (Pliciloricidae) クチクラ板多い
シワコウラムシ (Pliciloricus) 小笠原海溝他
ルギロリクス (Rugiloricus)
(Titaniloricus)
線形動物門 (Nematoida/Nemathelminthes) ［線虫亜門＋類線虫亜門］
線虫亜門 (Nematoda) Round worms 現生1.5万種
双器綱 (Adenophorea)
エノプルス亜綱 (Enoplia)
エノプルス目 (Enoplida)
イソレムス目 (Isolaimida)
モノンクス目 (Mononchida)
ドリライムス目 (Dorylaimida)
鞭虫目 (Trichocephalida)
イヌベンチュウ (Trichuris)
糸片虫目 (Mermithida)
ムスピケア目 (Muspiceida)
クロマドラ亜綱 (Chromadoria)
アレオライスム目 (Araeolaimida)
クロマドラ目 (Chromadoria)
デスモスコレックス目 (Desmoscolecida)
デスモドラ目 (Desmodorida)
モンヒステラ目 (Monhysterida)
双腺綱 (Secernentea)
桿線虫亜綱 (Rhabditia)
桿線虫目 (Rhabditida)
カンセンチュウ (Rhabditis)
カエノラブディティス (Caenorhabditis)
円虫目 (Strongylida)
エンチュウ (Strongylus)
回虫目 (Ascarida)
カイチュウ (Ascaris)
イヌカイチュウ (Toxocara)
アニサキス (Anisakis) マス→海棲哺乳類
ギョウチュウ (Enterobius)
旋尾線虫亜綱 (Spiruria)
旋尾線虫目 (Spirurida)
ガクコウチュウ (Gnathostoma)
カマラヌス目 (Camallanida)
メディナチュウ (Dracunculus)
ディプロガスタ亜綱 (Diplogasteria)
ディプロガスタ目 (Diplogasterida)
ディポロガスタ (Diplogaster)
クキセンチュウ目 (Tylenchida)
ハリセンチュウ (Tylenchus)
葉線虫目 (Aphelenchida)
ニセネグサレセンチュウ (Aphelenchus)
類線虫亜門 (Nematomorpha) gordian worms 現生3科20属250種 昆虫→水中自由生活
針金虫目 (Gordioidea)
コルドデス科 (Chordodidae)
?ベアトゴルディオヌス (Beatogordius)
?ゴルディオヌス (Gordionus)
?パラコルドデス (Parachordodes)
?パラゴルディオヌス (Paragordionus)
?(Semigordionus)
コルドデス亜科 (Chordodinae)
コルドデス (Chordodes)
(Dacochordodes)
(Euchordodes)
(Lanochordodes)
(Neochordodes)
(Noteochordodes)
(Pantachordodes)
(Pseudochordodes)
(Spinochordodes)
パラゴルディウス亜科 (Paragordiidae)
(Digordius)
パラコルディウス (Paragordius)
(Progordius)
(Pseudogordius)
ハリガネムシ科 (Gordiidae)
(Acutogordius)
ハリガネムシ (Gordius)
遊線虫目 (Nectonematoidea)
オヨギハリガネムシ科 (Nectonemidae)
オヨギハリガネムシ (Nectonema)
緩歩動物門 (Tardigrada) Water bears 現生15科92属750種以上 線形動物門?
「ただし，裂足動物超門 (Robopoda) ［有爪動物門＋｛緩歩動物門＋節足動物門｝］の説も」
異クマムシ綱 (Heterotardigrada)
フシクマムシ目 (Arthrotardigrada)
ウミクマムシ (Halechiniscus)
トゲクマムシ目 (Echiniscoidea)
ヨトゲクマムシ (Echiniscus)
?中クマムシ綱 (Mesotardigrada)
?オンセンクマムシ (Thermozodium) 戦前の長崎の公衆浴場浴槽で発見以来報告無し
真クマムシ綱 (Eutardigrada)
ヨリヅメ目（近爪類） (Parachela)
チョウメイムシ (Macrobiotus)
ハナレヅメ目 （遠爪目） (Apochela)
オニクマムシ (Milnesium)
汎節足動物上門 (Panarthropoda) ［有爪動物門＋節足動物門］かつては緩歩動物門も含めた
?!(Scleronychophora)
?!ハルキゲニア (Hallucigenia) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群 棘の生えた円盤 有爪動物?
?!ミクロディクティオン (Microdyction) カンブリア紀前期 澄江動物群 10対の円盤 有爪動物?
?!カーディオディクティオン (Cardiodictyon) カンブリア紀前期 澄江動物群
?!オニコディクティオン (Onychodictyon) カンブリア紀前期 澄江動物群
?!ムカシカギムシ目 (Protonychophora) カンブリア紀 有爪動物門?
!アイシェアイア (Aysheaia) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群 5cm カイメン食 節足動物との共通祖先?
?!(Xenusia)
!(Xenusion)
?!(Archonychophora)
?!(Luolishania)
有爪動物門（カギムシ類） (Onychophora) Velvet worms 現生50属160種 節足動物門に入れる?
真有爪目（カギムシ類）(Euonychophora)
メソペリパトゥス (Mesoperipatus)
ペリパトイデス (Peripatoides)
カギムシ科 (Peripatidae) 22〜43対の脚 赤茶色
カギムシ (Peripatus)
エオペリパトゥス (Eoperipatus)
ペリパトプシス科 (Peripatopsidae) 14〜25対の脚 青緑色
ペリパトプシス (Peripatopsis)
パラペリパトゥス (Paraperipatus)
節足動物門 (Arthropoda) ［（原始節足動物）＋Schizoramia］
!アノマロカリス科 (Anmalocarididae)
!アノマロカリス (Anomalocaris) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群
(Schizoramia) ［Fortiforceps類＋真節足動物類］
!(Fortiforceps)
!カナダプシス (Canadaspis) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群，化石多産
真節足動物類 (Euarthropoda) ［｛蛛形様類＋多足亜門｝＋汎甲殻類］
蛛形様類 (Arachnata)
!三葉虫亜門 (Trilobitomorpha)
!マルエラ (Marrella)
!レティファシス (Retifacies)
!エメラルデラ (Emeraldella)
!ヘルマティア (Helmetia) カンブリア紀中期 バージェス頁岩動物群
!ナラオイア (Naraoia) カンブリア紀 澄江／バージェス頁岩動物群
!ザンダレラ (Xandarella) カンブリア紀前期 澄江動物群
!三葉虫綱 (Trilobita) 古生代 約5000属 カルサイトの複眼
!オレネルス (Olenellus) カンブリア紀前期
!プチコパリア (Ptychoparia)
!プロエトゥス (Proetus)
!カリメネ (Calymene)
鋏角亜門 (Chelicerata) ［皆脚綱＋鋏角下門］
密節綱（皆脚綱）（ウミグモ類） (Pycnogonida) デヴォン紀〜現在 無肺亜綱に近縁?
!ムカシウミグモ (Palaeopantopus) デヴォン紀 独
オオウミグモ (Colossendeis)
真鋏角下門 (Euchelicerata) ［剣尾綱＋クモ上綱］
剣尾綱（カブトガニ類） (Xiphosura) シルル紀〜現在
カブトガニ (Tachypleus) 20〜85cm
クモ上綱 (Arachnomorphae) ［広翼綱＋蛛形綱］
!広翼綱（ウミサソリ類） (Eurypteria) オルドヴィス紀〜ペルム紀
蛛形綱（クモ類） (Arachnida) ［無肺亜綱＋書肺亜綱］
マダニ (Ixodes)
コガネサソリ (Scorpio)
ウデムシ (Tarantula)
ジョロウグモ (Nephila)
多足亜門 (Myriapoda) ［唇脚綱＋倍脚上綱］
唇脚綱（ムカデ類）(Chilopoda) Centipede
オオムカデ (Scolopendra) 日・南米(40cmになる種も）
倍脚上綱 (diplopomorphae) ［結合綱＋｛少脚綱＋倍脚綱｝］
結合綱（コムカデ類） (Symphyla)
ナミコムカデ (Hanseniella) 日
少脚綱（エダヒゲムシ類） (Pauropoda)
エダヒゲムシ (Pauropus) 日
倍脚綱（ヤスデ類）(Diplopoda)
タマヤスデ (Hyleoglomeris) 日
汎甲殻類 (Pancrustacea/Tetraconata) ［甲殻亜門＋六脚亜門］
甲殻亜門 (Eucrustacea)
ミジンコ (Daphnia)
ウミホタル (Cypridina)
フジツボ (Balanus)
六脚亜門 (Hexapoda) ［内顎綱＋昆虫綱］
内顎綱 (Entognatha)
カマアシムシ (Eosentomon)
マルトビムシ (Sminthurides)
ハサミコムシ (Japyx) 日
昆虫綱 (Insecta)
グラディエーター（カカトアルキ） (Mantophasma) heel walker ナミビア（ブラントバーク山塊）・SAf（ナマカランド） 3種 無翅・肉食
カブトムシ (A. dichotoma) 日本・中国・朝鮮
ミツバチ (Apis)
新口（後口）動物枝 (Deuterostomia) ［珍渦虫歩帯類＋脊索動物門］ Swalla & Smith 2008, Phil. Trans. R. Soc. B 363, 1557 ただし，遺伝子的には単系統性の証明は不十分
「鰓裂，尾部を有する」
!ウェトゥリコリア門(Vetulicolia) Shu et al. 2001 Nature 414, 419. 澄江動物群，二分的体制で5対の鰓裂(gill slits)を持つ
!バンフィア (Banffia) バージェス動物群，澄江動物群
!ウェトゥリコリア綱 (Vetulicolida) 澄江動物群 Chen & Zhou 1997
!シダゾーン (Xidazoon) Shu et al. 1999 Nature 400, 746.
!ディガゾーン (Digazoon) Shu et al. 2001
!ポマトラム (Pomatrum) Leu et al. 1999
!ウェトゥリコリア (Vetulicolia) Chen & Zhou 1997 節足動物との見方も，遊泳性
珍渦虫歩帯類 (Xenambulacraria) ［珍渦虫門＋歩帯超門］
珍渦虫門 (Xenoturbellida) ［単］
珍渦虫科 (Xenoturbellidae)
珍渦虫 (Xenoturbella) 北欧海底 中枢神経系・肛門・感覚器官退化 一時，DNA分析で二枚貝類とされたが，捕食物の貝幼生の誤認と判明 (Bourlat et al. 2003 Nature 424, 885)
歩帯超門 (Ambulacraria/Coelopora) ［半索動物門＋棘皮動物門］
半索動物門 (Hemichordata) 現生90種 鰓裂あり ［腸鰓綱＋筆石綱＋翼鰓綱］
腸鰓綱 (Enteropneusta) acron worm 11属70種 トルナリア幼生
ハリマニア科 (Harrimaniidae)
ハリマニア (Harrimania) 現生2種
(Stereobalanus) 現生2種
(Xenopleura) 現生1種
(Protoglossus) 現生2種
クビナガギボシムシ (Saccoglossus) 現生20種
オウカンギボシムシ科 (Saxipendiidae)
オウカンギボシムシ (Saxipendium) 現生1種
ハネナシギボシムシ科 (Spengeliidae)
(Spengelia) 現生6種
ハネナシギボシムシ（ビンボウムシ） (Glandiceps) 現生7種
(Schizocardium) 現生2種
(Willeya) 現生1種
ヒメギボシムシ科 (Ptychoderidae)
オオギボシムシ (Balanoglossus) 現生16種
(Glossobalanus) 現生11種
ヒメギボシムシ (Ptychodera)
!筆石綱 (Graptolithina) 棲管が化石化
!フデイシ (Graptolitida) カンブリア紀中期〜石炭紀
!(Monograptus)
!(Amplexograptus)
翼鰓綱 (Pterobranchia) 棲管形成
!?オドントグリフィス (Odontogriphus) バージェス頁岩，コノドントとの見方も
エノコロフサカツギ科 (Atubaridae)
エノコロフサカツギ (Atubaria) 日本沖(1995年),南半球深海
エラナシフサカツギ科 (Rhabdopleuridae)
エラナシフサカツギ (Rhabdopleura) 世界中，群体 現生8種
エラフサカツギ科 (Cephalodiscidae) 腸鰓綱／筆石類に類似?
エラフサカツギ (Cephalodiscus) 現生20種
(Planctosphaeroidea)
(Planctosphaeridae)
(Planctosphaera) 幼生のみ記載
!ウェトゥロシスティス類 (Vetulocystida) 澄江動物群 Nature 430, 422
!ウェトゥロシスティス科 (Vetulocystidae)
!ウェトゥロシスティス (Vetulocystis) 口・生殖器・鰓裂のある球莢＋末広がり尾部（2部に分かれ肛門に繋がる腸を持つ）
!ディアンキシスティス (Dianchicystis) 球莢＋先細り尾部
＜（広義）ホマロゾア類 (Homalozoa) ［スティロフォラ類＋（狭義）ホマロゾア類］をまとめる場合あり．さらに Jefferies はうちテノシストイド類以外を石灰索類 (Calcichordata) とまとめ脊索動物門に入れる）＞
!スティロフォラ類 (Stylophora) 絶滅 ホマロゾアに入れる場合あり
!有角（コルヌータ）類 (Cornutes) カンブリア紀中期〜オルドヴィス紀後期
!ケラトシスティス (Ceratocystis)
!コトゥルノシスティス (Cothurnocystis)
!レティキュロカルポス (Reticulocarpos)
!スコティエシスティス (Scotiaecystis)
!プロコトゥルノシスティス (Procothurnocystis)
!僧帽（ミトラータ）類 (Mitrates) オルドヴィス紀前期〜石炭紀後期
!キニアノカルポス (Chinianocarpos)
!ディアンフィディオシスティス (Diamphidiocystis)
!ミトロシステラ (Mitrocystella)
!(Jaekelocarpus) 石炭紀後期 オクラホマ 鰓裂あり Nature 417, 841 (2002)
!（狭義）ホマロゾア類 (Homalozoa)
!?テノシストイド類 (Ctenocystoidea)
!シンクタ類 (Cincta) カンブリア紀中期
!トロコシスティテス (Trochocystites) ラケット形 3cm
!ソルータ類 (Soluta) カンブリア紀中期〜デヴォン紀前期
!デンドロシストイデス (Dendrocystoides) 10cm以上
棘皮動物門 (Echinodermata) 現生7000種 ［有柄亜門＋遊在亜門］ 放射(5回)対称性，鰓裂なし
分類不詳
!(Shankouclava) 澄江動物群
!パラブラストイド類 (Parablastoidea)
!シクロシストイド類 (Cyclosystoidea)
!ヘリコプラコイド類 (Helicoplacoidea)
有柄亜門 (Pelmatozoa) ［絶滅ウミユリ類＋ウミユリ綱］
!シストイド綱 (Cystoidea)
!原始ウミユリ綱 (Eocrinoidea)
ウミユリ綱 (Crinoidea) sea lilies 現生650種
ウミユリ目 (Isocrinida)
ウミユリ科 (Isocrinidae)
ウミユリ (Isocrinus)
(Millericrinida)
(Apiocrinidae)
(Bathycrinidae)
(Bourgueticrinidae)
(Phrynocrinidae)
(Cyrtocrinida)
(Holopusidae)
(Hyocrinidae)
(Comatulida)
(Comasteridae)
(Colobometridae)
(Eudiocrinidae)
(Himerometridae)
(Mariametridae)
(Zygometridae)
(Aporometridae)
(Notocrinidae)
(Asterometridae)
(Calometridae)
(Charitometridae)
(Ptilometridae)
(Thalassometridae)
(Tropiometridae)
(Antedonidae)
(Apocrinidae)
(Atelecrinidae)
(Pentametrocrinidae)
!ウミツボミ綱 (Blastoidea)
!パラクリノイド綱 (Paracrinoidea)
遊在亜門 ［ヒトデ綱＋クリプトシリンジド下門］
ヒトデ形類 (Asterozoa) starfish
!座ヒトデ綱 (Edrioasteroidea) 絶滅
!ストロマトシスティス (Stromatocystis) カンブリア紀
ヒトデ綱 (Euasteroidea) 現生2000種
(Paxillosida)
(Astropectinidae)
(Ctenodiscididae)
(Goniopectinidae)
(Luidiidae)
(Porcellanasteridae)
(Radiasteridae)
(Notomyotida)
(Benthopectinidae)
(Valvatida)
オニヒトデ科 (Acanthasteridae)
オニヒトデ (Acanthaster)
(Archasteridae)
(Asterinidae)
(Asterodiscididae)
(Asteropsidae)
(Chaetasteridae)
(Ganeriidae)
(Goniasteridae)
(Mithrodidae)
(Odontasteridae)
(Oreasteridae)
(Ophidiasteridae)
(Poraniidae)
(Sphaerasteridae)
(Velatida)
(Caymanostellidae)
(Korethasteridae)
(Myxasteridae)
(Pterasteridae)
(Solasteridae)
(Spinulosida)
(Echinasteridae)
(Forcipulatida)
(Asteriidae)
(Heliasteridae)
(Labidiasteridae)
(Neomorphasteridae)
(Pedicellasteridae)
(Zoroasteridae)
(Brisingida)
(Brisingidae)
(Freyellidae)
シャリンヒトデ綱 (Concentricycloidea)
シャリンヒトデ (Xyloplax) NZ Baker et al. 1986 Nature 321, 862
クリプトシリンジド下門 (Cryptosyringida) ［蛇尾綱＋海胆綱］
クモヒトデ（蛇尾）綱 (Ophiuroidea) brittle stars/snake stars 現生2300種
カワクモヒトデ目 (Phyrynophiurida)
(Asteronychidae)
(Asteroschematidae)
ユウレイモヅル科 (Euryalidae)
テヅルモヅル科 (Gorgonocephalidae) basket star 手蔓縺
(Ophiomyxida)
(Ophiomyxidae)
(Ophiocanopidae)
クモヒトデ目 (Ophiurida)
(Ophiocomidae)
(Ophiodermatidae)
クシノハクモヒトデ科 (Ophiuridae)
クモヒトデ (Ophioplocus)
(Ophioleucidae)
海胆形類 (Echinozoa) sea urchins/ sand dollars ［海胆綱＋ナマコ綱］
!オフィオシストイド類 (Ophiocystioidea) 絶滅
海胆（ウニ）綱 (Echinoidea) 現生900種
!ミオキダリス (Miocidaris) ペルム紀〜三畳紀
オウサマウニ目 (Cidaroida)
フトザオウニ科 (Cidaridae)
(Psychocidaridae)
フクロウニ目 (Echinothurioida)
フクロウニ科 (Echinothuriidae)
ガンガゼ目 (Diadematoida)
(Aspidodiadematidae)
ガンガゼ科 (Diadematidae)
ガンガゼ (Diadema)
(Lissodiadematidae)
(Micropygidae)
(Pedinoida)
(Pedinidae)
(Salenioida)
(Saleniidae)
(Phymosomatoida)
(Phymosomatidae)
(Stomechinidae)
(Stomopneustidae)
アスナロウニ目 (Arbacioida)
(Arbaciidae)
ホンウニ目 (Temnopleuroida)
(Temnopleuridae)
ラッパウニ科 (Toxopneustidae)
(Echinoida)
ヨーロッパオオウニ科 (Echinidae)
ナガウニ科 (Echinometridae)
ムラサキウニ (Anthocidaris)
(Parasaleniidae)
オオバフンウニ科 (Strongylocentrotidae)
オオバフンウニ (Strongylocentrotus)
タマゴウニ目 (Holectypoida)
タコノマクラ目 (Clypeasteroida)
(Arachnoididae)
(Clypeasteridae)
(Laganina)
(Fibulariidae)
(Laganidae)
(Scutellina)
(Astriclypeidae)
(Dendrasteridae)
(Echinarachniidae)
(Mellitidae)
(Rotulina)
(Rotulidae)
マンジュウウニ目 (Cassiduloida)
マンジュウウニ科 (Cassidulidae)
(Echinolampadidae)
(Pliolampadidae)
(Holasteroida)
(Calymnidae)
(Holasteridae)
(Pourtalesiidae)
(Urechinidae)
(Spatangoida)
(Toxasteridae)
(Aeropsidae)
(Hemiasteridae)
(Palaeostomatidae)
(Pericosmidae)
ブンブクチャガマ科 (Schizasteridae)
ブンブクチャガマ (Schizaster)
(Brissidae)
(Loveniidae)
ブンブク科 (Spatangidae)
(Neolampadoida)
(Neolampadidae)
ナマコ綱 (Holothuroidea) sea cucumbers 現生1150種
(Dendrochirotida)
(Cucumariidae)
(Paracucumidae)
(Phyllophoridae)
(Placothuriidae)
(Psolidae)
(Sclerodactylidae)
(Dactylochirotida)
(Rhopalodinidae)
(Vaneyellidae)
(Ypsilothuriidae)
(Aspidochirotida)
(Holothuriidae)
マナマコ科 (Stichopodidae)
マナマコ (Stichopus)
(Synallactidae)
(Elasipodida)
(Deimatidae)
(Elpidiidae)
(Laetmogonidae)
(Pelagothuriidae)
(Psychropotidae)
(Apodida)
(Chiridotidae)
(Myriotrochidae)
(Synaptidae)
(Molpadida)
(Caudinidae)
(Gephyrothuriidae)
(Molpadiidae)
脊索動物門 (Chordata) ［頭索動物亜門＋嗅覚類］
「従来は，頭索動物と脊椎動物が単系統とされたが，頭索動物は最も祖先的な脊索動物と判明（Putnam et al 2008, Nature 453, 1064）．」
頭索動物亜門 (Cephalochorda) Amphioxus 現生2属35種
?!ピカイア類 最古の脊索動物
? (Metaspriggina)
!カサイミルス (Cathaymyrus) カンブリア紀初期 澄江動物群 Shu et al. 1996 Nature 384, 156.
!ピカイア (Pikaia) カンブリア紀中期 バージェス動物群 Conway Morris 1982.
ナメクジウオ綱 (Acrania) 1目2属 目が無く神経管に受光器
? (Paleobranchiostoma)
ナメクジウオ目 (Amphioxiforms) 底棲，濾過食
ナメクジウオ (Branchiostoma) Lancelets 太平洋・インド洋暖水75m以浅 15種
カタナメクジウオ (Epigonichthys (= Asymmetron)) 7種
嗅覚類 (Olfactores) ［被嚢動物亜門＋頭蓋動物類］
被嚢（尾索）動物亜門 (Tunicata/Urochordata) tunicates 現生22科204属2500種
!(Cheungkongella) カンブリア紀初期，澄江動物群 Nature 411 472
**** ［マメボヤ目＋｛マンジュウホヤ目＋タリア綱｝］
マメボヤ目 (Phelobobranchiacea)
ヒメボヤ科 (Agneziidae)
(Adagnesia)
ヒメボヤ (Agnezia)
(Proagnesia)
ナツメボヤ科 (Ascidiidae)
ナツメボヤ (Ascidia)
(Ascidiella)
(Phallusia)
(Psammascidia)
ユウレイボヤ科 (Cionidae)
(Araneum)
ユウレイボヤ (Ciona)
(Diazona)
(Pseudodiazona)
(Rhopalaea)
(Tylobranchion)
ドロボヤ科 (Corellidae)
(Abyssascidia)
スボヤ (Chelyosoma) siphons consist of 2 plated cones
ドロボヤ (Corella)
(Corellopsis)
(Corynascidia)
(Rhodosoma)
オオグチボヤ科 (Octacnemidae)
(Dicopia)
(Octacnemus)
オオグチボヤ (Megalodicopia) 13cm 深海 大きな入水口から海水とともに取り込んだ微生物を鰓嚢で濾し取る
(Situla)
マメボヤ科 (Perophoridae)
(Ecteinascidia)
マメボヤ (Perophora)
****
マンジュウボヤ目 (Aplousbranchiata)
(Clavelinidae)
(Archidistoma)
ワモンツツボヤ (Clavelina)
(Pycnoclavella)
ウスボヤ科 (Didemnidae) 細胞間隙にプロクロロンが共生
シロウスボヤ／チャツボイボヤ (Didemnum)
ネンエキボヤ (Diplosoma)
(Leptoclinides)
(Lissoclinum)
(Polysyncraton)
(Trididemnum)
ヘンゲボヤ科 (Polycitoridae)
(Archiascidia)
(Cystodytes)
(Distaplia)
(Eudistoma)
ヘンゲボヤ (Polycitor)
(Protoholozoa)
(Rhombifera)
(Sycozoa)
マンジュウボヤ科 (Polyclinidae)
(Aplidiopsis)
マンジュウボヤ (Aplidium)
(Polyclinella)
(Polyclinum)
(Pseudodistoma)
(Ritterella)
(Sidneioides)
(Synoicum)
(Ritterellidae)
(Ritterella)
タリア綱 (Thaliacea) 現生22属74種
ヒカリボヤ亜綱 (Pyrosomata)
ヒカリボヤ目 (Pyrosomida)
ヒカリボヤ科 (Pyrosomidae)
ヒカリボヤ (Pyrosoma)
ナガヒカリボヤ (Pyrostremma)
ウミタル亜綱 (Myosomata)
ウミタル目 (Doliolida/Cyclomyaria)
ウミタル科 (Doliolidae)
ウミタル (Doliolum)
トリトンウミタル (Dolioletta)
サルパ目 (Salpida/Desmomyria)
サルパ科 (Salpidae) オオタルマワシが補食
サルパ (Salpa)
ワサルパ (Cyclosalpa)
ヒメサルパ (Thalia)
オオサルパ (Thetys)
モモイロサルパ (Pegea)
****
?尾虫目（オタマボヤ類）(Appendicularia/Larvacea) 現生3科9属30種
オタマボヤ科 (Oikopleuridae)
オタマボヤ (Oikopleura) ゲノム数最小
カサオタマボヤ科 (Kowalevskiidae)
カサオタマボヤ (Kowalevskiidae)
サイヅチボヤ科 (Fritillariidae)
サイヅチボヤ (Fritillariidae)
マボヤ目 (Stolidobranchia)
フクロボヤ科 (Molgulidae)
(Anomopera)
(Eugyra)
(Eugyrioides)
(Gamaster)
マンハッタンボヤ (Molgula)
(Molguloides)
(Pareugyrioides)
(Protomolgula)
イタボヤ科 (Botryllidae)
(Botrylloides)
キクイタボヤ (Botryllus)
ヘクサクロビルス科 (Hexacrobylidae)
マボヤ科 (Pyuridae)
(Bathypyura)
(Bolteniopsis)
(Cratostigma)
(Culeolus)
(Dextrogaster)
マボヤ (Halocynthia)
(Herdmania)
(Heterostigma)
(Microcosmus)
(Minipera)
(Pyura)
シロボヤ科 (Styelidae)
(Alloeocarpa)
(Bathyoncus)
(Bathystyeloides)
(Botryllus)
(Dendrodoa)
(Dicarpa)
(Distomus)
(Kukenthalia)
(Pelonaia)
(Polyandrocarpa)
(Protostyela)
(Psammostyela)
(Seriocarpa)
(Stolonica)
(Tibitin)
(Polyzoinae)
(Eusynstyela)
(Symplegma)
(Styelinae)
(Cnemidocarpa)
(Polycarpa)
シロボヤ (Styela)
?ソルベラ綱 (Sorberacea) 底生・肉食・鰓曩欠く
(Gasterascidia) 2種
(Hexadactylus) 3種
(Sorbera) 1種
頭蓋動物類 (Craniata) カンブリア紀〜現在 頭蓋骨あり ［ヌタウナギ綱＋コノドント綱＋脊椎動物亜門］
?!ユンナノ動物 (Yunnanozoa) 澄江動物群 6対の鰓裂 anterior skirt 頭索動物?
!ハイコウエラ (Haikouella) 澄江動物群
!ユンナノゾーン (Yunnanozoon) 同上，Chen et al. 1995 Nature 377 720; Shu et al. 1996 Nature 380, 428.
ヌタウナギ綱 (Myxini/Hyperotreti) メクラウナギ綱 頭蓋はあるが脊椎は無く無顎
!コノドント類 (Euconodonta) カンブリア紀中期〜三畳紀後期 所属不詳
脊椎動物亜門 (Vertebrata)
バイコンタ類 (Bikonta) ［エクスカヴァータ界＋｛アーケプラスティダ界＋リザリア界＋クロマルヴェオラータ界｝］
??(Hermesinum)
?コエロスポリディウム (Coelosporidium)
?(Phagomyxa)
?(Phagodinium)
?(Pseudospora)
エクスカヴァータ界 (Excavata) ［アーケゾア亜界＋ディスキクリスタ亜界］ 多系統?
?ステファノポゴン (Stephanopogon) Pseudociliata 単核多鞭毛(unikinetids)，細胞口，円盤状クリステ
?コロディクティオン科 (Collodictyonidae)
コロディクティオン(Collodictyon)
ディフィレイア (Diphylleia)
?カタブレファリス科 (Kathablepharidae)
カタブレファリス (Kathablepharis)
レウコクリプトス (Leucocryptos)
?ヘミマスティクス綱 (Hemimastigea) 渦鞭毛虫類?
?パラマスティクス (Paramastix)
スピロネマ科 (Spironemidae)
ヘミマスティクス (Hemimastix)
スピロネマ (Spironema)
ステレオネマ (Stereonema)
?エブリア綱 (Ebriidea) 旧アプソゾア類 海生鞭毛虫
エブリア (Ebria)
ヘルメシヌム (Hermesinum)
?有中心粒門 (Centroheliozoa/Centrohelida) 所属不詳 旧太陽虫門
アカントキスティス科 (Acanthocystidae)
アカントキスティス (Acanthocystis)
コアノシスティス (Choanocystis)
エキノシスティス (Echinocystis)
プセウドラフィディオフリス (Pseudoraphidiophrys)
プセウドラフィディオシスティス (Pseudoraphidocystis)
ペテロシスティス (Pterocystis)
ヘテロフリス科 (Heterophryidae)
クラミダステル (Chlamydaster)
ヘテロフリス (Heterophrys)
オキシネレラ (Oxnerella)
スファエラストラム (Sphaerastrum)
ラフィディオフィルス科 (Raphidiophryidae)
パラスファエラストルム (Parasphaerastrum)
ポリプラコシスティス (Polyplacocystis)
ラフィドシスティス (Raphidiocystis)
ラフィディオフィルス (Raphidiophrys)
?アプソゾア門 (Apusozoa) DHFR-TS融合型を持つが，アメーバ動物界にも近縁？
(Diphyllatea)
(Hilomonadea)
(Micronuclearia)
(Planomonadida)
(Thecomonadea)
'Mastigamoeba invertens'
アンキロモナス目 (Ancyromonadida)
アンキロモナス (Ancyromonas)
アプソモナス目 (Apusomonadida)
アマスティゴモナス (Amastigomonas)
アプソモナス (Apusomonas)
アーケゾア亜界 (Archezoa/Metamonada) ［パラベーサリア門＋アネロモナダ門］ 原初的にペルオキシソームを持たず，遺伝子にイントロンが無い．Mtは2次喪失，ミトソームが残存．
?マラウィモナス (Malawimonas)
パラベーサリア門 (Parabasala) ［パラベーサリア綱＋フォニカータ綱］
パラベーサリア綱 (Parabasalia)
トリコモナス目 (Trichomonadida)
トリコモナス科 (Trichomonadae)
?(Monotrichomonas)
?キロミティス亜科 (Chilomitinae)
キロミトゥス (Chilomitus)
?プロトリコモナス亜科 (Protrichomonadinae)
ヒストモナス (Histomonas)
パラヒストモナス (Parahistomonas)
プロトリコモナス (Protrichomonas)
ディエンタメーバ亜科 (Dientamoebinae)
ディエンタメーバ (Dientamoeba) アーケゾア唯一の無鞭毛アメーバ
トリコミトプシス亜科 (Trichomitopsinae)
プセウドトリパノゾーマ (Pseudotrypanosoma)
トリコミトプシス (Trichomitopsis)
ペンタトリコモノイデス亜科 (Pentatrichomonoidinae)
ペンタトリコモノイデス (Pentatrichomonoides)
テトラトリコモナス亜科 (Trichomonadinae)
ペンタトリコモナス (Pentatrichomonas)
テトラトリコモナス (Tetratrichomonas)
トリトリコモナス亜科 (Tritrichomonadinae)
トリトリコモナス (Tritrichomonas)
モノケルコモナス亜科 (Monocercomonadinae)
ヘクサマスティクス (Hexamastix)
モノケルコモナス (Monocercomonas)
テトラトリコマスティクス (Tetratrichomastix)
トリケルコミトゥス (Tricercomitus)
ヒポトリコモナス亜科 (Hypotrichomonadinae)
ヒポトリコモナス (Hypotrichomonas)
プセウドトリコモナス (Pseudotrichomonas)
トリコモナス亜科 (Trichomonadinae)
トリコミトゥス (Trichomitus)
トリコモナス（ホネマクムシ） (Trichomonas) ヒトに感染，ミトコンドリア起源のハイドロゲノソームを持つ
コクロゾーマ科 (Cochlosomatidae)
コクロゾーマ (Cochlosoma)
クリスタモナド目 (Cristamonadida)
デウェスコウィナ科 (Devescovinidae)
デウェスコウィナ亜科 (Devescovininae)
(Bullanympha)
(Caduceia)
デウェスコウィナ (Devescovina)
(Foainia)
(Hyperdevescovina)
(Macrotrichomonas)
(Metadevescovina)
(Mixotricha)
(Parajoenia)
(Pseudodevescovina)
ギガントモナス亜科 (Gigantomonadinae)
ギガントモナス (Gigantomonas)
カロニンファ科 (Calonymphidae)
カロニンファ (Calonympha)
コロニンファ (Coronympha)
(Criconympha)
(Diplonympha)
(Gyronympha)
(Metacoronympha)
(Prosnyderella)
(Snyderella)
(Stephanonympha)
ロフォモナド亜目 (Lophomonadida)
(Joeniidae)
(Joenia)
(Joenioides)
(Joenopsis)
ロフォモナス科 (Lophomonadidae)
(Lophomonas)
リゾニンファ科 (Rhizonymphidae)
リゾニンファ (Rhizonympha)
コフォイディア (Kofoidiidae)
コフォイディア (Kofoidia)
(Deltotrichonymphidae)
スピロトリコニンファ目 (Spirotrichonymphida)
?(Rostronympha)
?スピロニンファ (Spironympha)
(Microjoeniidae)
(Microjoenia)
スピロトリコニンファ科 (Spirotrichonymphidae)
スピロトリコニンファ (Spirotrichonympha)
(Spirotrichonymphella)
ホロマスティゴトイデス科 (Holomastigotoididae)
ホロマスティゴトイデス (Holomastigotoides)
ホロマスティゴテス科 (Holomastigotidae)
ホロマスティゴテス (Holomastigotes)
トリコニンファ目 (Trichonymphida)
クリプトケルクス （Cryptocercus)
ホプロニンファ科 (Hoplonymphidae)
(Barbulanympha)
ホプロニンファ (Hoplonympha)
(Rhynchonympha)
(Urinympha)
(Staurojoeninidae)
(Idionympha)
(Staurojoenina)
トリコニンファ科 (Trichonymphidae)
?(Deltatrichonympha)
?(Koruga)
トリコニンファ (Trichonympha)
ユーコモニンファ科 (Eucomonymphidae)
ユーコモニンファ (Eucomonympha)
(Pseudotrichonympha)
テラニンファ科 (Teranymphidae)
テラニンファ (Teranympha)
スピロトリコゾーマ科 (Spirotrichosomidae)
(Apospironympha)
(Colospironympha)
(Leptospironympha)
(Macrospironympha)
スピロトリコゾーマ (Spirotrichosoma)
フォニカータ綱 (Fornicata/Metamonadea) ［ディプロモナス目＋レトルタモナス目］
カルペディエモナス (Carpediomonas) ［単］
ディプロモナス（ヒゲハラムシ）目 (Diplomonadida)
エンテロモナス科 (Enteromonadidae)
カウィオモナス (Caviomonas)
エンテロモナス (Enteromonas)
トリミトゥス (Trimitus)
ヘキサミタ科 (Hexamitidae)
?ギロモナス (Gyromonas)
?トリゴノモナス (Trigonomonas)
(Spironucleus barkhanus) 多系統 魚に寄生
(Spironucleus vortens) 多系統
トレポモナス (Trepomonas)
ヘキサミタ (Hexamita)
(Spironucleus muris) 多系統
ランブル鞭毛虫科 (Giardiidae)
ランブル鞭毛虫 (Giardia) mitosome（Mt残存小器官でFe-Sタンパク成熟機能あり）は残存，ヒトの腸疾患原虫
オクトミトゥス (Octomitus)
レトルタモナス目 (Retortamonadida) 有判鞭毛虫類
レトルタモナス科 (Retortamonadidae)
レトルタモナス (Retortamonas)
キロマスティクス (Chilomastix)
プレアクソスティラ門 (Preaxostyla) ［アネロモナダ綱］
アネロモナダ綱 (Anaeromonadea) ［トリマスティクス＋オキシモナス目］
トリマスティクス (Trimastix)
オキシモナス目 (Oxymonadida)
ポリマスティガ科 (Polymasticidae)
ポリマスティクス (Polymastix)
(Monocercomonoides)
オキシモナス科 (Oxymonadidae)
オキシモナス (Oxymonas)
ピルソニモファ科 (Pyrsonymphidae)
ピルソニモファ (Pyrsonympha)
サッキノバクルス科 (Saccinobaculidae)
サッキノバクルス (Saccinobaculus)
ストレブロマスティガ科 (Streblomastigidae)
ストレブロマスチックス (Streblomastix)
ディスコバ亜界 (Discoba) ［ヤコバ綱＋ディスキクリスタ下界］ Mtあり
?アンダルキア (Andalucia) 鞭毛虫
ヤコバ綱 (Jakobea) バクテリア食 ロリカ バクテリア様Mt（100以上の遺伝子保持）
?(Seculamonas)
ヤコバ (Jakoba) ［多］ Jacoba incarcerata は遠い 自由遊泳，平板クリステ
(Seculamonas ecuadoriensis)
ヒスティオナ科 (Histionidae) ロリカ，管状クリステ
?(Stenocodon)
?(Stomatochone)
ヒスティオナ (Histiona)
レクリノモナス (Reclinomonas) 遺伝構造が始原的
ディスキクリスタ下界 (Discicristata) ［ペルコロゾア門＋ユーグレナ生物門］
ペルコロゾア門 (Percolozoa)
ヘテロロボサ綱 (Heterolobosea) 土中・淡水 アメーバ状（多くは鞭毛期あり），自発的に伸びる仮足
?(Macropharyngimonas halophila)
?(Pernina)
?(Rosculus)
(Schizopyrenida)
(Vahlkampfiidae)
ヘテラメーバ (Heteramoeba)
(Sawyeria)
(Psalteriomonas)
テトラミトゥス (Tetramitus)
(Paratetramitus)
(Vahlkampfia)
グルベレラ科 (Gruberellidae)
グルベレラ (Gruberella)
(Stachyamoeba)
アクラシス（細胞性粘菌）目 (Acrasida/Acrasiales) Cellular slime molds アメーバ状（特殊な仮足）
アクラシス科 ( Acrasidae/Acrasiaceae)
アクラシス (Acrasis)
ポケイナ (Pocheina)
グトゥリノプシス科 (Guttulinopsidae)
グトゥリノプシス (Guttulinopsis)
?(Tetramitia)
ペルコロモナス (Percolomonas)
ナエグレリア (Naegleria) N. fowleriはヒトに感染
ユーグレナ生物（美眼虫）門 (Euglenozoa) うちわ型ミトコンドリアクリステ，鞭毛
?(Calkinsia)
?ポストガアルディ(Postgaardi) キネトプラスト／クリステの無いミトコンドリア保持
サッコストマ亜門 (Saccostoma)
キネトプラスト綱 (Kinetoplastea) キネトプラスト（Mt-kDNA顆粒）を持つ
?(Bordnamonas)
?トリパノフィス (Trypanophis)
?(Colponema)
?ケファロタムニウム (Cephalothamnium)
?(Hemistasia)
前キネトプラスト亜綱 (Prokinetoplastina) ２鞭毛 寄生性
イクティオボド (Ichthyobodo) 魚に外部共生
(Perkinsiella) アメーバ内部共生
後キネトプラスト亜綱 (Prokinetoplastina) ２鞭毛 一部寄生性
ネオボド目 (Neobodonida)
(Cruzella)
ディマスティゲラ (Dimastigella)
ネオボド (neobodo)
リンコボド (Rhynchobodo)
リンコモナス (Rhynchomonas)
パラボド目 (Parabodonida)
クリプトビア (Cryptobia)
パラボド (Parabodo)
プロクリプトビア (Procryptobia)
トリパノプラズマ (Trypanoplasma)
ユーボド目 (Eubodonida)
ボド (Bodo)
ボド亜目 (Bodonida)
ボド科 (Bodonidae)
トリパノフィス亜科 (Trypanophinae)
トリパノソーマ亜目 (Tripanosomatoida) １鞭毛 寄生性
トリパノソーマ科 (Trypanosomatidae)
ブラストクリティデア (Blastocrithidia)
クリティディア (Crithidia)
ヘルペトモナス (Herpetomonas)
レプトモナス (Leptomonas)
フィトモナス (Phytomonas)
リンコイドモナス (Rhynchoidomonas)
ウォラケイナ (Wallaceina)
エンドトリパヌム (Endotrypanum)
フィトモナス (Phytomonas)
トリパノソーマ (Trypanosoma) 眠り病（ツェツェ蠅が媒介）Chagas病 RNA編集発見
リーシュマニア (Leishmania) リーシュマニア症（スナバエ Lutzomyiaが媒介）
サウロリーシュマニア (Sauroleishmania)
プリコストマ亜門 (Plicostoma)
ディプロネマ綱 (Diplonemea) 従属栄養，大きい平板クリステ
ディプロネマ (Diplonema)
(Rhynchopus)
ミドリムシ（ユーグレナ）下門 (Euglenida) たんぱく縞表皮 鞭毛（1,2本）
ヘテロネマ綱 (Heteronematina) 葉緑体を欠く 捕食性
(Dinema)
(Ploeotia)
スファエノモナス目 (Sphenomonadales)
ペタロモナス (Petalomonas)
ヘテロネマ目 (Heteronematales)
ヘテロネマ (Hetronema)
エントシフォン (Entosiphon) 捕食性
フトヒゲムシ (Peranema) 従属栄養
(Urceolus)
(Peranemopsis)
(Aphagea) 葉緑体を欠く
(Distigma)
ラブドモナス目 (Rhabdomonadales)
ラブドモナス (Rhabdomonas)
ミドリムシ綱 (Euglenea) 緑藻共生葉緑体，浸透食，自泳
ミドリムシ（ユーグレナ）目 (Euglenales) ウチワ型クリステ
イロナシミドリムシ (Astasia) 吸収栄養（葉緑体の二次喪失）
ミドリムシ（ユーグレナ） (Euglena) 退化した捕食装置
トックリヒゲムシ (Trachelomonas)
ウチワヒゲムシ (Phacus)
コラキウム (Colacium)
ユートレプティア目 (Eutreptiales)
ユートレプティア (Eutreptiella)
超植物上界 ［（真正）植物界＋リザリア界＋クロマルベオラータ界］
（真正）植物界 (Archaeplastida/Plantae) ［灰色藻亜界＋紅色生物亜界＋緑色植物亜界］ 側系統
「シアノバクテリア共生起源のクロロフィルaを持つ光合成細胞内器官（一部二次喪失），セルロースによる細胞壁，平板クリスタ，でんぷんで栄養貯蔵」
灰色藻亜界 (Glaucophyta/Glaucocystophyta/Biliphyta)
「シアネレ（クロロフィルa）：二重膜間にペプチドグリカン壁（シアノバクテリアに酷似，遺伝子サイズは1/10）
灰色藻綱 (Glaucophyceae/Glaucocystophyceae)
グロエオカエテ目 (Gloeochaetales)
グロエオカエテ (Gloeochaete)
グラウコキスティス目 (Glaucocystales)
グラウコキスティス (Glaucocystis)
キアノフォラ目 (Cyanophorales)
キアノフォラ (Cyanophora) 鞭毛装置に多層構造体（緑色植物に近い）
紅色生物亜界 (Rhodobionta) 以下の分類は信頼性に乏しい
紅色藻門 (Rhodophyta) Red algae Chl a，フィコビリン 現生500属6000種
(Porphyridium)
(Antithamnion)
イデユコゴメ (Cyanidium) 高温酸性温泉
亜門 (Rhodellophytina)
チノリモ (Porphyridium)
(Stylonema)
亜門 (Macrorhodophytina)
（以下，上の亜門に応じて変更する必要あり）
ウシケノリ（原始紅藻）綱 (Bangiophyceae/Protoflorideophyceae) 側系統
チノリモ目 (Porphyridiales) 多系統
チノリモ科 (Porphyridiaceae)
チノリモ (Porphyridium) 淡水（水たまり）
(Rhodella)
(Dixonielloa)
(Stylonema)
(Chroodactylon)
(Rhodosorus)
(Flintiella)
(Goniotrichaceae)
(Asterocytis)
(Goniotrichum)
(Neevea)
(Phragmonemataceae)
イデユコゴメ (Cyanidium) 高温酸性温泉
(Kneuckeria)
(Kyliniella)
(Phragmonema)
ロドカエテ目 (Rhodochaetales)
ロドカエテ科 (Rhodochaetaceae)
ロドカエテ (Rhodochaete)
ベニミドロ目 (Goniotrichales)
ベニミドロ科 (Goniotrichaceae)
(Asterocytis)
ベニミドロ (Goniotrichum)
(Neevea)
オオイシソウ目 (Compsopogonales)
オオイシソウ科 (Compsopogonaceae)
オオイシソウ (Compsopogon)
オオイシソウモドキ (Compsopogonopsis)
エリトロペルティス科 (Erythropeltidaceae)
イソハナビ (Erythrocladia)
ホシノイト (Erythrotrichia)
ヒナノリ (Porphyropsis)
ウシケノリ目 (Bangiales)
ウシケノリ科 (Bangiaceae)
ウシケノリ (Bangia)
(Conchocelis)
アマノリ (Porphyra) 食用のアサクサノリ等を含む
(Boldiaceae)
(Boldia)
真正紅藻綱 (Florideophyceae)
第１上目 タイプ5のピットプラグ
アクロカエティウム目 (Acrochaetiales)
アクロカエティウム (Acrochaetium)
ベニマユダマ (Colaconema)
ダルス目 (Palmariales)
ダルス科 (Palmariaceae)
(Halosaccion)
ダルス (Palmaria)
ウミゾウメン目 (Nemaliales)
カサマツ (Dermonema)
ベニモヅク (Helminthocladia)
コナハダ (Liagoropsis)
ウミゾウメン (Nemalion)
フサノリ (Scinaia)
ガラガラ (Tricleocarpa)
第２上目
ベニマダラ目 (Hildenbrandiales)
ベニマダラ (Hildenbrandia)
第３上目 側系統
カワモヅク目 (Batrachospermales)
カワモヅク (Batrachospermum)
サンゴモ目 (Corallinales)
カニノテ (Amphiroa)
サンゴモ (Corallina)
イシノミ (Goniolithon)
イシゴロモ (Lithophyllum)
イシモ (Lithothamnion)
イシノハナ (Mastophora)
オオシロコ (Serraticardia)
イタニグサ目 (Ahnfeltiales)
イタニグサ (Ahnfeltia)
第４上目 タイプ4のピットプラグ
オゴノリ目 (Gracilariales)
オゴノリ (Gracilaria)
イギス目 (Ceramiales)
イギス (Ceramium)
ダジア (Dasya)
エゴノリ (Campylaephora)
クスダマ (Pleonosporium)
コノハノリ (Delesseria)
フジマツモ (Rhodomela)
テングサ目 (Gelidiales)
テングサ (Gelidium) 寒天の原料
オバクサ (Pterocladia)
ヒラクサ (Ptilophora)
ヤタベグサ (Yatabella)
カギノリ目 (Bonnemaisoniales)
カギケノリ (Asparagopsis)
カギノリ (Bonnemaisonia)
タマイタダキ (Delisea)
スギノリ目 (Gigartinales) （旧カクレイト目含む）
ヌメリグサ (Calosiphonia)
イソモッカ (Caulacanthus)
コレオコラックス (Choreocolacs)
ナミイワタケ (Dicranematos)
リュウモンソウ (Dumontia)
フノリ (Gloiopeltis) 糊の原料の一つ
スギノリ (Gigartina)
イトフノリ (Gloiosiphonia)
アガルディエラ (Agardhiella)
ミリン (Solieria)
イソノハナ目 (Halymeniales) （旧スギノリ目に属す）
イソノハナ (Halymenia)
ユカリ目 (Plocamiales) （旧スギノリ目に属す）
ユカリ (Plocamiumn)
マサゴシバリ目 (Rhodymeniales)
カエルデグサ (Binghamia)
ハナノエダ (Botryocladia)
タオヤギソウ (Chrysmenia)
フクロツナギ (Coelarthrum)
マダラグサ (Fauchea)
イソマツ (Gastroclonium)
フシツナギ (Lomentaria)
マサゴバシリ (Rhodymenia)
ワツナギソウ (Champia)
葉緑体生物亜界 (Chloroplastida) ［プラシノ藻亜門＋クロロデンドロン藻亜門＋緑藻亜門＋連鎖植物下界］
「クロロフィルa,bを持つ葉緑体（内部にピレノイド），中心体あり」
プラシノ藻亜門 (Prasinophytae) 19属100種 ［側］
ミクロモナス綱 (Micromonadophyceae)
マミエラ目 (Mamiellales)
マミエラ科 (Mamiellaceae)
マミエラ (Mamiella)
マントニエラ (Mantoniella)
バティコックス (Bathycoccus)
ミクロモナス (Micromonas)
ピラモナス目 (Pyramimonadales)
ピラミモナス (Pyramimonas)
ハロスファエラ (Halosphaera)
キムボモナス (Cymbomonas)
プテロスペルマ (Pterosperma)
ネフロセルミス綱 (Nephrophyceae)
プセウドスコウルフィエルディア目 (Pseudoscourfieldiales)
プセウドスコウルフィエルディア (Pseudoscourfieldia)
ピクノコックス (Pycnococcus)
ネフロセルミス (Nephroselmis)
プラシノコッカス (Prasinococcus)
プラシノデルマ (Prasinoderma)
クロロデンドロン藻亜門 (Chlorodendraphytae)
クロロデンドロン目 (Chlorodendrales)
(Prasinocladus)
テトラセルミス (Tetraselmis)
スケルフェリア (Scherffelia)
緑藻門 (Chlorophyta) green algae ［アオサ藻綱＋トレボウクシア藻綱＋緑藻綱］ 4050種
?ミクロタムニオン目 (Microthamniaceae)
ミクロタムニオン (Microthamnion)
?ペディノモナス (Pedinomonas)
アオサ藻綱 (Ulvophyceae) ［ヒビミドロ目＋アオサ目＋シオグサ目＋Siphonocladales］
?ウミイカダ目 (Oltmannsiellopsidales)
(Oltmannsiellopsis)
?スミレモ目 (Trentepohliales)
スミレモ科 (Trentepohliaceae)
(Pilinia)
(Cephaleuros)
(Friedaea)
(Lochmium)
(Mycoidea)
(Phycopeltis)
(Printzina)
(Pseudendocloniopsis)
(Rhizothallus)
(Sporocladus)
(Stomatochroon)
スミレモ (Trentepohlia) 陸生（気生藻）
ヒビミドロ目 (Ulotrichales)
(Cylindrocapsaceae)
(Cylindrocapsa)
(Cylindrocapsopsis)
(Schizomeridaceae)
(Schizomeris)
(Collinsiellaceae)
(Collinsiella)
(Collinsiellopsis)
(Borodinellaceae)
(Borodinella)
(Chloroplana)
(Planophila)
ヒビミドロ科 (Ulotrichaceae)
(Heterogonium)
(Heterothrichopsis)
(Hormidium)
(Acrosiphonia)
(Gloeotilopsis)
モツレグサ (Spongomorpha)
(Ulotrix)
(Ulotrichopsis)
シリオミドロ (Urospora)
...
(Gomontiaceae)
(Eugomontia)
(Gomontia)
ヒトエグサ (Monostroma)
(Protomonostroma)
クロヒトエグサ (Ulvaria)
ハロクロロコックム (Halochlorococcum)
アオサ目 (Ulvales)
(Bolbocoleon)
(Jaoa)
(Capsosiphon)
(Gayralia)
(Kornmanniaceae)
(Blidingia)
(Kornmannia)
(Pseudendoclonium)
(Tellamia)
アオサ科 (Ulvaceae)
(Chloropelta)
(Lobata)
(Ulvopsis)
アオノリ (Enteromorpha)
(Gemina)
(Letterstedtia)
(Ochlochaete)
(Percursaria)
(Ruthnielsenia)
アオサ (Ulva)
(Umbraulva)
アワビモ科 (Ulvellaceae)
(Chaetobolus)
(Pseudodendoclonium)
(Acrochaete)
エントクラディア (Entocladia)
(Epicladia)
(Pringsheimiella)
(Pseudopringsheimia)
(Syncoryne)
(Trichothyra)
アワビモ (Ulvella)
シオグサ（ミドリゲ）目 (Cladophorales)
(Anadyomenaceae)
(Anadyomene)
(Macrodictyon)
(Microdictyon)
(Rhipidiphyllon)
ヒラシオグサ (Willeella)
シオグサ科 (Cladophoraceae)
(Arnoldiella)
(Lola)
(Aegagropila)
(Basicladia)
(Bryobesia)
(Chaetomorpha)
シオグサ (Cladophora)
(Cladogonium)
(Cladophorella)
ミドリゲ (Cladophoropsis)
ジュズモ (Chaetomorpha)
(Gemmiphora)
(Hormiscia)
(Pithophora)
(Prolifera)
(Rhizoclonium)
(Wittrockiella)
(Siphonocladales)
(Boodleaceae)
(Boodlea)
(Cladophoropsis)
(Phyllodictyon)
アミハ (Struvea)
(Symniomonas)
(Siphonocladaceae)
(Apjohnia)
マガタマモ (Boergesenia)
(Chamaedoris)
キッコウグサ (Dictyosphaeria)
(Nereodictyon)
(Siphonocladus)
(Struveopsis)
ヴァロニア科 (Valoniaceae)
(Ventricaria)
(Ernodesmis)
(Petrosiphon)
ヴァロニア (Valonia)
(Valoniopsis)
カサノリ目 (Dasycladales)
(Dasycladaceae)
ミズタマ (Bornetella)
ウスガサネ (Cympolia)
(Dasycladus)
イソスギナ (Halicoryne)
フデノホ (Neomeris)
(Xainzanella)
(Polyphysaceae)
カサノリ (Acetabularia)
(Chalmasia)
(Parvocaulis)
(Polyphysa)
(Codiolales)
ハネモ綱 (Bryopsidophyceae)
ハネモ目 (Bryopsidales)
ハネモ科 (Bryopsidaceae)
ハネモ (Bryopsis)
(Blastophysa)
(Bryopsidella)
(Lambia)
(Pseudoderbesia)
(Trichosolen)
(Pseudobryopsis)
ツユノイト科 (Derbesiaceae)
ツユノイト (Derbesia)
(Pedobesia)
ディコトモシフォン科 (Dichotomosiphonaceae)
ディコトモシフォン (Dichotomosiphon)
カエトシフォン科 (Chaetosiphonaceae)
カエトシフォン (Chaetosiphon)
ハゴロモ科 (Udoteaceae)
ハゴロモ (Udotea)
(Avrainvillea)
(Boodleopsis)
(Botryodesmis)
(Chlorodesmis)
(Cladocephalus)
(Flabellia)
(Penicillus)
(Poropsis)
(Pseudochlorodesmis)
(Pseudopenicillus)
(Rhipidosiphon)
(Rhipilia)
(Rhipiliella)
(Rhipiliopsis)
(Rhipocephalus)
(Siphonogramen)
(Tydemania)
サボテングサ科 (Halimedaceae)
サボテングサ (Halimeda)
イワヅタ科 (Caulerpaceae)
イワヅタ (Caulerpa)
(Caulerpella)
ミル科 (Codiaceae)
(Arabicodium)
(Callipsygma)
ミル (Codium)
(Geppella)
(Pseudocodiaceae)
(Pseudocodium)
(Ostreobiaceae)
(Ostreobium)
トレボウクシア藻綱 (Trebouxiophyceae)
(Meyerella)
(Trichophilus)
(Oocystales)
(Eremosphaeraceae)
(Eremosphaera)
(Excentrosphaera)
クロレラ目 (Chlorellales)
クロレラ科 (Chlorellaceae)
クロレラ (Chlorella) 地衣類構成藻類
プロトテカ (Prototheca)
...
トレボウクシア目 (Trebouxiales)
トレボウクシア科 (Trebouxiaceae)
(Pabia)
トレボウクシア (Trebouxia) 地衣共生緑色藻
カワノリ目 (Prasiolales)
カワノリ科 (Prasiolaceae)
(Diplosphaera)
(Hormidium)
(Prasiococcus)
カワノリ (Prasiola) 淡水生
(Prasiolopsis)
(Rosenvingiella)
(Stichococcus)
緑藻綱 (Chlorophyceae) Green algae 350属2500種
(Phaeophilales)
(Phaeophila)
ヨツメモ目 (Tetrasporales)
?(Hypnomonadaceae)
(Actinochloris)
(Hypnomonas)
(Kremastochloris)
(Sphaerellocystis)
(Palmellaceae)
(Palmellopsis)
(Sphaerocystis)
ヨツメモ科 (Tetrasporaceae)
(Gloeodendron)
ヨツメモ (Tetraspora)
クラミドモナス目 (Chlamydomonadale/Volvocales)
?ディスモルフォコックス (Dysmorphococcus)
?アストレフォメネ (Astrephomene)
?ファコトゥス科 (Phacotaceae)
ファコトゥス (Phacotus)
?ドゥナリエラ科 (Dunaliellaceae)
ドゥナリエラ (Dunaliella)
(Hafniomonas)
クラミドモナス科 (Chlamydomonacaceae)
(Brachiomonas)
(Carteria)
(Chlainomonas)
クラミドモナス (Chlamydomonas) 実験生物
クロロモナス (Chloromonas)
(Halosarcinochlamys)
(Lobomonas)
(Oogamochlamys)
(Polytoma)
(Polytomella)
(Pseudocarteria)
(Vitreochlamys)
(Spondylomoraceae)
(Pyrobotrys)
オオヒゲマワリ科 (Volvocaceae)
(Pandorina)
(Eudorina)
ゴニウム (Gonium)
(Platydorina)
(Pleodorina)
オオヒゲマワリ (Volvox)
(Volvulina)
(Yamagishiella)
(Basichlamys)
ハエマトコックス科 (Haematococcaceae)
ハエマトコックス (Haematococcus)
ステファノスファエラ (Stephanosphaera)
(Asteromonadaceae)
(Asteromonas)
テトラバエナ科 (Tetrabaenaceae)
テトラバエナ (Tetrabaena)
(Basichlamys)
(Astrephomenaceae)
(Astrephomene)
(Phacotaceae)
(Phacotus)
(Pteromonas)
クロロコックム目 (Chlorococcales)
?プロトシフォン (Protosiphon)
(Actinochloridaceae)
(Deasonia)
(Characiaceae)
(Actidesmium)
(Bicuspidella)
(Characiella)
(Characiellopsis)
(Characium)
(Coleochlamys)
(Deuterocharacium)
(Lanceola)
(Marthea)
(Pseudochlorothecium)
(Pseudoschroederia)
(Rhopalosolen)
(Characiosiphonaceae)
(Characiosiphon)
(Lobocharacium)
クロロコックム科 (Chlorococcaceae)
クロロコックム (Chlorococcum)
ネオクリロス (Neochloris)
テトラキスティス (Tetracystis)
...
(Coccomyxaceae)
(Dactylothece)
(Dispora)
(Lusitania)
(Nannochloris)
(Ourococcus)
(Palmogloea)
(Dictyosphaeriaceae)
(Botryococcus)
(Dactylosphaerium)
(Dictyosphaerium)
(Dimorphococcopsis)
(Gilbertsmithia)
(Tetracoccus)
(Westella)
(Endosphaeraceae)
(Chlorochytrium)
(Codiolum)
(Gomontia)
(Phyllobium)
(Rhodochytrium)
(Hormotilaceae)
(Dendrocystis)
(Heleococcus)
(Hormotila)
(Palmodactylon)
(Palmodictyon)
(Planochloris)
アミミドロ科 (Hydrodictyaceae)
アミミドロ (Hydrodictyon)
(Paradoxia)
クンショウモ (Pediastum)
(Tetrapedia)
(Micractiniaceae)
(Acathosphaera)
(Echinosphaeridium)
(Golenkinia)
(Golenkiniopsis)
(Micractinium)
(Oocystaceae)
(Amphikrikos)
(Bernardia)
(Diacanthos)
(Kirchneriella)
(Lagertheimia)
(Makinoella)
(Monoraphidium)
(Muriella)
(Mychonastes)
(Nephrocytium)
(Oocystis)
(Pachycladella)
(Planktosphaeria)
(Polyedriopsis)
(Quadrigula)
(Raphidocelis)
(Selenastrum)
(Thorakochloris)
(Treubaria)
(Trigonideella)
(Zoochlorella)
...
(Radiococcaceae)
(Coenocystis)
(Pectodictyon)
(Tomaculum)
...
イカダモ科 (Scenedesmaceae)
(Actinastrum)
(Coelastrum)
(Crucigenia)
(Dicellula)
(Dictoster)
(Pectodictyon)
イカダモ (Scenedesmus)
(Tetradesmus)
(Tetrallantos)
(Tetrastrum)
(Sorastraceae)
(Sorastrum)
(Sphaerodictyaceae)
(Sphaerodictyon)
ヨコワミドロ科 (Sphaeropleaceae)
(Atractomorpha)
(Characiopodium)
ヨコワミドロ (Sphaeroplea)
クロロサルキノプシス目 (Chlorosarcinales)
クロロサルキノプシス (Chlorosarcinopsis)
(Desmochloris)
(Chlorosarcina)
(Neochlorosarcina)
ミクロスポラ目 (Microsporales)
ミクロスポラ (Microspora)
サヤミドロ目 (Oedogoniales)
(Oedocladium)
サヤミドロ (Oedogonium)
ブルボカエテ (Bulvochaete)
キロンドロカプサ目 (Cylindrocapsaceae)
キロンドロカプサ (Cylindrocapsa)
カエトフォラ目 (Chaetophorales)
カエトフォラ科 (Chaetophoraceae)
カエトフォラ (Chaetophora)
フリッティエラ（フリッティモ） (Fritschiella)
スティゲオクロニウム (Stigeoclonium)
ツルギミドロ (Draparnaldia)
アファノカエテ (Aphanochaete)
...
カエトペルティス目 (Chaetopeltidales)
(Floydiella)
カエトペルティス (Chaetopeltis)
ホルモティロプシス (Hormotilopsis)
連鎖植物下界 (Streptophytina/Phragmophytina) ［ルド藻亜門＋車軸藻超門］
?メソスティグマ藻綱 (Mesostigmatophyceae)
?メソスティグマ目 (Mesostigmatales) 従来プラシノ藻綱に含められていた
メソスティグマ (Mesostigma)
ルド藻亜門 (Rudophytae)
始藻綱 (Eophyceae)
列藻亜綱 (Stichophycidae)
クロロキブス目 (Chlorokybales)
クロロキプス (Chlorokybus)
クレブソルミディウム目 (Klebsormidiales)
クレブソルミディウム (Klebsormidium)
(Hormidiella)
エントラシア (Entransia)
ホシミドロ綱 (Zygnematales/Conjugophyceae)
ホシミドロ目 (Zygnematales)
メソタエニウム (Mesotaenium)
ホシミドロ (Zygmema)
アオミドロ (Spirogyra)
ヒザオリ (Mougeotia)
ミカヅキモ (Closterium)
フタボシモ (Cylindrocystis)
ツヅミモ (Cosmarium)
チリモ目 (Desmidiales)
チリモ (Desmidium)
カエテ綱 (Chaetophyceae)
コレオカエテ目 (Coleochaetales)
コレオカエテ（サヤゲモ） (Coleochaete)
カエトスファエリディウム (Chaetosphaeridium)
車軸藻超門 (Charophyta) ［車軸藻綱＋高等植物門］
車軸藻綱 (Charophyceae)
シャジクモ目 (Charales) stoneworts
シャジクモ科 (Characeae)
シャジクモ (Chara)
シラタマモ (Lamprothamnium)
ホシツリモ (Nitellopsis)
フラスコモ (Nitella)
(Tolypella)
高等植物門 (Plantae/Embryophyta) ［コケ植物亜門＋リニア状植物亜門＋繊管束植物亜門］
コケ植物亜門 (Bryophyta) ［側］
!プロトサルヴィニア (Protosalvinia) デヴォン紀前期 藻類とコケ類の中間
!スポロゴニテス(Sporogonites) デヴォン紀前期 ノルウェー
!サロペラ (Salopella) デヴォン紀前期
!スポンギオフィトン (Spongiophyton) デヴォン紀中期 クチクラ層
!トルティリカウリス (Tortilicaulis) デヴォン紀前期
苔類綱 (Hepatopsida/Hepaticae) 現生68科340属8000種
ウロコゴケ亜綱 (Jungermanniidae) 現生56科309属7500種
!パラヴィキニテス (Pallavicinites) デヴォン紀後期
!ディエッテリア (Dietteria) 白亜紀
コマチゴケ目 (Calobryales)
コマチゴケ科 (Haplomitriaceae)
コマチゴケ (Haplomitrium)
ウロコゴケ目 (Jungermanniales)
ムカシウロコゴケ科 (Vetaformaceae)
キリシマゴケ科 (Herbertaceae)
マツバウロコゴケ科 (Pseudolepicoleaceae)
ケバゴケ科 (Trichotemnomaceae)
ムクムクゴケ科 (Trichocoleaceae)
ヤクシマスギバゴケ科 (Lepicoleaceae)
ムチゴケ科 (Lepidoziaceae)
ハガワリイチョウウロコゴケ (Lophozia)
モクズムチゴケ科 (Phycolepidoziaceae)
ツキヌキゴケ科 (Calypogeiaceae)
ケハネゴケモドキ科 (Adelanthaceae)
ヤバネゴケ科 (Cephaloziaceae)
ヤバネゴケ (Cephaloziella)
コヤバネゴケ科 (Cephaloziellaceae)
タカサゴソコマメゴケ科 (Jackiellaceae)
カサナリゴケ科 (Antheliaceae)
ツボミゴケ科 (Jungermanniaceae)
イモイチョウゴケ科 (Mesoptychiaceae)
ミゾゴケ科 (Eremonotus)
ヒシャクゴケ科 (Scapaniaceae)
ウロコゴケ科 (Geocalycaceae)
ウロコゴケ (Jungermannia)
ハネゴケ科 (Plagiochilaceae)
ハネゴケ (Cladonia)
コヤバネゴケモドキ科 (Chonecoleaceae)
アルネルゴケ科 (Arnelliaceae)
チチブイチョウゴケ科 (Acrobolbaceae)
オヤコゴケ科 (Schistochilaceae)
ペルソンゴケ科 (Perssoniellaceae)
ヤクシマゴケ科 (Balantiopsaceae)
ネジミゴケ科 (Gyrothyraceae)
ミズゴケモドキ科 (Pleuroziaceae)
ケビラゴケ科 (Radulaceae)
テガタゴケ科 (Ptilidiaceae)
トゲバゴケ科 (Chaetophyllopsaceae)
サワラゴケ科 (Lepidolaenaceae)
クラマゴケモドキ科 (Porellaceae)
ゲーベルゴケ科 (Goebeliellaceae)
ヤスデゴケ科 (Frullaniaceae)
ヒメウルシゴケ科 (Jubulaceae)
クサリゴケ科 (Lejeuneaceae)
フタマタゴケ目 (Metzgeriales)
トロイブゴケ科 (Treubiaceae)
ウロコゼニゴケ科 (Fossombroniaceae)
ウロコゴケダマシ科 (Phyllothalliaceae)
ミズゼニゴケ科 (Pelliaceae)
ミズゼニゴケ (Pellia)
アリソンゴケ科 (Allisoniaceae)
マキノゴケ科 (Makinoaceae)
クモノスゴケ科 (Pallaviciniaceae)
ウスバゼニゴケ科 (Blasiaceae)
コケシノブダマシ科 (Hymenophytaceae)
スジゴケ科 (Aneuraceae)
テングサゴケ (Riccardia)
スジゴケモドキ科 (Vandiemeniaceae)
フタマタゴケ科 (Metzgeriaceae)
ヌエゴケ科 (Mizutaniaceae)
ゼニゴケ亜綱 (Marchantiidae) 現生12科27属450種
ミミカキゴケ目 (Monocleales)
ミミカキゴケ科 (Monocleaceae)
ダンゴゴケ目 (Sphaerocarpales)
リエラゴケ科 (Riellaceae)
ダンゴゴケ科 (Sphaerocarpaceae)
アワゼニゴケ科 (Monocarpaceae)
ゼニゴケ目 (Marchantiales)
ゼニゴケモドキ科 (Corsiniaceae)
ハマグリゼニゴケ科 (Targioniaceae)
ミカヅキゼニゴケ科 (Lunulariaceae)
アズマゼニゴケ科 (Wiesnerellaceae)
ジャゴケ科 (Conocephalaceae)
ジャゴケ (Conocephalum) アイソザイムにより外部形態が同一なのに多種性が明らかに
ジンガサゴケ科 (Aytoniaceae)
ジンガサゴケ (Reboulia)
ジンチョウゴケ科 (Cleveaceae)
ジャゴケモドキ科 (Exormothecaceae)
ゼニゴケ科 (Marchantiaceae)
ゼニゴケ (Marchantia)
ヤワラゼニゴケ科 (Monosoleniaceae)
ハタケゴケモドキ科 (Oxymitraceae)
ウキゴケ科 (Ricciaceae)
ウキゴケ (Riccia)
イチョウウキゴケ (Ricciocarpus)
ツノゴケ綱 (Anthocerotopsida) 現生400種
ツノゴケ科 (Anthocerotaceae)
ツノゴケ (Anthoceros)
ニワツノゴケ (Phaeoceros)
アシナシツノゴケ (Megaceros)
ツノゴケモドキ科 (Notothyladaceae)
ツノゴケモドキ (Notothylas)
蘇類綱 (Bryopsida) 現生700属1万種
ミズゴケ亜綱 (Sphagnidae)
!プロトスファグヌム (Protosphagnum) ペルム紀後期
ミズゴケ科 (Sphagnaceae)
ミズゴケ (Sphagnum) 遺骸は泥炭に
クロゴケ亜綱 (Andreaeidae)
クロゴケ目 (Andreaeales)
クロゴケ科 (Andreaeaceae)
クロゴケ (Andreaea) 寒冷地中心
ナンジャモンジャゴケ亜綱 (Takakiidae)
ナンジャモンジャゴケ目 (Takakiales) 1科1属2種
ナンジャモンジャゴケ科 (Takakiaceae)
ナンジャモンジャゴケ (Takakia) 1952年名大高木典雄が北アルプスで発見 隔離分布
クロマゴケ目 (Andreaeobryales)
クロマゴケ科 (Andreaeobryaceae)
クロマゴケ (Andreaeobryum)
マゴケ亜綱 (Bryidae)
!ムスキテス (Muscites) 石炭紀前期
ヨツバゴケ目 (Tetraphidales)
キセルゴケ目 (Buxbaumiales)
スギゴケ目 (Polytrichales)
スギゴケ (Polytrichum)
ホウオウゴケ目 (Fissidentales)
ツチゴケ目 (Archidiales)
ツチゴケ (Archidium)
シッポゴケ目 (Dicranales)
センボンゴケ目 (Pottiales)
ギボウシゴケ目 (Grimmiales)
ヒョウタンゴケ目 (Funariales)
ヒョウタンゴケ (Funaria)
ヒカリゴケ目 (Schistostegales)
マゴケ目 (Bryales)
ヒノキゴケ (Pyrrhobryum)
タチヒダゴケ目 (Orthotrichales)
イヌマゴケ目 (Isobryales)
アブラゴケ目 (Hookeriales)
シトネゴケ目 (Hypnobryales)
多胞子嚢植物 ［リニア状植物亜門＋繊管束植物亜門］
!リニア状植物亜門 () シルル紀後期〜デヴォン紀中期
!クークソニア (Cooksonia)
!アグラオフィトン (Aglaophyton)
繊管束植物亜門 (Tracheophyta) Vascular Plants シルル紀後期〜現在
!ゾステロフィルム綱 (Zosterophyllopsida) シルル紀後期〜デヴォン紀中期
!ゾステロフィルム (Zosterophyllales)
!サウドニア (Sawdonia)
!クレナチカウリス (Crenaticaulis)
!カウランギオフィトン (Kaulangiophyton)
ヒカゲノカズラ綱 (Lycopsida) 古くは小葉植物綱 (Microphyllophyta) デヴォン紀〜現在
無舌類 (Aglossopsida) （ヒカゲノカズラ類 (Lycopsida)）デヴォン紀〜現在
ドレパノフィクス目 (Drepanophycales)
!ドレバノフィクス (Drepanophycus)
!バラグワナティア (Baragwanathia) デヴォン紀前期
!アステロキシロン (Asteroxylon)
ヒカゲノカズラ目 (Lycopodiales) 現生1科4属(or1属)400種
ヒカゲノカズラ科 (Lycopodiaceae)
ヒカゲノカズラ (Lycopodium) Clubmosses
トウゲシバ (Huperzia)
(Phylloglossum)
小舌類（有舌類） (Glossopsida) デヴォン紀〜現在
!古生リンボク目 (Protolepidodendrales) デヴォン紀
!プロトレピトデンドロン (Protolepidodendron)
!レクレルキア (Leclercqia)
!リンボク目 (Lepidodendrales) デヴォン紀後期〜石炭紀 大木
!リンボク (Lepidodendron) 石炭紀 欧・北米
!スティグマリア (Stigmaria)
!レピドストロプス (Lepidostrobus)
!レピドカルポン (Lepidocarpon)
!キャロネリア (Cyaloneria) 石炭紀
!パウロデンドロン (Paurodendron) 石炭紀
!フウインボク (Sigillaria) 石炭紀後期
ミズニラ目 (Isoetales) 現生1科1属150種 水生
!プレウロメイア (Pleuromeia) 三畳紀 別目?
!ナトルスティアナ (Nathorstiana) 白亜紀
ミズニラ (Isoetes)
イワヒバ目 (Selaginellales) 現生1科1属700種 担根体・不定根
イワヒバ (Selaginella)
!リニア綱 (Rhyniopsida) デヴォン紀
!リニア (Rhynia)
!ホルネオフイトン (Horneophyton)
!レナリア (Renalia)
真葉植物類 (Euphyllophytina) ［トリメロフィトン綱＋クラドキシロン綱＋シダ綱＋木質植物類］
!?トリメロフィトン綱 (Trimerophytopsida) デヴォン紀 より原始的?
!トリメロフィトン (Trimerophyton)
!プシロフィトン (Psilophyton) デヴォン紀前期
!ペルチカ (Pertica)
!オーカンプサ (Oocampsa)
シダ上綱 (Moniliformopses)
!クラドキシロン綱 (Cladoxylopsida) デヴォン紀中期〜石炭紀前期
!クラドキシロン目 (Cladoxylales)
!クラドキシロン (Cladoxylon) デヴォン紀後期〜石炭紀前期
!(Pseudosporochnales)
!(Pseudosporochnus) Goe, Belgium 392Ma
!(Wattieza) デヴォン紀中期 Gilboa 最古の巨木 樹高 8m以上 根株は Eospermatopteris として19Cに記載．Stein et al.,2007: Nature 446 904 が同定．
!ヒエニア目 (Hyeniales)
!ヒエニア (Hyenia)
!(Calamophyton)
!イリドプテリス目 (Iridopteridales)
!(Ibyka)
!(Arachnoxylon)
!ラコフィトン目 (Rhacophytales) デヴォン紀中後期
!ラコフィトン (Rhacophyton) デヴォン紀後期 米(REd Hill)
!(Protocephalopteris)
!(Protopteridopyton)
!スタウロプテリス目 (Stauropteridales)
!ジゴプテリス目(Zygopteridales) デヴォン紀〜ペルム紀
マツバラン亜綱 (Psilotophyta) （旧真曩シダ・ハナヤスリ目含む）
マツバラン目 (Psilotales) Whisk Ferns 2科2属15種 地下茎・仮根のみ
マツバラン科 (Psilotaceae)
マツバラン (Psilotum) 胞子嚢3室 2種
イヌナンカクラン科 (Tmesipteridaceae)
イヌナンカクラン (Tmesipteris) オセアニア 胞子嚢2室 13種
ハナヤスリ目 (Ophioglossales)
ハナヤスリ科 (Ophioglossaceae)
ハナヤスリ (Ophioglossum)
ハナワラビ (Botrychium)
(Japanobotrychium)
(Sceptridium)
有節植物亜綱 (Sphenopsida) （旧真曩シダ・リュウビンタイ目含む）
!スタウロプテリス目 (Stauropteridales)
!スタウロプテリス ()Stauropteris 石炭紀
!ジゴプテリス目 (Zygopteridales)
!ジゴプテリス (Zygopteris) 石炭紀〜ペルム紀
リュウビンタイ目 (Marattiales)
プサロニウス科 (Psaroniaceae)
リュウビンタイ科 (Marattiaceae)
(Debaea)
リュウビンタイ (Angiopteris)
リュウビンタイモドキ (Marattia)
トクサ類
!プセウドボルニア目 (Pseudoborniales)
!プセウドボルニア (Pseudobornia)
!スフェノフィルム目 (Sphenophyllales) デヴォン紀後期〜石炭紀
!スフェノフィルム (Sphenophyllum) 石炭紀後期
!(Hamatophyton)
!(Palaeostachya)
!(Calamostachys)
!(Tetrafolia)
!(Archaeocalamites)
!(bowmanites)
!(Xihuphyllum)
!(Sphenophyllostachys)
!(Eviostachya)
!(Rotafolia) デヴォン紀後期 中国
トクサ目 (Equisetales) Horse Tails デヴォン紀後期〜現在 薄曩シダ亜綱と姉妹群か 1属15種
!?(Nododendron) 三畳紀 Au
!アルカエオカラミテス科 (Archaeocalamitaceae)
!ロボク科 (Calamitaceae)
!ロボク（廬木） (Calamites) 石炭紀 30m
!アンヌラリア (Annularia) 石炭紀
!ネオカラミテス (Neocalamites) 三畳紀
トクサ科 (Equisetaceae)
!エクイセティス (Equisetites) 三畳紀 中国 茎の節から葉が輪生
トクサ (Equisetum) horsetail スギナ含む 珪素が表皮に沈着し研磨剤となる 胞子嚢穂はツクシ
薄曩シダ亜綱 (Polypodiidae/Leptosporangiatidae) Leptosporangiate ferns
シダ目 (Filicales) 現生1万種 デヴォン紀後期〜現在
現生分類不詳
ストロマトプテリス科 (Stromatopteridaceae)
ストロマトプテリス (Stromatopteris)
ロクソマ科 (Loxomataceae)
ロクソマ (Loxsoma)
ヒメノフィロプシス科 (Hymenophyllopsidaceae)
ヒメノフィロプシス (Hymenophyllopsis)
ゼンマイ科 (Osmundaceae)
!トディテス (Todites) 三畳紀
ゼンマイ (Osmunda) 食用
コケシノブ科 (Hymenophyllaceae)
コケシノブ (Hymenophyllum)
アオホラゴケ (Crepidomanes)
ソテツホラゴケ (Cephalomanes)
ゼニゴケシダ (Trichomanes)
ウラジロ類
ウラジロ科 (Gleicheniaceae)
ウラジロ (Gleichenia)
ユシダ (Dicranopteris)
マトニア科 (Matoniaceae)
スジヒトツバ科 (Cheiropleuriaceae)
ヤブレガサウラボシ科 (Dipteridaceae) 三畳紀〜現在
!タウマトプテリス (Thaumatopteris) 三畳紀後期 山口
ヤブレガサウラボシ (Dipteris) 先島諸島・東南亜・ヒマラヤ・NAu
(Phanerosorus)
フサシダ科 (Schizaeaceae)
フサシダ (Schizaea)
カニクサ (Lygodium)
水生シダ類 Heterosporous water ferns
デンジソウ科 (Marsileaceae)
デンジソウ (Marsilea)
サンショウモ科 (Salviniaceae)
サンショウモ (Salvinia)
アカウキクサ科 (Azollaceae)
アカウキクサ (Azolla)
木生シダ類 tree ferns
キジノオシダ科 (Plagiogyriaceae)
キジノオ (Plagiogyria)
ヘゴ科 (Cyatheaceae)
ヘゴ (Cyathea)
タカワラビ科 (Dicksoniaceae)
デックソニア (Dicksonia)
タカワラビ (Cibotium)
'Polypodiaceous' ferns
ホングウシダ科 (Lindsaeaceae)
ホングウシダ (Lindsaea)
ホラシノブ (Sphenomeris)
イノモトソウ科 (Pteridaceae)
ミミモチシダ (Acrostichum)
イノモトソウ (Pteris)
ホウライシダ科 (Adiantaceae)
ミズワラビ (Ceratopteris)
ヒメウラジロ (Cheilanthes)
ホウライシダ (Adiantum)
シシラン科 (Vittariaceae)
シシラン (Vittaria)
タキミシダ (Antrophyum)
コバノイシカグマ科 (Dennstaedtiaceae)
コバノイシカグマ (Dennstaedtia)
ワラビ (Pteridium) 食用
チャセンシダ科 (Aspleniaceae)
チャセンシダ (Asplenium)
ホウビシダ (Hymenasplenium)
シシガシラ科 (Blechnaceae)
シシガシラ (Blechnum)
コモチシダ (Woodwardia)
ヒメシダ科 (Thelypteridaceae)
ヒメシダ (Thelypteris)
ミゾシダ (Stegnogramma)
メシダ科（イワデンタ科） (Athyriaceae/Woodsiaceae)
シケシダ (Deparia)
メシダ (Athyrium)
イワデンタ (Woodsia)
コウヤワラビ (Onoclea)
クワレシダ (Diplazium) 東南亜 食用
オシダ科 (Dryopteridaceae)
オシダ (Dryopteris)
ヤブソテツ (Cyrtomium)
クサソテツ (Matteucia) Ostrich fern 食用（コゴミ）
ツルキジノオ科 (Lomariopsidaceae)
タマシダ科 （ツルシダ科に含める考えあり）
タマシダ (Nephrolepis)
ツルシダ科 (Oleandraceae)
ツルシダ (Oleandra)
シノブ科 (Davalliaceae)
シノブ (Davallia)
ヒメウラボシ科 (Grammitidaceae)
ヒメウラボシ (Grammitis)
オオクボシダ (Xiphopteris)
ウラボシ科 (Polypodiaceae)
ヒトツバ (Pyrrosia)
ノキシノブ (Lepisorus)
イワヒトデ (Colysis)
ウラボシ（アオネカズラ） (Polypodium)
木質植物類 ［前裸子植物亜綱＋種子植物下門］
!前裸子植物亜綱 (Progymnospermophyta) デヴォン紀後期〜石炭紀前期
!アネウロフィトン類 (Aneurophytales)
!アネウロフィトン (Aneurophyton)
!アルカエオプテリス類 (Archaeopteridales)
!アルカエオプテリス (Archaeopteris) 380-360Ma 最初の巨木 枝ごと落葉 動物上陸を誘導
!カリキシロン (Callixylon)
!プロトピチス類 (Protopityales)
!プロトピチス (Protopitys)
種子植物下門 (Spermatophytata) seed plants ［裸子植物上綱＋被子植物上綱］
裸子植物上綱 (Gymnosperma/Gymnospermophyta) 側系統
!初期シダ種子類 デヴォン紀後期 前胚珠
!エルキンシア (Erkinsia)
!モレスチネア (Moresnetia)
!アルカエオスペルマ (Archaeosperma)
!シダ種子綱 (Pteridospermopsida) 石炭紀〜ペルム紀
!ペコプテリス (Pecopteris) 石炭紀〜ペルム紀
!ニューロプテリス (Neuropteris) 石炭紀
!カラモピチス目 (Calamopityales)
!ブテオキシロン目 (Buteoxylonales)
!メドゥロサ目 (Medulossales)
!メドゥロサ (Medullosa) 石炭紀 ソテツ系の祖先
!リギノプテリス目 (Lyginopteridales)
!リギノラキス (Lyginorachis) 石炭紀 針葉樹系の祖先
!キカデオイデア（ベネチテス）綱 (Cycadeoidopsida) 三畳紀〜白亜紀
!キカデオイデア科 (Cycadeoidaceae)
!プテロフィルム (Pterophyllum) 白亜紀前期
!キカデオイデア (Cycadeoidea) 最初の花と相似な生殖器官
!ウィリアムソニア科 (WiIliamsoniaceae)
!ウィリアムソニエラ (Williamsoniella) 白亜紀前期 中国
!ウィリアムソニア (Williamsonia)
ソテツ綱 (Cycadopsida) 現生4科11属137種 ペルム紀後期〜現在
ソテツ目 (Cycadales)
ソテツ科 (Cycadaceae)
ソテツ (Cycas)
ボウエニア科 (Boweniaceae)
ボウエニア (Baenia)
スタンゲリア科 (Stangeriaceae)
スタンゲリア (Stangeria)
ザミア科 (Zamiaceae)
(Encephalartoideae)
(Dioon)
(Encephalartos)
(Macrozamia)
(Lepidozamia)
ザミア亜科 (Zamioideae)
(Ceratozamia)
(Microcycas)
ザミア（フロリダソテツ） (Zamia)
(Chigua)
イチョウ綱 (Ginkgopsida) 現生1種のみ ペルム紀後期〜現在
!トリコピティス (Trichopitys) ペルム紀
イチョウ目 (Ginkgoales)
イチョウ科 (Ginkgoaceae)
イチョウ (Ginkgo) 唯一の現生種
!コルダイテス綱 (Cordaitopsida) 石炭紀中期〜ペルム紀
!コルダイテス (Cordaites)
!ヴォルチア綱 (Voltziopsida) 石炭紀末期〜ジュラ紀前期
!ヴォルチア (Voltzia)
!レバキア (Lebachia)
!ウトレクチア (Utrechtia)
球果植物綱（針葉樹類） (Coniferopsida) 現生8科68属540種 三畳紀後期〜現在
球果植物目 (Coniferales) (Pinales) Conifer
!?スキゾレピス (Schizolepis) 白亜紀前期 熱河生物群
!?パジオフィルム (Pagiophyllum) 白亜紀前期 熱河生物群
!?ピティオクラドゥス (Pityocladus) 白亜紀前期 熱河生物群
!?リャオニンゴクラドゥス (Liaoningocladus) 白亜紀前期 熱河生物群
ナンヨウスギ科 (Araucariaceae) 3属 ほとんどが南半球
ナンヨウスギ (Araucaria) メラネシア
カウリ (Agathis) 東南ア・NG・メラネシア
ウォレミマツ (Wollemia) Wollemi Pine, Jullasic Tree ジュラ紀〜現代 Au・NSW・Wollemi国立公園 1994年発見 花博
イヌガヤ科 (Cephalotaxaceae) 1属
イヌガヤ (Cephalotaxus)
ヒノキ科 (Cupressaceae)
スギ系統 (Taxodiaceae) 側系統
コウヨウザン亜科 (Cunninghamioideae)
コウヨウザン・ランダイスギ (Cunninghamia)
タイワンスギ亜科 (Taiwanioideae)
タイワンスギ (Taiwania)
(Athrotaxidoideae)
(Athrotaxis)
セコイア亜科 (Sequoioideae)
メタセコイア（アケボノスギ） (Metasequoia)
セコイア (Sequoia)
セコイアデンドロン (Sequoiadendron)
スギ亜科 (Taxodioideae)
スギ (Cryptomeria)
ヌマスギ（ラクウショウ）(Taxodium)
イヌスギ（スイショウ） (Glyptostrobus)
ヒノキ系統 (Cupressaceae)
(Callitroideae)
(Libocedrus)
(Widdringtonia)
(Diselma)
(Neocallitropsis)
(Callitris)
ヒノキ亜科 (Cupressoideae)
クロベ (Thuja)
アスナロ (Thujopsis)
ヒノキ (Chamaecyparis)
ビャクシン (Juniperus)
イトスギ (Cupressus)
カロセドルス (Calocedrus)
(Tetraclinis)
(Platycladus)
マイクロビオタ (Microbiota)
マツ科 (Pinaceae)
マツ亜科 (Pinoideae)
マツ (Pinus)
トウヒ亜科 (Piceoideae)
トウヒ (Picea)
カラマツ亜科 (Laricoideae)
(Cathaya)
カラマツ (Larix)
トガサワラ (Psudotsuga)
モミ亜科 (Abietoideae)
モミ (Abies)
ツガ (Tsuga)
ヒマラヤスギ (Cedrus)
ユサン（アブラスギ） (Keteleeria)
(Nothotsuga)
イヌカラマツ (Pseudolarix)
マキ科（イヌマキ科） (Podocarpaceae)
(Phyllocladus) インドネシア・NG・NZ・Ts 独立科？
(Acmopyle) ニューカレドニア
(Afrocarpus) Af
(Dacrycarpus) 東南亜・メラネシア
(Dacrydium) 東南亜・メラネシア・南米
(Falcatifolium) 東南亜
(Halocarpus) NZ
(Lagarostrobos) Ts
(Lepidothamnus) チリ・NZ
(Manoao) NZ
(Microcachrys) Ts
(Microstrobos) Au
(Nageia) 全世界熱帯
(Parasitaxus) ニューカレドニア
マキ (Podocarpus) 全世界温熱帯
(Prumnopitys) Au・ニューカレドニア・NZ・中南米
ミズマキ (Retrophyllum) マレーシア・ニューカレドニア・南米北部
サクセゴタエア (Saxsegotaea) チリ・Arg
(Sundacarpus) 東南亜・NG・Au
イヌガヤ科 (Cephalotaxaceae)
イヌガヤ (Cephalotaxus)
コウヤマキ科 (Sciadopityaceae) 日本固有科 1属1種
コウヤマキ (Sciadopitys) 日本
イチイ科 (Taxaceae) 独立した目 (Taxales) とする考え方あり
(Amentotaxus) 中国・印・ヴェトナム
ニューカレドニアイチイ (Austrotaxus) New Caledonia yew
(Pseudotaxus) 中国
イチイ (Taxus) Yew 欧・亜・北米 7種
カヤ (Torreya) 中国・日本・米国
グネツム（マオウ）綱 (Gnetopsida) 三畳紀後期（花粉）／白亜紀（大型化石）〜現在
グネツム（マオウ）目 (Gnetales) 現生3科3属
グネツム科 (Gnetaceae) 現生1属
グネツム (Gnetum) 30種
マオウ科 (Ephedraceae) 現生1属
!エフェドリテス (Ephedrites) 白亜紀前期 熱河生物群 退化した葉鞘
マオウ (Ephedra)
ウェルウィッチア科 (Welwitschiaceae) 現生1属
!(Gurvanella)
ウィルウィッチア（サバクオモト） (Welwitschia)
!グロッソプテリス綱 (Glossopteridopsida) ペルム紀〜三畳紀
!グロッソプテリス (Glossopteris)
!ペントキシロン綱 (Pentoxylopsida) ジュラ紀〜白亜紀初期
!ペントキシロン (Pentoxylon)
!カイトニア綱 (Caytoniopsida) 三畳紀後期〜白亜紀初期
!カイトニア (Caytonia/Sagenopteris)
!チェカノウスキア綱 (Czekanowskiopsida) ジュラ紀〜白亜紀初期
!チェカノウスキア (Czekanowskia) 白亜紀前期 中国
!レプトストロブス (Leptostrobus) 白亜紀前期 中国
被子植物上綱 (Angiospermae/Anthophyta/Magnoliophyta) 400科23.5万種 白亜紀〜現在 基本的に APG 1998, Soltis et al. 2000 (18SrDNA, rbcL, atpB による分子系統)
?!アーケオフラクトゥス (Archaefructus) 白亜紀前期 熱河生物群
?ラフレシア科 (Rafflesiaceae)
?ヒドノラ科 (Hydnoraceae)
アムボレラ目 (Amborellales)
アムボレラ科 (Amborellaceae)
アムボレラ (Amborella) ニューカレドニア山岳地
スイレン目 (Nymphaeales) Water lilies 現生8属60種 + ヒダテラ科
ヒダテラ科 (Hydatellaceae) Au,印 Saarela et al. 2002 Nature 446 312 旧イネ目
ヒダテラ (Hydatella)
トリツリア (Trithuria)
ハゴロモモ科 (Cabombaceae)
ハゴロモモ (Cabomba) Fanworts
ジュンサイ (Brasenia) Watershields
スイレン科 (Nymphaeaceae)
コウホネ (Nuphar) Spatterdocks, Pond lilies. Cow lilies
バルクラヤ (Barclaya)
スイレン亜科 (Nymphaeoideae)
(Ondinea)
スイレン (Nymphaea) Water lilies
オニバス (Euryale) Prickly water lily, Gorgon plant
オオオニバス (Victoria) Giant water lilies
アウストロバイレヤ（シキミ）目 (Austrobaileyales/Illiciales) 類縁を含め拡大
アウストロバイレヤ科 (Austrobaileyaceae)
アウストロバイレイヤ (Austrobaileya)
トリメニア科 (Trimeniaceae) ニューギニア・フィジー・Au
トリメニア (Trimenia)
シキミ科 (Illiciaceae) 現生1属40種 東亜・北米
シキミ (Illicium)
マツブサ科 (Schisandraceae) 現生2属50種 亜・北米
マツブサ (Schisandra)
サネカズラ (Kadsura)
センリョウ（チャラン）目 (Chloranthales)
センリョウ（チャラン）科 (Chloranthaceae) 現生5属約75種
(Hedyosmum)
(Ascarina)
センリョウ (Sarcandra)
ヒトリシズカ (Chloranthus)
真被子植物綱 (Euangiosperms）［｛マツモ目＋単子葉亜綱＋真正モクレン亜綱｝＋真正子葉類］
マツモ目 (Ceratophyllales)
マツモ科 (Ceratophyllaceae)
マツモ (Ceratophyllum)
単子葉亜綱 (Monocotyledons) 現生10目65科5万種 精油細胞あり
?コルシア科 (Corsiaceae)
?ホンゴウソウ科 (Triuridaceae)
ホンゴウソウ (Sciaphila)
ショウブ目 (Acorales)
ショウブ科 (Acoraceae)
ショウブ (Acorus) 最も原始的な単子葉類
オモダカ目 (Alismatales)
サトイモ科 (Araceae) ウキクサ科(Lemnaceae)を含む
サトイモ (Colocasia) 食用（サトイモ・タロ）
リョクチク (Aglaonema)
ミズバショウ (Lysichiton)
フィロデンドロン (Philodendron)
アオウキクサ (Lemna)
ウキクサ (Spirodela)
ミジンコウキクサ (Wolfia)
ハナイ科 (Butomaceae)
ハナイ (Butomus )
ヘラオモダカ科 (Alismataceae) (Limnocharitaceae)を含む
トチカガミ科 (Hydrocharitaceae)
トチカガミ (Hydrocharis)
イバラモ科 (Najadaceae)
イバラモ (Najas)
レースソウ科 (Aponogetonaceae)
(Posidoniaceae)
(Cymodoceaceae)
カワツルモ科 (Ruppiaceae)
カワツルモ (Ruppia)
(Juncaginaceae)
(Lilaeaceae)
アマモ科 (Zosteraceae)
アマモ (Zostera)
ヒルムシロ科 (Potamogetonaceae)
ヒルムシロ (Potamogeton)
イトクズモ科 (Zannichelliaceae)
イトクズモ (Zannichellia)
?キンコウカ目 (Nartheciales)
キンコウカ科 (Nartheciaceae)
サクライソウ科 (Petrosaviaceae)
(Japanolirion) Japanoliriaceae?
サクライソウ (Petrosavia)
?ソクシンラン (Aletris)
ユリ亜綱 (Liliidae)
ヤマノイモ目 (Dioscoreales)
?(Thismiaceae)
?(Trichopodaceae)
ヒナノシャクジョウ科 (Burmanniaceae)
ヒナノシャクジョウ (Burmannia)
ヤマノイモ科 (Dioscoreaceae)
(Borderea)
ヤマノイモ (Dioscorea) 食用（山芋，ヤム）
(Tamus)
タシロイモ科 (Taccaceae)
タシロイモ (Tacca)
タコノキ目 (Pandanales)
ビャクブ科 (Stemonaceae)
ヴェロジア科 (Velloziaceae)
タコノキ科 (Pandanaceae)
タコノキ (Pandanus)
パナマソウ科 (Cyclanthaceae)
パナマソウ (Carludovica)
ユリ目 (Liliales)
?("Uvulariaceae")
?カロコルトス科 (Calochortaceae) 北米
?(Campynemataceae)
?(Luzuriagaceae)
?(Philesiaceae)
?(Ripogonaceae)
メランチウム科 (Melanthiaceae) 北米
(Chamaelirium)
エンレイソウ (Trillium)
(Xerophyllum)
ユリズイセン科 (Alstroemeriaceae)
イヌサフラン科 (Colchicaceae)
イヌサフラン (Colchicum)
シオデ（サルトリイバラ）科 (Smilacaceae)
(Smilax)
ユリ科 (Liliaceae)
ギボウシ (Hosta)
クサスギカズラ (Asparagus) 食用（アスパラガス）
シオデ (Smilax)
ネギ (Allium) 食用（葱類，タマネギ，大蒜，ラッキョウ）
ユリ (Lilium)
クサスギカズラ目 (Asparagales)
?(Anemarrhenaceae)
?(Aphyllanthaceae)
?(Doryanthaceae)
?(Eriospermaceae)
?(Herreriaceae)
?(Hesperocallidaceae)
?(Lanariaceae)
?(Lomandraceae)
ラン科 (Orchidaceae)
(Blandfordiaceae)
(Boryaceae)
(Asteliaceae)
キンバイザサ科 (Hypoxidaceae)
“クサキカズラ亜目”
(Tecophilaeaceae)
(Ixiolirionaceae)
アヤメ科 (Iridaceae)
“クサスギカズラ下目”
(Xeronemataceae)
“リュウゼツラン上科”
(Anthericaceae)
(Behniaceae)
リュウゼツラン科 (Agavaceae)
ゲッカコウ（チューベローズ） (Polianthes)
ススキノキ科 (Xanthorrhoeaceae)
ヒガンバナ科 (Amaryllidaceae)
ネギ科 (Alliaceae)
クサスギカズラ科 (Asparagaceae)
“ヒヤシンス上科”
(Themidaceae)
ヒアシンス科 (Hyacinthaceae)
スズラン科 (Convallariaceae)
?ツルボラン科 (Asphodelaceae)
?アガパンサス科 (Agapanthaceae)
?キスゲ科 (Hemerocallidaceae)
ツユクサ亜綱 (Commelinidae)
?(Abolbodaceae)
?(Hanguanaceae)
?(Mayacaceae)
?(Rapateaceae)
(Dasypogonaceae)
(Dasypogon)
(Calectasia)
ヤシ目 (Arecales)
ヤシ科 (Arecaceae/Palmae)
ビンロウ (Areca)
アブラヤシ (Elaeis)
フェニックス (Phoenix) ナツメヤシ
(Pritchardia)
(Raphia)
サゴヤシ (Metoxylon) 樹幹に澱粉蓄積
ココヤシ (Cocos) 熱帯各地 常緑高木
シュロチク (Phapis)
シュロ (Trachycarpus)
イネ目 (Poales)
?(Anarthriaceae)
?(Ecdeiocoleaceae)
?ホシクサ科 (Eriocaulaceae)
?(Prioniaceae)
パイナップル亜目 (Bromeliadae)
パイナップル科 (Bromeliaceae)
(Glomeropitcairnia)
(Aechmea)
(Puya)
ミクリ科 (Sparganiaceae) ガマ科 (Typhaceae) を含む
ミクリ (Sparganium)
イネ亜目 (Poadae)
“イグサ下目”
トウエンソウ科 (Xyridaceae)
トウエンソウ (Xyris)
“イグサ上科”
?ツルニア科 (Thurniaceae)
イグサ科 (Juncaceae)
カヤツリグサ科 (Cyperaceae)
“イネ下目”
?ジョインビレア科 (Joinvilleaceae)
カツマダソウ科 (Centrolepidaceae)
トウツルモドキ科 (Flagellariaceae)
サンアソウ科 (Restionaceae)
イネ科 (Poaceae/Gramineae) 600属9500種
コムギ (Triticum) 主要穀類
ムギ (Avena) 主要穀類
イネ (Oryza) 主要穀類
キビ (Panicum)
ヒエ (Echinochloa)
サトウキビ (Saccharum)
ライムギ (Secale)
ススキ (Miscanthus)
ヨシ (Phragmites)
メヒシバ (Digitaria)
オヒシバ (Eleusine)
エノコログサ (Setaria)
レモングラス (Cymbopogon)
ヴェティヴァー (Vetiveria)
イチゴツナギ (Poa)
クリノイガ (Cenchrus)
トウモロコシ (Zea) 主要穀類
シバ (Zoysia)
マダケ (Phyllostachys)
メダケ (Pleioblastus)
ササ (Sasa)
アズマザサ (Sasaella)
スズタケ (Sasamorpha)
オカメザサ (Shibataea)
ツユクサ目 (Commelinales)
タヌキアヤメ科 (Phylidraceae)
(Helmholtzia)
(Philydrella)
“ツユクサ上科”
ツユクサ科 (Commelinaceae)
?ハエモドラム科 (Haemodoraceae)
カンガルーポー (Angozanthos) Kangaroo paw
(Lachnanthse) Blood lily
ミズアオイ科 (Pontederiaceae)
ホテイアオイ (Eichhornia)
コナギ (Monochoria)
(Pontederia)
ショウガ目 (Zingiberales)
オウムバナ科 (Heliconiaceae)
カンナ科 (Cannaceae)
クズウコン科 (Marantaceae)
クズウコン (Maranta)
クテナンテ (Ctenanthe)
カラテア (Calathea)
バショウ科 (Musaceae)
バショウ (Musa) 食用（バナナ）
“ロウイア上科”
ロウイア科 (Lowiaceae)
ゴクラクチョウカ科 (Strelitziaceae)
オオホザキアヤメ科 (Costaceae)
ショウガ科 (Zingiberaceae)
ショウガ (Zingiber) 食用（ミョウガ）
真正モクレン亜綱 (Eumagnoliidae)
カネラ（シキミモドキ）目 (Canellales/Winterales) 9属100種
シキミモドキ科 (Winteraceae) 無道管
(Tasmania)
シキミモドキ (Drymis)
(Zygozynum)
カネラ科 (Canellaceae)
カネラ (Canella)
(Cinnamodendron)
コショウ目 (Piperales)
?ラクトリス科 (Lactoridaceae)
コショウ亜目
コショウ科 (Piperaceae) 現生10属約1500種 汎熱帯・亜熱帯
コショウ (Piper)
(Peperomia)
ドクダミ科 (Saururaceae) 現生5属7種 東亜・北米
(Saururus)
ドクダミ (Houttuuynia)
ウマノスズグサ亜目 (Aristolochiadae) 現生1科
ウマノスズグサ科 (Aristolochiaceae) 現生10属60種
ウマノスズグサ (Aristolochia) 左右相称花被
モクレン目 (Magnoliales) 現生7科3000種 木本性
“ニクズク亜目”
ニクズク科 (Myristicaceae)
ニクズク (Myristica)
(Knema)
“モクレン亜目”
“デゲネリア上科”
デゲネリア科 (Degeneriaceae)
デゲネリア (Degeneria) フィジー
ヒマンタンドラ科 (Himantandraceae)
(Galbulimima)
“モクレン上科”
モクレン科 (Magnoliaceae) 現生12属200種
モクレン (Magnolia)
(Manglietia)
(Liriodendron)
“バンレイシ上科”
エウポマティア科 (Eupomatiaceae)
エウポマティア (Eupomatia)
バンレイシ科 (Annonaceae) 現生130属2300種 汎熱帯
バンレイシ (Annona)
(Asimina)
クスノキ目 (Laurales) 現生6科約2500種
?(Siparunaceae)
“ロウバイ亜目”
ロウバイ科 (Calycanthaceae)
(Calycanthus)
イディオスペルマ (Idiospermum)
ロウバイ (Chimonanthus)
“クスノキ亜目”
ハスノハギリ科 (Hernandiaceae)
クスノキ科 (Lauraceae) 現生約2000種 ほとんど木本性
クスノキ (Cinnamomum)
スナズル (Cassytha) 寄生つる植物
“ゴモルテガ上科”
(Atherospermataceae)
(Laurellia)
ゴモルテガ科 (Gomortegaceae)
ゴモルテガ (Gomortega)
モニミア科 (Monimiaceae) 現生450種 汎熱帯
(Pneumus)
(Hedycarya)
真正双子葉類（三溝型花粉類） (Eudicots/Tricolpates)
キンポウゲ目 (Ranunculales)
フサザクラ科 (Eupteleaceae)
フサザクラ (Euptelea)
ケシ科 (Papaveraceae) 45属600種 北半球温帯・SAf エンゴサク科 (Fumariaceae)含む
キンポウゲ亜目
キルカエアステル科 (Circaeasteraceae) 2属2種 東南亜
キルカエアステル (Circaeaster)
アケビ科 (Lardizabalaceae) 現生8属30種 東亜・北米
サルゲントカズラ亜科 1属1種
サルゲントカズラ (Sargentodoxa) 中国・インドシナ
アケビ亜科
キンポウゲ上科
ツヅラフジ科 (Menispermaceae) 現生70属400種 つる性 熱帯
メギ科 (Berberidaceae) 13属650種 北半球温帯
キンポウゲ科 (Ranunculaceae) 現生50属2000種 北半球温帯
キンポウゲ (Ranunculus)
トリカブト (Aconitum) monk's hood 根茎に猛毒アルカロイド（アコニチン）含有 ブスの語源
アオカズラ目 (Sabiales)
アオカズラ科 (Sabiaceae)
アオカズラ (Sabia)
ヤマモガシ目 (Proteales)
ハス科 (Nelumbonaceae)
ハス (Nelumbo) 旧スイレン科
ヤマモガシ上科
プラタナス（スズカケノキ）科 (Platanaceae) 1属6種
プラタナス（スズカケノキ） (Platanus)
ヤマモガシ科 (Proteaceae)
ギンヨウジュ (Leucadendron) Silver tree
ヤマモガシ (Helicia)
(Grevellea) Au
（広義）コア真正双子葉類
ヤマグルマ目 (Trochodendrales) 無道管
スイセイジュ科 (Tetracentraceae) 1属1種 風媒花
スイセイジュ (Tetracentron)
ヤマグルマ科 (Trochodendraceae) 1属1種 虫媒花
ヤマグルマ (Trochodendron)
ディディメルス目 (Didymelales)
ディディメルス科 (Didymelaceae)
ディディメルス (Didymeles)
ツゲ科 (Buxaceae)
ツゲ (Buxus)
(Pachysandra)
コア真正双子葉類 (Core Eudicots)
?(Myrothamnaceae)
グンネラ目 (Gunnerales)
ミロタムヌス科 (Myrothamnaceae)
ミロタムヌス (Myrothamnus)
グンネラ科 (Gunneraceae)
グンネラ (Gunnera)
アエクストキシコン目 (Aextoxicales)
アエクストキシコン科 (Aextoxicaceae)
アエクストキシコン (Aextoxicon)
(Berberridopsidaceae)
(Berberidopsis)
ビャクダン目 (Santalales)
?ミソデンドロン科 (Misodendraceae)
ボロボロノキ科 (Olacaceae)
ボロボロノキ (Schoepfia)
“ビャクダン亜目”
カナビキボク科 (Opiliaceae)
カナビキボク (Opilia)
“ビャクダン上科”
マツグミ科 (Loranthaceae)
ヤドリギ亜科
ヤドリギ (Viscum) Misletoe
ヒノキバヤドリギ (Korthalsella)
ホザキヤドリギ (Hyphear)
マツグミ (Taxillus)
ビャクダン科 (Santalaceae)
ビャクダン (Santalus) Sandal wood ことわざの栴檀のこと
ツクバネ (Buckleya)
ナデシコ亜綱 (Caryophyllidae)
ディレニア目 (Delleniales)
ディレニア科 (Dilleniaceae)
ディレニア (Dillenia)
ナデシコ目 (Caryophyllales)
?アカトカルプス科 (Achatocarpaceae)
?ツルナ科 (Aizoaceae)
?ツルムラサキ科 (Basellaceae)
ツルムラサキ (Basella) 東南亜
?カナボウノキ科 (Didiereaceae)
?(Drosophyllaceae)
?(Physenaceae)
?(Sacobataceae)
?(Stegnospermataceae)
ラブドデンドロン科 (Rhabdodendraceae)
ラブドデンドロン (Rhabdodendron)
“ウツボカズラ亜目”
ウツボカズラ科 (Nepenthaceae)
ウツボカズラ (Nepenthes)
モウセンゴケ科 (Droseraceae)
モウセンゴケ (Drosera)
“ギョリョウ上科”
ギョリョウ科 (Tamaricaceae)
ギョリョウ (Tamarix)
フランケニア科 (Frankeniaceae)
フランケニア (Frankenia)
“ツクバネカズラ上科”
ツクバネカズラ科 (Ancistrocladaceae)
ツクバネカズラ (Ancistrocladus)
ディオンコフィルム科 (Dioncophyllaceae)
(Triphyophyllum)
“タデ上科”
タデ科 (Polygonaceae) 30属1000種
ソバ (Fagopyrum)
イソマツ科 (Plumbaginaceae) 10属400種 地中海・西亜
“ナデシコ亜目”
シンモンドシア科 (Simmondsiaceae)
シンモンドシア (Simmondsia)
(Asteropeiaceae)
(Asteropeia)
“ナデシコ上科”
ナデシコ科 (Caryophyllaceae)
ナデシコ (Dianthus)
オオヤマフスマ (Moehringia)
ハコベ (Stellaria)
ウシハコベ (Myosoton)
ミミナグサ (Cerastium)
ツメクサ (Sagina)
マンテマ (Silene)
ヒユ科 (Amaranthaceae) アカザ科 (Chenopodiaceae)を含む
ハマアカザ (Atriplex)
イヌホウキギ (Axyris)
フダンソウ (Beta)
アカザ (Chenopodium)
ホウキギ (Kochia)
アッケシソウ (Salicornia) 食用
オカヒジキ (Salsola) 食用
ホウレンソウ (Spinacia) 食用
“オシロイバナ下目”
“サボテン上科”
ザクロソウ科 (Molluginaceae)
スベリヒユ科 (Portulacaceae)
スベリヒユ (Portulaca) 食用（パースレーン）
サボテン科 (Cactaceae)
“オシロイバナ上科”
オシロイバナ科 (Nyctaginaceae)
ヤマゴボウ科 (Phytolaccaceae)
ヤマゴボウ (Phytolacca)
ジュズサンゴ (Rivina)
ツルナ亜科
ツルナ (Tetragonia)
バラ亜綱 (Rosidae) ［ユキノシタ目＋ブドウ目＋真正バラ類］
ユキノシタ目 (Saxifragales)
カツラ科 (Cercidiphyllaceae)
(Cercidiphyllum)
ユズリハ科 (Daphniphyllaceae)
ボタン科 (Paeoniaceae)
スグリ科 (Grossulariaceae)
(Altingiaceae)
(Liquidambar)
(Altingia)
(Iteaceae)
(Itea)
(Pterostemonaceae)
(Pterostemon)
マンサク科 (Hamamelidaceae)
トサミズキ (Corylopsis)
マルバノキ (Disanthus)
イスノキ (Distylium)
マンサク (Hamamelis)
フウ (Liquidambar)
トキワマンサク (Loropetalum)
パローティア (Parrotia)
(Parrotiopsis)
(Rhodoleia)
(Sycopsis)
ユキノシタ科 (Saxifragaceae)
?フクロユキノシタ科 (Cephalotaceae)
“ベンケイソウ下目”
ベンケイソウ科 (Crassulaceae)
“アリノトウグサ上科”
(Tetracarpaeaceae)
(Penthoraceae)
アリノトウグサ科 (Haloragaceae)
ブドウ目 (Vitales)
ブドウ科 (Vitaceae)
ブドウ (Vitis)
(Leea)
真正バラ下綱 (Eurosids) ［真正バラ類I＋フウロソウ目＋クロッソソマ目＋フトモモ目＋真正バラ類II］
真正バラ類I (Eurosids I)
?ハマビシ目 (Zygophyllales)
クラメリア科 (Krameriaceae)
ハマビシ科 (Zygophyllaceae)
“バラ上目”
ウリ・ブナ類
ウリ目 (Cucurbitales)
ウリ科 (Cucurbitaceae)
アレチウリ (Sicyos)
キュウリ (Cucumis) 食用（胡瓜，キワノ，メロン）
(Tetramelaceae)
ダティスカ科 (Datiscaceae)
シュウカイドウ（ベゴニア）科 (Begoniaceae)
ドクウツギ科 (Coriariaceae)
コリノカルプス科 (Corynocarpaceae)
ブナ目 (Fagales) 3科1500種
ナンキョクブナ科 (Nothofagaceae)
ナンキョクブナ (Nothofagus) Af・Anを除く南半球
ブナ科 (Fagaceae)
ブナ (Fagus)
コナラ (Quercus)
アカガシ亜属（アカガシ，アラカシ，シラカシ，ウバメガシ等）
コナラ亜属（カシワ，アベマキ，コナラ等）
クリ (Castanea) 堅果食用
シイノキ (Castanopsis) ツブラジイ・スダジイ
マテバシイ (Lithocarpus/Pasania)
“クルミ亜目”
“モクマオウ上科”
モクマオウ科 (Casuarinaceae)
(Gymnostoma) ニューカレドニア
モクマオウ (Casuarina)
(Ceuthostoma)
(Allocasuarina)
カバノキ科 (Betulaceae)
ハシバミ (Corylus)
クマシデ (Carpinus)
アサダ (Ostrya)
シラカンバ (Betula)
ハンノキ (Alnus)
(Ticodendraceae) 1属1種
(Ticodendron) 20m 中米 1989年発見
“クルミ上科”
?ロイプテリア科 (Rhoipteleaceae)
ロイプテリア (Rhoiptelea)
クルミ科 (Juglandaceae)
ペカン (Carya)
ノグルミ (Platycarya)
オニグルミ (Juglans)
サワグルミ (Pterocarya)
ヤマモモ科 (Myricaceae)
(Canacomyrica)
(Comptonia)
(Morella)
ヤマモモ (Myrica) 果実食用
マメ目 (Fabales)
マメ科 (Fabaceae/Leguminosae)
フサアカシア (Acacia)
(Adenocarpus)
(Adesmia)
クサネム (Aeschynomene)
ネムノキ (Albizia)
ササハギ (Alysicarpus)
クロバナエンジュ (Amorpha)
ヤブマメ (Amphicarpaea)
(Anthyllis)
ホドイモ (Apios)
ラッカセイ (Arachis) 食用（ピーナッツ）
タマザキゴウカン (Archidendron)
(Argyrolobium)
ゲンゲ (Astragalus)
ビロードヒメクズ (Atylosia)
ムラサキセンダイハギ (Baptisia)
ハカマカズラ (Bauhinia)
ジャケツイバラ (Caesalpinia)
(Calicotome)
ベニゴウカン (Calliandra)
ナタマメ (Canavalia)
ムレスズメ (Caragana)
(Carmichaelia)
カワラケツメイ (Cassia)
ハナスオウ (Cercis)
(Chamaecytisus)
(Chamaesenna)
(Chamaespartium)
(Chapmannia)
(Chordospartium)
ヒイラギハギ (Chorizema)
ホウズキハギ (Christia)
ヒヨコマメ (Cicer) 食用
フジキ (Cladrastis)
(Clianthus)
チョウマメ (Clitoria)
(Colutea)
(Corallospartium)
(Coronilla)
タヌキマメ (Crotalaria)
エニシダ (Cytisus)
ヒルギカズラ (Dalbergia)
(Dalea)
(Daviesia)
ホウオウボク (Delonix) Mg 三大花木の1つ
ナハキハギ (Dendrolobium)
シイノキカズラ (Derris)
(Desmanthus)
ヌスビトハギ (Desmodium)
(Dichrostachys)
(Dillwynia)
フジマメ (Dolichos)
(Dorycnium)
ノササゲ (Dumasia)
ノアズキ (Dunbaria)
(Ebenus)
モダマ (Entada)
エリナセア (Erinacea)
デイコ (Erythrina)
ミヤマトベラ (Euchresta)
エノキマメ (Flemingia)
ハギカズラ (Galactia)
(Galega)
ヒトツバエニシダ (Genista)
サイカチ (Gleditsia)
ダイズ (Glycine)
(Glycyrrhiza)
(Gompholobium)
(Goodia)
(Gymnocladus)
(Halimodendron)
(Hardenbergia)
イワオウギ (Hedysarum)
(Hippocrepis)
(Hovea)
コマツナギ (Indigofera)
タシロマメ (Intsia)
(Kennedia)
ヤハズソウ (Kummerowia)
キングサリ (Laburnum)
ハカマカズラ (Lasiobema)
レンリソウ (Lathyrus)
(Lembotropis)
ハギ (Lespedeza)
ギンゴウカン (Leucaena)
ミヤコグサ (Lotus)
ハウチワマメ (Lupinus)
イヌエンジュ (Maackia)
ナンバンアカアズキ (Macroptilium)
ウマゴヤシ (Medicago) 食用（アルファルファ alfalfa）
シナガワハギ (Melilotus)
ナツフジ (Millettia)
オジギソウ (Mimosa)
トビカズラ (Mucuna)
(Notospartium)
(Onobrychis)
(Ononis)
ハマセンナ (Ormocarpum)
ツノウマゴヤシ (Ornithopus)
(Orobus)
オヤマノエンドウ (Oxytropis)
(Parochetus)
(Petalostemon)
(Petteria)
インゲンマメ (Phaseolus) 中米 食用（隠元豆）
ウチワツナギ (Phyllodium)
(Piptanthus)
エンドウ (Pisum) 食用（グリンピース，莢豌豆）
(Platylobium)
(Podalyria)
ホウオウボク (Poinciana)
クロヨナ (Pongamia)
オランダビユ (Psoralea)
シタン (Pterocarpus)
クズ (Pueraria)
キンチャクマメ (Pycnospora)
(Retama)
タンキリマメ (Rhynchosia)
ハリエンジュ (Robinia)
(Sarothamnus)
アメリカツノクサネム (Sesbania)
シバネム (Smithia)
クララ (Sophora)
レダマ (Spartium)
ハッショウマメ (Stizolobium)
ヒスイカズラ (Strongylodon)
(Strophostyles)
(Sutherlandia)
(Swainsona)
タデハギ (Tadehagi)
タマリンド (Tamarindus) NAf 常緑大木 食用
(Teline)
(Templetonia)
(Tephrosia)
(Tetragonolobus)
センダイハギ (Thermopsis)
シャジクソウ (Trifolium)
(Trigonella)
ハリエニシダ (Ulex)
フジボグサ (Uraria)
ソラマメ（カラスノエンドウ） (Vicia) 食用
ササゲ (Vigna) 食用
フジ (Wisteria)
スナジマメ (Zornia)
スリアナ科 (Surianaceae)
ヒメハギ科 (Polygalaceae)
バラ目 (Rosales)
バラ科 (Rosaceae)
“ニレ亜目”
クロウメモドキ科 (Rhamnaceae)
“グミ上科”
バルベヤ科 (Barbeyaceae)
グミ科 (Elaeagnaceae)
“ニレ下目”
?ケクロピア科 (Cecropiaceae)
ニレ科 (Ulmaceae)
ニレ (Ulmus)
ケヤキ (Zelkova)
ムクノキ (Aphananthe)
イラクサ科 (Urticaceae)
キミズ (Pellionia)
カラムシ (Boehmeria)
ハドノキ (Villebrunea)
ヤナギイチゴ (Debregeasia)
“クワ上科”
クワ科 (Moraceae)
クワ (Morus)
コウゾ (Broussonetia)
ハリグワ (Cudrania)
イチジク (Ficus)
アサ科 (Cannabaceae)
エノキ科 (Celtidaceae)
ウラジロエノキ (Trema)
エノキ (Celtis)
“カタバミ上目”
ニシキギ目 (Celastrales)
?フア科 (Huaceae)
(Parnassiaceae)
スタックホウシア科 (Stackhousiaceae)
(Stackhousia)
(Siphonodon)
ニシキギ科 (Celastraceae)
マサキ
キントラノオ目 (Malpighiales)
ラキステマ科 (Lacistemaceae)
(Irvingiaceae)
フミリア科 (Humiriaceae)
(Goupiaceae)
トウダイグサ科 (Euphorbiaceae)
キャッサバ (Manihot) 食用
(Putranjivaceae)
バターナット科 (Caryocaraceae)
（Phyllanthaceae)
アマ科 (Linaceae)
キントラノオ科 (Malpighiaceae)
“オトギリソウ上科”
オトギリソウ（フクギ）科 (Clusiaceae/Guttiferae)
フープの木 (Montouziera) ニューカレドニア
カワゴケソウ科 (Podostemaceae)
(Hypericaceae)
“クイイナ上科”
クイイナ科 (Quiinaceae)
オクナ科 (Ochnaceae)
メドゥサギネ科 (Medusagynaceae)
“ヒルギ上科”
コカノキ科 (Erythroxylaceae)
ヒルギ科 (Rhizophoraceae)
“スミレ上科”
スミレ科 (Violaceae)
トゥルネラ科 (Turneraceae)
マレシェルビア科 (Malesherbiaceae)
マレシェルビア (Malesherbia)
トケイソウ科 (Passifloraceae)
トケイソウ (Pssiflora) 果実食用
“バラノプス上科”
バラノプス科 (Balanopaceae)
クリソバラヌス科 (Chrysobalanaceae)
カイナンボク科 (Dichapetalaceae)
トリゴニア科 (Trigoniaceae)
(Kiggelariaceae)
イクソナンテス亜科 (Ixonanthaceae)
アカリア亜科 (Achariaceae)
イイギリ科 (Flacourtiaceae)
ヤナギ亜科 (Salicaceae)
ハコヤナギ (Populus)
ケショウヤナギ (Chosenia)
オオバヤナギ (Toisusu)
ヤナギ (Salix)
カタバミ目 (Oxalidales)
カタバミ科 (Oxalidaceae)
カタバミ (Oxalis) 食用（オカ Oca）
“クノニア上科”
クノニア科 (Cunoniaceae)
エウクリフィア亜科 (Eucryphiaceae)
クノニア亜科 (Cunoniaceae)
ダヴィッドソニア亜科 (Davidsoniaceae)
ホルトノキ科 (Elaeocarpaceae)
トレマンドラ亜科 (Tremandraceae)
フウロソウ目 (Geraniales)
フウロソウ科 (Geraniaceae)
(Vivianiaceae)
“メリアンタ上科”
メリアンタ科 (Melianthaceae)
(Francoaceae)
グレイイア科 (Greyiaceae)
クロッソソマ目 (Crossosomatales)
“クロッソソマ亜目”
ミツバウツギ科 (Staphyleaceae)
“クロッソソマ上科”
キブシ科 (Stachyuraceae)
クロッソソマ科 (Crossosomataceae)
“亜目”
(Ixerbaceae)
(Aphloiaceae)
フトモモ目 (Myrtales)
フトモモ科 (Myrtaceae)
ニアウリ (Melaleuca) Tea tree ニューカレドニア
(Metrosyderos) ニューカレドニア
“ノボタン下目”
“ヴォキシア上科”
ヴォキシア科 (Vochysiaceae)
(Heteropyxidaceae)
“ノボタン上科”
(Memecylaceae)
ノボタン科 (Melastomataceae)
“シクンシ上科”
シクンシ科 (Combretaceae)
“ミソハギ上科”
ミソハギ科 (Lythraceae)
アカバナ科 (Onagraceae)
真正バラ類II (Eurosids II)
(Tapisciaceae)
(Tapiscia)
アブラナ目 (Brassicales)
パパイア科 (Caricaceae)
パパイア (carica)
ワサビノキ科 (Moringaceae)
ノウゼンハレン科 (Tropaeolaceae)
ノウゼンハレン (Tropaeolum)
アカニア科 (Akaniaceae)
(Setchellanthaceae)
リムナンタ科 (Limnanthaceae)
(Koeberliniaceae)
バティス科 (Batidaceae)
バティス (Batis)
モクセイソウ科 (Resedaceae)
アブラナ科 (Brassicaceae/Cruciferae)
アブラナ (Brassica) 食用（各種の菜，カブ，キャベツ）
イヌガラシ (Rorippa)
オランダガラシ (Nasturtium) 食用（クレス）
キバナスズシロソウ (Eruca) 食用（ルコラ）
シロガラシ (Sinapis)
ダイコン (Raphanus) 食用（大根，貝割）
ハマナ (Crambe)
マメグンバイナズナ (Lepidium)
ヤマガラシ (Barbarea) 食用（アメリカンクレス）
ワサビ (Eutrema) 食用
ワサビダイコン (Armoracia) 食用（ホースラディッシュ）
ムクロジ目 (Sapindales)
カンラン科 (Burseraceae) オリーブではない
オクメ (Aucoumea)
ボスウェリア (Boswellia) 樹脂は乳香
ブルセラ (Bursera)
カンラン (Canarium) 種から油．江戸時代に種子島などに渡来，オリーブではない
ミルラノキ (Commiphora) 樹脂は没薬，ミイラ
語源
ガルガ (Garuga)
プロティウム (Protium)
ウルシ科 (Anacardiaceae) ウルシオール（かぶれ）
カシューナッツノキ (Anacardium)
ハグマノキ (Cotinus)
カイノキ (Pistacia) ピスタチオ
マンゴー (Mangifera) 果実
ヌルデ (Rhus)
ウルシ (Toxicodendron)
ムクロジ科 (Sapindaceae) 含むカエデ科・トチノキ科
カエデ (Acer)
キンセンセキ (Dipteronia)
トチノキ (Aesculus)
ムクロジ (Sapindus)
アカギモドキ (Allophylus)
ハウチワニキ (Dodonaea)
フウセンカズラ (Cardiospermum)
リュウガン (Dimocarpus) 果樹
ガラナ (Paullinia) 清涼飲料原料
レイシ (Litchi) 果樹
ランブータン (Nephelium) 果樹
モクゲンジ (Loelreuteria)
ニガキ科 (Simaroubaceae)
ニワウルシ (Ailanthus)
ニガキモドキ (Brucea)
ニガキ (Picrasma)
レイトネリア (Leitneria)
センダン科 (Meliaceae) ことわざの栴檀はビャクダン科のビャクダンのこと
センダン (Melia)
マホガニー (Swietenia)
アフリカマホガニー (Khaya)
チャンチン (Toona)
ミカン科 (Rutaceae)
(Adenandra)
(Agathosma)
マツカゼソウ (Boennighausenia)
シロテツ (Boninia)
ボローニア (Boronia)
ミカン (Citrus)
ハクセン (Dictamnus)
ゴシュユ (Evodia)
キンカン (Fortunella)
ハナシンボウギ (Glycosmis)
(Haplophyllum)
アワダン (Melicope)
ゲッキツ (Murraya)
コクサギ (Orixa)
キハダ (Phellodendron)
カラタチ (Poncirus)
ホップノキ (Ptelea)
ヘンルーダ (Ruta)
(Severina)
ミヤマシキミ (Skimmia)
サルカケミカン (Toddalia)
サンショウ (Zanthoxylum) 本州・九州・朝鮮 香辛料
アオイ目 (Malvales)
ネウラダ科 (Neuradaceae)
ベニノキ科 (Bixaceae)
ジンチョウゲ科 (Thymelaeaceae)
(Muntingiaceae)
ハンニチバナ科 (Cistaceae)
フタバガキ科 (Dipterocarpaceae)
サルコラエナ科 (Sarcolaenaceae)
アオイ科 (Malvaceae)
トロロアオイ (Abelmoschus) エチオピア 食用（オクラ）
フヨウ (Hibiscus)
イチビ (Abutilon)
タチアオイ (Althaea)
ワタ (Gossypium)
ゼニアオイ (Malva) Mallow 旧大陸 ハーブ
キクノハアオイ (Modiola)
キンゴジカ (Sida)
サキシマハマボウ (Thespesia)
ボンテンカ (Urena)
シナノキ亜科 (Tiliaceae)
(Tilia)
キワタ亜科 (Bombacaceae) パンヤ亜科 落葉木
キワタノキ (Bombax) 印・Au
カポック (Ceiba) パンヤノキ
ドリアン (Durio) Durian 東南ア 果物の王様
トックリキワタ (Chorisia) ブラジル・Arg ヨイドレノキ 木肌の鋭棘
バオバブ (Adansonia) Mg・Af・Au 樹皮下にも葉緑体
パキラ (Pachira) メキシコ・中米
アオギリ科 (Sterculiaceae)
アオギリ (Firmiana)
サキシマスオウノキ (Heritiera)
フウセンアカメガシワ (Kleinhovia)
ノジアオイ (Melochia)
ピンポンノキ (Sterculia)
カカオ (Theobroma)
キク亜綱 (Asteridae)
ツツジ目 (Ericales)
ハイノキ科 (Symplocaceae)
サラセニア科 (Sarraceniaceae)
(Roridulaceae)
アカテツ科 (Sappotaceae)
アカテツ (Planchonella)
チューインガムノキ（サポジラ） (Achras) 中米・西印諸島 常緑高木 樹液を固めチクル（ガムの基材）を製造
(Fouquieriaceae)
カキ科 (Ebenaceae)
キリラ科 (Cyrillaceae)
リョウブ科 (Clethraceae)
ツバキ科 (Theaceae)
ツバキ (Camellia) 飲用（茶 thea），油
マタタビ科 (Actinidiaceae)
ツツジ科 (Ericaceae)
(Ternstroemiaceae)
サガリバナ科 (Lecythidaceae)
エゴノキ科 (Styracaceae)
ハナシノブ科 (Polemoniaceae)
“ツリフネソウ上科”
ツリフネソウ科 (Balsaminaceae)
マルクグラビア科 (Marcgraviaceae)
ペリキエラ科 (Pelliciera)
テトラメリスタ科 (Tetrameristaceae)
“サクラソウ（ヤブコウジ）上科”
ヤブコウジ科 (Myrsinaceae) 多系統
ヤブコウジ (Ardisia)
イズセンリョウ (Maesa)
ツルマンリョウ (Myrsine)
(Suttonia)
テオフラストゥス科 (Theophrastaceae)
サクラソウ科 (Primulaceae) 多系統
ミズキ目 (Cornales)
ヌマミズキ科 (Nyssaceae)
ミズキ科 (Cornaceae)
ロアサ科 (Loasaceae)
アジサイ科 (Hydrangeaceae)
真正キク類I (Euasterid I)
オンコテカ科 (Oncotheca)
ガリア目 (Garryales)
(Icacinaceae)
トチュウ科 (Eucommia)
(Aucubaceae)
ガリア科 (Garryaceae)
類
(Vahliaceae)
ムラサキ科 (Boraginaceae)
(Borago)
ハゼリソウ (Hydrophyllum)
リンドウ目 (Gentianales)
マチン科 (Loganiaceae)
リンドウ科 (Gentianaceae)
(Gelsemiaceae)
キョウチクトウ科 (Apocynaceae)
(Apocynum) Dogbane
ツルニチニチソウ (Vinca)
アカネ科 (Rubiaceae)
コーヒー (Coffea) Coffee
ガガイモ科 (Asclepiadaceae)
ナス目 (Solanales)
(Hydroleaceae)
(Montiniaceae)
ヒルガオ科 (Convolvulaceae)
サツマイモ (Ipomoea)
ヒルガオ (Convolvulus)
ネナシカズラ科 (Cuscutaceae)
ネナシカズラ (Cuscuta)
ナス科 (Solanaceae)
ナス (Solanum) 食用（茄子，ジャガイモ，ペピーノ，ナランジラ）
トマト (Lycopersicon) 食用
キダチトマト (Cyphomandra) 食用（タマリロ）
トウガラシ (Capsicum) 食用（唐辛子，ピーマン，パプリカ）
ホウズキ (Physalis)
チョウセンアサガオ (Datura) 中南米・印 華岡青洲が使用した麻酔薬・麻弗散の原料の一つ（他にトリカブト）
ブルグマンシア (Brugmansia)
マンドラゴラ (Mandragora) Mandrake 有毒（アトロピン）
(Duckeodendron)
(Norana)
シソ目 (Lamiales)
モクセイ科 (Oleaceae)
ネズミモチ
フジウツギ科 (Buddlejeaceae)
ビブリス科 (Byblidaceae)
ノウゼンカズラ科 (Bignoniaceae)
カエンボク (Spathodea) African Tuliptree 熱帯Af 三大花木の1つ
ジャカランダ (Jacaranda) Arg・ボリビア 三大花木の1つ
(Stilbaceae)
ハマジンチョウ科 (Myoporaceae)
ゴマ科 (Pedaliaceae)
ゴマ (Sesamum)
ゴマノハグサ科 (Scrophulariaceae)
(Utriculariaceae)
シソ科 (Lamiaceae/Labiatae)
オドリコソウ (Lamium)
ムシャリンドウ (Dracocephalum) dragon's head
ハッカ (Mentha) Mint 香料
キツネノゴマ科 (Acanthaceae)
ゴマノハグサ科 (Scrophulariaceae)
イワタバコ科 (Gesneriaceae)
真正キク類II (Euasterid II)
モチノキ目 (Aquifoliales)
クロタキカズラ科 (Icacinaceae)
(Phyllonomaceae)
モチノキ科 (Aquifoliaceae)
(Helwingiaceae)
(Berzeliaceae)
(Eremosynaceae)
(Escalloniaceae)
マツムシソウ目 (Dipsacales)
レンプクソウ科 (Adoxaceae)
オミナエシ科 (Valerianaceae)
ノヂシャ (Valerianella)
(Linnaeaceae)
スイカズラ科 (Caprifoliaceae)
マツムシソウ科 (Dipsacaceae)
(Cephalaria)
ナベナ (Dipsacus)
(Knautia)
(Morina)
プテロセファルス (Pterocephalus)
マツムシソウ (Scabiosa)
(Succisa)
セリ目 (Apiales)
(Melanophyllaceae)
(Griseliniaceae)
セリ科 (Apiaceae/Umbelliferae)
アニス (Pimpinella)
イノンド (Anethum) ハーブ（ディル）
ウイキョウ（フェンネル） (Foeniculum) 食用
オランダセリ (Petroselinum) 食用（パセリ）
オランダミツバ (Apium) 食用（セロリ）
キャラウェー (Carum) スパイス
シャク (Anthriscus) ハーブ（チャーヴィル）
クミン (Cuminum) スパイス
コエンドロ (Coriandrum) coriander 香菜，パクチー，中国パセリ，カメムシソウ）ギリシア語のKoriannon（カメムシ）に由来．
シシウド (Angelica)
セリ (Oenanthe)
チドメグサ (Hydrocotyle)
ツボクサ (Centella)
ニンジン (Daucus) 食用
ボウフウ (Ledebouriella)
ミツバ (Cryptotaenia) 食用
ヒゴタイサイ (Eryngium) オオバコエンドロ（コエンドロと同様の香の香味野菜）
ウコギ科 (Araliaceae)
コシアブラ (Elentherococcum)
タラノキ (Aralia)
トベラ科 (Pittosporaceae)
キク目 (Asterales)
(Rousseaceae)
(Lobeliaceae)
キキョウ科 (Campanulaceae)
スティリディウム科 (Stylidiaceae)
ドナティア科 (Donatiaceae)
(Phellinaceae)
アルセウオスミア科 (Alseuosmiaceae)
(Argophyllaceae)
(Menyanthaceae)
クサトベラ科 (Goodeniaceae)
カリケラ科 (Calyceraceae)
キク科 (Asteraceae/Compositae)
ヨモギ (Artemisia) 食用（エストラゴン）
ヨモギギク (Tanacetum) 香料
コウモリソウ (Parasenecio)
パラクレス (Acmella)
キク亜科 (Asteroideae)
(Anthemideae)
シュンギク (Chrysanthemum)
キク族 (Astereae)
ノギク (Aster)
(Calenduleae)
(Cotuleae)
(Heliantheae)
(Innuleae)
(Senecioneae)
フキ (Petasites) 食用
(Tagateae)
(Ursinieae)
アキノノゲシ亜科 (Lactucoideae)
(Arctoteae)
ヒレアザミ族 (Cardueae)
ヒレアザミ (Carduus)
ゴボウ (Arctium)
チョウセンアザミ (Cynara) 食用（アーティチョーク）
(Eremothamneae)
(Eupatorieae)
アキノノゲシ族 (Lactuceae)
アキノノゲシ (Lactuna) 食用（レタス，サラダ菜，チシャ）
キクチシャ (Cichorium) 食用（チコリ，エンダイヴ）
フタナミソウ (Scorzonera)
タンポポ (Taraxacum)
バラモンジン (Tragopogon)
(Liabeae)
(Mutisieae)
(Vernonieae)
リザリア界 (Rhizaria/Rhyzaria) ［ケルコゾア門＋レタリア門］ 糸状仮足 単系統性に疑問?
ケルコゾア門 (Cercozoa) ［｛ケルコモナス亜門＋狭義レタリア門｝＋放射虫門］
?(Sainouron) Cavalier-Smith et al. 2008
??(Xenophyophorea)
スキゾクラドゥス (Schizocladus)
ケルコモナス亜門 (Cercomonea)
(Massisteria)
クロララクニオン綱 (Chlorarachniophyta/Chlorarachniophycea) 海産緑色アメーバ クロロフィルa・b
クロララクニオン目 (Chlorarachniales) 緑藻共生型葉緑体（ヌクレオモルフあり）
クロララクニオン科 (Chlorarachniaceae)
クロララクニオン (Chlorarachnion)
ロタレラ (Lotharella)
ギムノクロラ (Gymnochlora)
クリプトクロラ (Cryptochlora)
(Bigelowiella)
デスモトラシダ目 (Desmothoracida)
(Clathrulina)
(Hedriocystis)
??ディモルファ目 (Dimorphida) 旧太陽虫門
ディモルファ (Dimorpha) 鞭毛をもつ
テトラディモルファ (Tetradimorpha)
??ギムノスフェリウム目(Gymnosphaerida) 旧太陽虫門
(Actinocoryne)
ギムノスフェリウム (Gymnoshaerium)
(Hedraiophys)
ケルコモナス綱 (Cercomonadea)
ギムノフリス (Gymnophrys)
ケルコモナス目 (Cercomonadida)
(Metopion)
ケルコモナス (Cercomonas)
ヘテロミタ (Heteromita)
(Proleptomonas)
(Silicofilosea)
タウマトモナス目 (Thaumatomonadida)
アラス (Allas)
?スポンゴモナス (Spongomonas) アメーバ動物門雑多綱にも記載
(Gyromitus)
(Thaumatomastix)
タウマトモナス (Thaumatomonas)
ユーグリファ目 (Euglyphida)
?(Ampullataria)
?(Euglyphidion)
?(Heteroglypha)
?(Matsakision)
ユーグリファ科 (Euglyphidae)
(Assulina)
ユーグリファ (Euglypha)
(Paraeuglypha)
(Placocista)
スフェノデリア (Sphenoderia)
(Tracheleuglypha)
(Trachelocorythion)
トリネマ科 (Trinematidae)
(Corythion)
(Deharvengia)
(Pileolus)
(Playfairina)
トリネマ (Trinema)
キフォデリア科 (Cyphoderiidae)
(Campascus)
(Corythionella)
キフォデリア (Cyphoderia)
(Messemvriella)
(Pseudocorythion)
(Schaudinnula)
パウリネラ科 (Paulinellidae)
パウリネラ (Paulinella) 共生葉緑体が存在
プセウドディフルギア科 (Pseudodifflugiidae)
(Cryothecomonas)
(Plagiophrys)
(Baileya)
プセウドディフルギア (Pseudodifflugia)
(Frenzelina)
(Diaphorodon)
フェオダリア綱 (Phaeodarea) 旧放散虫類に属す
(Aulacantha)
(Aulosphaera)
(Coelodendrum)
(Phaeogymnocellida)
フェオシスティナ目 (Phaeocystida)
オーラカンサ科 (Aulacanthidae) 系統
オーロスフェラ科 (Aulosphaeridae)
(Phaeosphaerida)
(Phaeocalpida)
(Phaeogromida)
(Phaeoconchida)
(Phaeodendrida)
(Chlamydophryidae)
(Chlamydophrys)
レキティウム (Lecythium)
狭義レタリア門 (Retaria) ［フィトミクサ亜門＋｛有孔虫亜門＋エンドミクサ亜門｝］
フィトミクサ亜門 (Phytomyxea)
ネコブカビ綱 (Plasmodiophorea/Plasmodiophoromycetes)
?(Polymyxa)
?(Woronina)
ファゴミクサ (Phagomyxa)
ポンゴミクサ (Pongomyxa)
ネコブカビ目 (Plasmodiophorida/Plasmodiophorales)
スポンゴスポラ (Spongospora)
ネコブカビ科 (Plasmodiophoridae/Plasmodiophoraceae)
ソロスフェラ (Sorosphaera)
ネコブカビ (Plasmodiophora)
有孔虫亜門 (Foraminifera) 多泡綱の姉妹群で放散虫綱 原生代後期〜現在 微化石 殻は星砂となる
Nodellum Resigell Chitinosiphon saccamminids Lagenammina
!紡錘虫目 (Fusulinaecea) 石炭紀〜ペルム紀 1cmに達する
!フズリナ上科
!オザワイネラ科
!シュウベルテラ科
!ブルトニア科
!フズリナ科 (Fusulinidae)
!シュワゲリナ科
!フェルベキナ上科
!フェルベキナ科
!ネオシュワゲリナ科
!スタッフェラ超科
!スタッフェラ科
!貨幣石 (Nummulites) 古第三紀
?カラカムリ綱 (Athalamida)
カラカムリ目 (Athalamea)
バイオミクサ科 (Biomxidae)
(Arachnula)
バイオミクサ (Biomyxa)
ボルコウィア (Borkovia)
ギムノフリス (Gymnophrys)
ペナルディア (Penardia)
テラトミクサ (Theratomyxa)
モノタラミダ綱 (Monothalamida) 単室
?ディプロフリス (Diplophrys)
?アポグロミア (Apogromia)
(Saccodendron)
(Armorella)
(Pelosina)
(Astrammina)
(Edaphoallogromia)
(Hyperammina)
(Crithionina)
アログロミア目 (Allogromiida/Allelogromiida)
(Hospitellidae)
(Hospitella)
アログロミア科 (Allogromiidae)
アログロミア (Allogromia/Allelogromia)
(Chitinosaccus)
(Diplogromia)
(Lieberkuehnia)
(Marsupulina)
(Micrometula)
(Nodellum) マリアナ海溝
(Resigella) マリアナ海溝
(Periptygma)
(Phainogullmia)
(Placopsilinella)
(Psammophagidae)
プサモファガ (Psammophaga)
(Shepheardellidae)
(Shepheardella)
(Astrorhizida)
(Astrorhizacea)
(Silicoloculinida)
(Robertinida)
(Robertinidae)
(Ceratobuliminidae)
(Epistominidae)
(Carterinida)
(Carterinidae)
(Lagynidae)
(Boderia)
(Cystophrys)
(Iridia)
(Myxotheca)
ネモグルミア (Nemogullmia)
(Pseudoditrema)
(Rhumblerinella)
(Vanhoeffenella)
(Tinogullmia)
(Phainogullmia)
(Hippocrepinacea)
(Hippocrepinella hirudinea)
(Hemisphaerammina)
(Notodendrodes)
レティキュロミクサ科 (Reticulomyxidae) 旧 Athalamea
レティキュロミクサ (Reticulomyxa)*
(Ovammina)
(Cribrothalammina)
(Hippocrepinella acuta)
(Bathysiphon)
(Psammosphaeridae)
(Psammosphaera) マリアナ海溝
スピリリナ目 (Spirillinida)
スピリリナ科 (Spirillinidae)
スピリリナ (Spirillina)
パテリナ科 (Patellinidae)
パテリナ (Patellina)
アモディスカス目(Ammodiscacea)
アモディスカス科 (Ammodiscidae)
アモディスカス (Ammodiscus)
(Ammolagena)
(Lagenida)
(Lagenidae)
(Glandulinidae)
(Nodosariidae)
(Vaginulinidae)
(Polymorphinidae)
(Globigerinida)
(Candeinacea)
グロビゲリナ上科 (Globigerinacea)
ミリオリダ目 (Miliolida)
コルヌスピラ科 (Cornuspiridae)
コルヌスピラ (Cornuspira)
(Massilina)
(Quinqueloculina)
(Borelis)*
(Squamulinidae)
(Hemigordiopsidae)
(Fischerinidae)
(Nubeculariidae)
(Riveroinidae)
(Ophthalmidiidae)
(Spiroloculinidae)
(Hauerinidae)
(Miliolidae)
(Alveolinidae)
(Discospirinidae)
ペネロプシス科 (Peneroplidae)
ペネロプシス (Peneroplis)*
ソリテス科 (Soritidae)
ソリテス (Sorites)
目
(Gloiogullmia)
(Pilulina)
(Rhabdammina)
(Cylindrogullmia)
テックストゥラリア目 (Textulariida)
(Hormosinidae)
(Telamminidae)
(Rzehakinidae)
(Ammosphaeroidinidae)
(Haplophragmoididae)
(Sphaeramminidae)
(Lituotubidae)
(Lituolidae)
(Placopsilinidae)
(Cyclamminidae)
(Spiroplectamminidae)
トロカミナ科 (Trochamminidae)
トロカミナ (Trochammina)* 底生
(Remaneicidae)
(Verneuilinidae)
(Globotextulariidae)
(Eggerellidae)
テックストゥラリア科 (Textulariidae)
テックストゥラリア (Textularia)*
(Valvulinidae)
ロタリア大目 (Rotaliida)
(Loxostomatacea)
(Stilostomellacea)
(Bolivinacea)*
(Fursenkoinacea)
(Virgulinellacea)
(Pleurostomellacea)
(Cassidulinacea)
(Buliminacea)
(Siphoninacea)
(Annulopatellinacea)
(Glabratellacea)
(Buliminoididae)
(Heronalleniidae)
(Rotaliellidae)
(Glabratellidae)
(Glabratella)
ロザリナ上科 (Rosalinacea)
ロザリナ (Rosalina) 底生
(Discorbinellacea)
(Planorbulinacea)
(Acervulinacea)
(Asterigerinacea)
(Nonionacea)
(Chilostomellacea)
ロタリア上科 (Rotaliacea)
(Elphidiidae)
エルフィディウム (Elphidium) 底生
(Calcarinidae)
ロタリア科 (Rotalidae)
アンモニア (Ammonia) 底生
ロタリア (Rotalia)
(Discorbidae)
(Eponididae)
(Nummulitacea)
(Nummulitidae) *
?(Komokiacea)
エンドミクサ亜門 (Endomyxa) ［フィロレタ＋グロミア＋パラディニウム＋アセトスポラ綱］
フィロレタ (Filoreta) 旧(Corallomyxa tenera + "Reticulamoeba") 旧アメーバ動物門ステロミクサ目
グロミア (Gromia)
パラディニウム (Paradinium)
アセトスポラ綱 (Ascetosporea)
ハプロスポリディウム目 (Haplosporida)
ウロスポリディウム科 (Urosporidiidae)
ウロスポリディウム (Urosporidium)*
ハプロスポリディウム科 (Haplosporidiidae)
ミンチニア (Minchinia)
ハプロスポリディウム (Haplosporidium)*
??マルテイリア目 (Marteiliida)
マルテイリア科 (Marteiliidae)
マルテイリア (Marteilia)
パラマルテミリア (Paramarteilia)
放散虫門 (Radiozoa/Radiolaria) カンブリア紀〜現在 Phaeodarea除く
刺針綱 (Acantharea)
(Acanthometra)*
(Holacanthida)
(Acanthochiasmidae)
(Acanthoplegmidae)
(Acanthocollidae)
(Symphyacanthida) *
(Amphilithidae)
(Astrolithidae)
(Pseudolithidae)
(Chaunacanthida) *
(Stauraconidae)
(Conaconidae)
(Gigartaconidae)
(Arthracanthida)
(Sphaenacantha)
(Phyllacantha)
?スティコロンケ綱 (Taxopodida) サルガッソー海の環境DNA配列
(Larcopyle) 旧多泡綱
スティコロンケ (Sticholonche)*
?メテオラ (Meteora)
多泡綱 (Polycystinea) 旧太陽虫門
スプメラリア目 (Spumellarida)*
(Spumellaria)
ネッセラリア目 (Nasselarida)
(Nassellaria)
コロダリア目 (Collodaria)
タラッシコラ (Thallassicolla)
(Rhaphidozoum)*
(Collozoum)*
(Sphaerozoum)*
(Collosphaera)*
(Siphonosphaera)*
クロマルヴェオラータ界 (Chomalveolata) ［クリプト植物門＋ハプト植物門＋ストラメノパイル下界＋アルヴェオラータ下界］
?(Luffisphaera)
?(Phyllomitus)
?(Quadricilla)
?(Trichonema)
?(Adlerocystis)
クリプト植物門 (Cryptophyta/Cryptomonadida) 200種 紅藻共生型葉緑体（ヌクレオモルフの存在）クロロフィル a,c2を持つ 単系統性に疑問?
?(Katheblepharidae)
(Kathablepharis)
(Leucocryptos)
クリプトモナス綱 (Cryptomonadea/Cryptophyceae)
クリプトモナス（暗色鞭毛虫）目 (Cryptomonadida/Cryptomonadales)
(Campylomonas)
(Rhodomonas)
(Chroomonas)
(Chilomonas)
クリプトモナス科 (Cryptomonadaceae)
カゲヒゲムシ (Cryptomonas)
シアトモナス (Cyathomonas)
ヘミセルミス科 (Hemiselmidaceae)
ヘミセルミス (Hemiselmis)
(Nephroselmis)
ゴニオモナス目 (Goniomonadales)
ゴニオモナス科 (Goniomonadaceae)
ゴニオモナス (Goniomonas) 葉緑体無し 鞭毛虫
テトラゴニディウム目 (Tetragonidiales)
テトラゴニディウム科 (Tetragonidiaceae)
テトラゴニディウム (Tetragonidium)
(Wobblia) 鞭毛移行部の２重らせん構造
?("Hamatores")
(Caecitellus)
ハプト植物門 (Haptophyta) 70属300種 真正植物界? ハプトネマを持つ（一部退化） 海洋ナンノプランクトンの主要構成要素 炭素循環・硫黄循環
パヴロヴァ藻綱 (Pavlovophyceae) 不等長鞭毛，眼点あり，退化型ハプトネマ
パヴロヴァ目 (Pavlovales)
パヴロヴァ科 (Pavlovaceae)
ディアクロネマ (diacronema)
パヴロヴァ (Pavlova)
エクサンテマクリシス (Exanthemachrysis)
プリムネシウム綱 (Prymnesiophyceae)
イソクリシス目 (Isochrysidales) 退化型ハプトネマ
エミリアニア (Emiliania) ハプトネマ欠く 主要植物プランクトン SOxに変るDMSP発生
ゲフィロカプサ (Gephyrocapsa)
イソクリシス (Isochrysis)
クリソティラ (Chrysotila)
プリムネシウム目 (Prymnesiales)
プリムネシウム (Prymnesium)
クリソクロムニナ (Chysochromulina) ハプトネマが最も発達
コリムベルス (Corymbellus)
ファエオキスティス目 (Phaeocystales)
ファエオキスティス (Phaeocystis)
円石藻目 (Coccosphaerales) CaCO3の円盤状鱗片 coccolith，化石多し
(Balaniger)
(Calciosolenia)
(Coccolithus)
(Hymenomonas)
プレウロクリシス (Pleurochrysis)
(Reticulosphaera)
(Wigwamma)
ストラメノパイル下界 (Stramenopila/Straminopile/Heterokonta) 小毛（管状マスチゴネマ）を鞭毛表面にもつ ［ラビリントゥラ綱＋ビコエカ門＋ギリスタ上門］
?ラゲニスマ目 (Lagenismatales)
ラビリントゥラ菌綱 (Labyrinthulomycetes) 現生2科 従属栄養
ラビリントゥラ目 (Labyrinthulales)
ラビリントゥラ科 (Labyrinthulaceae) 1属8種
ラビリントゥラ (Labyrinthula)
ヤブレツボカビ科 (Thraustochytriaceae) 7属30種
(Labyrinthuloides)
(Sorodiplophrys)
?(Schizocytrium)
(Ulkenia)
ヤブレツボカビ (Thraustochytrium)
ビコソエカ綱 (Bicosoecea/Bicoecea) 40種 従属栄養
ビコソエカ亜綱 (Bicosoecida)
?(Cyathobodo)
プセウドデンロロモナス (Pseudodendromonas)
(Pseudobodo)
(Siluania)
(Adriamonas)
(Cyathobodo)
ビコソエカ目 (Bicosoecales/Bicoecales)
ビコソエカ科 (Bicosoecidae)
ビコソエカ (Bicosoeca) 従属栄養プランクトン 5μm
(Histiona)
アノエカ目 (Anoecales)
カフェテリア科 (Cafeteriidae)
カフェテリア (Cafeteria)
?ピルソニア目 (Pirsoniales)
ピルソニア科 (Pirsoniaceae)
ピルソニア (Pirsonia)
プラシディア亜綱 (Placidae) 鞭毛虫
プラシディア目 (Placidiales)
ギリスタ上門 (Gyrista) ［偽菌門＋オパリナ門＋不等毛植物門］
偽菌門 (Pseudofungi) 従属栄養
?ビギロモナデア綱 (Bigyromonadea)
デヴェロパイエラ目 (Developayellales)
デヴェロパイエラ (Developayella)
ツユカビ綱 (Peronosporomycetes/Oomycetes)
?(Myzocytiopsidiales)
?(Olpidiopsidales)
?(Rozellopsidales)
?(Haptoglossales)
ツユカビ目 (Peronosporales)
フハイカビ科 (Pythiaceae)
(Trachyosphaera)
(Phytophthora)
(Pythium)
ツユカビ科 (Peronosporaceae)
(Pseudoperonospora)
(Sclerospora)
(Plasmopara)
(Bremia)
(Basidiophora)
(Peronospora)
オオギミズカビ科 (Rhipidiaceae)
シロサビキン科 (Albuginaceae)
(Albugo)
ミズカビ目 (Saprolegniales)
ミズカビ科 (Saprolegniaceae)
(Dictyuchus)
(Aphanomyces)
(Geolegnia)
(Saprolegnia)
ササラビョウキン科 (Sclerosporaceae)
ヒシミズカビ科 (Leptomitaceae)
サカゲツボカビ綱 (Hyphochytriomycetes) 独立門?(Hyphochytriomycota)
(Anisolpidiaceae)
(Anisolpidium)
(Canteriomyces)
サカゲカビ科 (Rhizidiomycetaceae)
(Latrostium)
サカゲカビ (Rhizidiomyces)
(Rhizidiomycopsis)
サカゲツボカビ科 (Hyphochytriaceae)
サカゲツボカビ (Hyphochytrium)
オパリナ門 (Opalozoa)
?ヌクレオヘレア綱 (Nucleohelea)
無核太陽虫目 (Actinophryales) 旧太陽虫門(Heliozoa)
タイヨウチュウ (Actinophrys)
(Actinosphaerium)
オパリナ上綱 (Opalinata)
?ブラストキスティス (Blastocystis) 鞭毛を二次喪失 腸内原虫
オパリナ綱 (Opalinea)
オパリナ目 (Opalinida/Slopalinida)
オパリナ科 (Opalinidae)
オパリナ (Opalina)
(Cepedea)
(Protoopalina)
(Protozelleriella)
(Zelleriella)
?(Bezzenbergia)
?(Hegneriella)
プロテロモナス綱 (Proteromonadea)
プロテロモナス (Proteromonas)
カロトモルファ (Karotomorpha)
不等毛植物門 (Ochrophyta/Heterokontophyta) ［カキスタ亜門＋フェイスタ亜門］ 紅藻共生型葉緑体
パルマ目 (Parmales)
トリパルマ科 (Triparmaceae)
トリパルマ (Triparma)
テトラパルマ (Tetraparma)
ペンタパルマ (Pentaparma)
カキスタ亜門 (Khakista)
珪藻綱 (Bacillariophyceae/Diatomophyceae) 800属10万種
?アステロランプラ (Asterolampra)
?ヘリオペルタ (Heliopelta)
?(Amphitetlas)
?イトマキケイソウ (Biddulphia)
?リトデスミウム (Lithodesmium)
?ユーポディスクス (Eupodiscus)
小網珪藻亜綱 (Coscinodiscophytina) 無突起系統
(Paralidae)
(Paralia)
タルケイソウ科 (Melosiridae)
(Aulacoseira)
タルケイソウ (Melosira)
(Stephanopyxis)
コアミケイソウ科 (Coscinodiscidae)
(Actinoptychus)
ヘンディスクス (Hemidiscus)
コアミケイソウ (Coscinodiscus)
アウラコディスクス科 (Arachnoidiscidae)
アウラコディスクス (Arachnoidiscus)
ツツガタケイソウ科 (Rhizosolenidae)
(Guinardia)
(Leptocylindrus)
ツツガタケイソウ (Rhizosolenia)
(Corethridae)
(Corethron)
珪藻亜綱 (Bacillariophytina)
ツノケイソウ科 (Mediophyceae) ［側］ 有基突起系統
ツノケイソウ (Chaetoceros) 休眠胞子 始新世／漸新世境界で多様化，生物生産の1/3近くを占める
(Cymatosira)
(Ditylum)
(Odontella)
(Skeletonema)
タラシオシーラ (Thalassiosira)
?ラウデリア (Lauderia)
?(Eucampia)
?(Papilliocellus)
?(Orthoseira)
?(Cyclostephanos)
?(Porosira)
ケイソウ科 (Bacillariophyceae)
無縦溝類 (Araphidineae)
(Asterionella)
(Asterionellopsis)
ラフォネイス (Rhaphoneis)
オビケイソウ (Fragilaria) 有孔虫に共生するものあり
タラシオネマ (Thalassionema)
プロトラフィス (Protoraphis)
ヌサガタケイソウ (Tabellaria)
イタケイソウ (Diatoma)
縦溝類 (Raphidineae) 渦鞭毛藻の葉緑体の起源生物
イチモンジケイソウ (Eunotia)
クチビルケイソウ (Cymbella)
フナガタケイソウ (Navicula) 有孔虫に共生するものあり
ディアデスミス (Diadesmis)
イカダケイソウ (Bacillaria)
ツメケイソウ (Achnanthes) 有孔虫に共生するものあり
アウリクラ (Auricula)
カンピロディスクス (Campylodiscus)
ハフウケイソウ (Epithemia)
ササノハケイソウ (Nitzschia) 有孔虫に共生するものあり
コバンケイソウ (Surirella)
(Cylindrotheca)
ボリド藻綱 (Bolidophyceae)
ボリドモナス目 (Bolidomonadales)
ボリドモナス (Bolidomonas)
ペラゴ藻綱 (Pelagophyceae)
?(Aureococcus)
ペラゴモナス目 (Pelagomonadales)
ペラゴモナス (Pelagomonas)
アウレオコックス (Aureococcus)
サルキノクリシス目 (Sarcinochrysidales)
サルキノクリシス科 (Sarcinochrysidaceae)
サルキノクリシス (Sarcinochrysis)
(Ankylochrysis)
(Chrysoreinhardia)
ギラウディオプシス (Giraudiopsis)
(Nematochrysopsidaceae)
(Nematochrysopsis)
ディクティオカ藻綱 (Dictyochophyceae) "Axodines"
ディクティオカ目 (Dictyochales)
ディクティオカ科 (Dictyochaceae)
ディクティオカ (Dictyocha)
ペディネラ目 (Pedinellales)
ペディネラ科 (Pedinellaceae)
(Apedinella)
(Cyrtophora)
(Palatinella)
ペディネラ (Pedinella)
プセウドペディネラ (Pseudopedinella)
キリオフリス科 (Ciliophryidae) かつては太陽虫類に入れられた
アクティノモナス (Actinomonas) 葉緑体喪失
キリオフリス (Ciliophrys) 葉緑体喪失
リゾクロムニナ目 (Rhizochromulinales)
リゾクロムニナ (Rhizochromlina)
フェイスタ亜門 (Phaeista)
上綱 (Limnistia)
真正眼点藻綱 (Eustigmatophytes)
ユースティグマトス目 (Eustigmatales)
ユースティグマトス科 (Eustigmataceae)
ユースティグマトス (Eustigmatos)
ヴィスケリア (Vischeria)
モノドプシス科 (Monodopsidaceae)
モノドプシス (Monodopsis)
ナンノクロロプシス (Nannnochloropsis)
クロロボトリス科 (Chlorobotryaceae)
クロロボトリス (Chlorobotrys)
プセウドカラキオプシス科 (Pseudocharaciopsidaceae)
プセウドカラキオプシス (Pseudocharaciopsis)
ピコファゴス綱 (Picophagea)
ピコファゴス目 (Picophagales)
シンクロマ藻綱 (Synchromophyceae)
シンクロマ目 (Synchromales)
クラミドミクサ目 (Chlamydomyxales)
黄金色藻綱 (Chrysophytes)
ヒッバーディア (Hibberdia)
オクロモナス群
クリソカプサ目 (Chrysocapsales)
クリソカプサ科 (Chrysocapsaceae)
クリソカプサ (Chrysocapsa)
(Phaeaster)
クリソサックス科 (Chrysosaccaceae)
クリソサックス (Chrysosaccus)
オクロモナス目 (Ochromonadales)
ヒカリモ科 (Chromulinaceae)
ヒカリモ (Chromulina)
オクロモナス科 (Ochromonadaceae)
オクロモナス (Ochromonas)
ポテリオオクロモナス (Poterioochromonas)
スプメラ (Spumella) 葉緑体喪失
ウログレナ (Uroglena)
パラフィソモナス科 (Paraphysomonadaceae)
パラフィソモナス (Paraphysomonas)
サヤツナギ科 (Dinobryaceae)
サヤツナギ (Dinobryon)
エピピクシス (Epipyxis)
(Kephyriopsis)
(Stenocalyx)
クリソコックス科 (Chrysococcaceae)
クリソコックス (Chrysococcus)
アントフィサ (Amthophysa) 葉緑体喪失
リゾクリシス（クリソアメーバ）目 (Rhizochrysidales)
クリソアメーバ科 (Chrysamoebaceae)
クリソアメーバ (Chrysoamoeba)
リゾクリシス科 (Rhizochrysidaceae)
リゾクリシス (Rhizochrysis)
キボティオン科 (Kybotaceae)
キボティオン (Kybotion)
ミクソクリシス科 (Myxochrysidaceae)
ミクソクリシス (Myxochrysis)
ミズオ目 (Hydrurales)
ミズオ科 (Hydruraceae)
ミズオ (Hydrurus)
クリソスファエラ目 (Chrysosphaerales)
クリソスファエラ科 (Chrysosphaeraceae)
クリソスファエラ (Chrysosphaera)
クリサピア科 (Chrysapiaceae)
クリサピア (Chrysapia)
スティコグロエア科 (Stichogloeaceae)
スティコグロエア (Stichogloea)
アウロスファエラ科 (Aurosphaeraceae)
アウロスファエラ (Aurosphaera)
シヌラ藻綱 (Synurophyceae)
シヌラ目 (Synurales/Mallomonadales)
シヌラ科 (Synuraceae)
(Chrysosphaerella)
(Paraphysomonas)
(Spiniferomonas)
シヌラ (Synura)
マロモナス科 (Mallomonadaceae)
マロモナス (Mallomonas)
ラフィド藻綱 (Raphidophyceae/Olisthodiscus) 1目1科8属
ラフィドモナス目 (Raphidomonadales) 赤潮・海の華の優占種
ヴァクオラリア科 (Vacuolariaceae) 珪酸質の被殻状態(cyst)で休眠
淡水産亜科
ヴァクオラリア (Vacuolaria)
メロトリキア (Merotrichia)
ゴニオストムム (Gonyostomum)
海産亜科
ウミイトカクシ (Fibrocapsa)
シャットネラ (Chattonella)
アカシオモ (Heterosigma)
スベリコガネモ (Olisthodiscus)
ハラモナス (Haramonas)
?(Thaumatomastigaceae)
(Synoikomonas)
(Thaumatomastix)
フェイスティア上綱 (Phaeistia)
?ピングイオ藻綱 (Pinguiophyceae)
ピングイオクリシス目 (Pinguiochrysidales)
(Glossomastix)
(Phaeomonas)
ピングイオクリシス (Pinguiochrysis)
(Pinguiococcus)
(Polypodochrysis)
クリソメラ藻綱 (Chrysomerites)
クリソメリス目 (Chrysomeridales) （かつては黄金色藻綱に含められていた）
(Phaeosaccionaceae)
(Phaeosaccion)
クリソメリス科 (Chrysomeridaceae)
クリソメリス (Chrysomeris)
(Antarctosaccion)
(Chrysoderma)
(Chrysonephos)
(Chrysowaernella)
(Giraudyopsis)
(Rhamnochrysis)
黄緑藻綱 (Xanthophytes/Tribophytes) 100属600種 下位分類分子データに矛盾
ヘテロクロリス（クロロアメーバ）目 (Heterochloridales/Chloramoebales)
クロロアメーバ科 (Chloramoebaceae)
クロロアメーバ (Chloramoeba)
クロロメソン (Chloromeson)
ヘテロクロリス (Heterochloris)
リゾクロリス目 (Rhizochloridales)
リゾクロリス科 (Rhizochloridaceae)
リゾクロリス (Rhizochloris)
スティピトコックス科 (Stipitococcaceae)
スティピトコックス (Stipithococcus)
スティピトポロス (Stipitoporos)
ミクソクロリス科 (Myxochloridaceae)
ミクソクロリス (Myxochloris)
ヘテログロエラ目 (Heterogloeales)
ヘテログロエア科 (Heterogloeaceae)
ヘテログロエア (Heterogloea)
(Gloeochloris)
(Helminthogloea)
プレウロクロリデラ科 (Pleurochloridellaceae)
プレウロクロリデラ(Pleurochloridella)
マレオデンドロン科 (Mallodendraceae)
マレオデンドロン (Malleodendron)
カラキディオプシス科 (Characidiopsidaceae)
カラキディオプシス (Characidiopsis)
ミスココックス目 (Mischococcales)
プレウロクロリス科 (Pleurochloridaceae)
プレウロクロリス (Pleurochloris)
ボトリディオプシス科 (Botrydiopsidaceae)
ボトリディオプシス (Botrydiopsis)
グロエオボトリス科 (Gloeobotrydaceae)
グロエオボトリス (Gloeobotrys)
ボトリオクロリス科 (Botryochloridaceae)
ボトリオクロリス (Botryochloris)
グロエオポディウム科 (Gloeopodiaceae)
グロエオポディウム (Gloeopodium)
ミスココックス科 (Mischococcaceae)
ミスココックス (Mischococcus)
クロロペディア科 (Chloropediaceae)
クロロペディア (Chloropedia)
カラキオプシス科 (Characiopsidaceae)
カラキオプシス (Characiopsis)
ケントリトラクトス科 (Centritractaceae)
(Bumilleriopsis)
ケントリトラクトス (Centriractos)
トリパノクロリス科 (Trypanochloridaceae)
トリパノクロリス (Trypanochloris)
オフィオキティウム科(Ophiocytaceae)
オフィオキティウム (Ophiocytium)
トリボネマ目 (Tribonematales)
ネオネマ科 (Neonemataceae)
(Chadefaudiothrix)
ネオネマ (Neonema)
ヘテロペディア科 (Heteropediaceae)
ヘテロペディア (Heteropedia)
ヘテロコックス (Heterococcus)
ヘテロデンドロン科 (Heterodendraceae)
ヘテロデンドロン (heterodendron)
トリボネマ科 (Tribonemataceae)
トリボネマ (Tribonema)
(Brachynema)
(Bumilleria)
(Heterothrix)
(Heterotrichella)
フシナシミドロ目 (Vaucheriales)
フウセンモ科 (Botrydiaceae)
フウセンモ (Botrydium)
フシナシミドロ科 (Vaucheriaceae)
フシナシミドロ (Vaucheria)
(Asterosiphon)
クビレミドロ (Pseudodichotomosiphon)
ファエオタムニオン藻綱 (Phaeothamniophyceae)
ファエオタムニオン目 (Phaeothamniales)
ファエオプラカ科 (Phaeoplacaceae)
ファエオプラカ (Phaeoplaca)
スファエリディオトリクス科 (Sphaeridiotrichaceae)
スファエリディオトリクス (Sphaeridiotrichus)
ファエオタムニオン科 (Phaeothamniaceae)
ファエオタムニオン (Phaeothamnion)
ファエオデルマ科 (Phaeodermatiaceae)
ファエオデルマ (Phaeoderma)
プレウロクロリデラ目 (Pleurochloridales)
プレウロクロリデラ (Pleurochloridella)
シゾクラディア藻綱 (Schizocladiophyceae)
シゾクラディア (Schizocladia)
アウレアレナ藻綱 (Aurearenophyceae)
アウレアレナ (Aurearena)
褐藻綱 (Phaeophyceae/Fucophyceae) 300属2000種 胞子体と配偶体の生活環
?イシゲ (Ishige)
カヤモノリ目 (Scytosiphonales) 配偶体が大型
カヤモノリ (Scytothamnus)
(Splachnidium)
(Stereocladon)
シオミドロ目 (Ectocarpales)
シオミドロ (Ectocarpus)
イソブドウ (Botrytella)
ヤドリミドロ (Streblonema)
?ウイキョウモ目 (Dictyosiphonales)
コンブモドキ (Akkesiphycus)
コモンブクロ (Asperococcus)
ウイキョウモ (Dictyosiphon)
イワヒゲ (Myelophycus)
ヨコジマノリ (Striaria)
?ナガマツモ目 (Chordariales)
ニセモヅク (Acrothrix)
ナガマツモ (Chordaria)
ナミマクラ (Elachista)
ソメワケグサ (Halothrix)
モヅク (Nemacystis)
クロモ (Papenfussiella)
イシモヅク (Sphaerorichia)
フトモヅク (Tinocladia)
?イソガワラ目 (Ralfsiales)
マツモ (Analipus)
クロハンモン (Diplura)
イソガワラ (Ralfsia)
ケヤリモ目 (Sporochnales)
(Bellotia)
イチメガサ (Carpomitra)
ウミボッス (Nereia)
ケヤリモ (Sporochnus)
(Tomaculopsis)
ウルシグサ目 (Desmarestiales) 温帯海藻の主要構成要素
(Arthrocladia)
ウルシグサ (Desmarestia) ［側］
(Himantothallus)
(Phaeurus)
コンブ目 (Laminariales) 温帯海藻の主要構成要素
アナメ (Agarum)
(Akkesiophycus)
(Alaria)
ネコアシコンブ (Arthrothamnus)
ツルモ (Chorda)
スジメ (Costaria)
カジメ (Ecklonia)
アラメ (Eisenia)
トロロコンブ (Kjellmaniella)
コンブ (Laminaria)
(Lessonia)
(Pseudochoda)
ワカメ (Undaria)
ムチモ目 (Cutleriales)
ムチモ (Cutleria) ［側］
(Microzonia)
(Zanardinia)
ウスバオオギ目 (Syringodermatales)
ウスバオオギ (Syringoderma) 配偶体退化
クロガシラ目 (Sphacelariales) 胚芽枝による無性生殖
(Chaetopteris)
(Onslowia)
(Verosphacella)
クロガシラ (Sphacelaria)
カシラザキ (Halopteris)
アミジグサ目 (Dictyotales) 四分胞子曩
ヤハズグサ (Dictyopteris)
アミジグサ (Dictyota)
(Dilophus)
フタエオウギ (Distromium)
ハイオウギ (Lobophora)
ウミウチワ (Padina)
コモングサ (Spatoglossum)
(Stypopodium)
(Taonia)
シマオウギ (Zonaria)
ティロプテリス目 (Tilopteridales)
(Halosipon)
(Haplospora)
(Phaeosiphoniella)
(Phyllaria)
ティロプテリス (Tilopteris)
アスコセイラ目 (Ascoseirales) 南半球のみ
アスコセイラ (Ascoseirales)
ヒバマタ目 (Fucales) 温帯海藻の主要構成要素，配偶体退化（胞子体に付属）
(Ascophyllum)
ドゥルビラエア (Druvillaea) 南半球
(Bifurcaria)
(Cystoseira)
スギモク (Coccophora)
ヒバマタ (Fucus)
ヒジキ (Hizikia)
ヤバネモク (Hormophysa)
ジョロモク (Myagropsis)
ホンダワラ (Sargassum)
ラッパモク (Turbinaria)
アルヴェオラータ（胞虫）下界 (Alveolata) 表面構造（アンフィスマ／アルベオール）の類似 ［ミオゾア超門＋繊毛虫門］
ミオゾア超門(Miozoa) ［渦鞭毛藻門＋アピコンプレクサ門］
渦鞭毛虫門 (Dinozoa/Dinophyta/Dinoflagellata) 現生130属2000種 独立栄養／多くは三重膜葉緑体(ペリディニン含む)，一部二次喪失／退化 赤潮・貝毒の原因
プロタルベオラータ亜門 (Protalveolata)
?タラッソミケス目 (Thalassomyxa/Thalassomycetales)
タラッソミケス科 (Thalassomycetaceae)
(Ellobiocystis)
エロビオプシス (Ellobiopsis)
(Parallobiopsis)
(Rhizellobiopsis)
タラッソミケス (Thalassomyces)
?(Oxyrrhis)
パーキンサス綱 (Perkinsasida/Perkinsozoa)
パーキンサス目 (Perkinsorida)
パーキンサス科 (Perkinsidae)
(Parvilucifera)
パーキンサス (Perkinsus)
渦鞭毛虫亜門 (Dinoflagellata) 一次生産の約1/3
? (Apectodinium) 海水温暖化の指標（始新世初期の高温期の指標）
ディノフィシス綱 (Dinophyceae)
(Brachydiniales)
ブラキディニウム科 (Brachydiniaceae)
(Chytriodiniales)
(Chytriodiniaceae)
(Desmocapsales)
(Adinimonadaceae)
(Desmocapsaceae)
(Desmomastigaceae)
(Dinamoebales)
(Dinamoebaceae)
(Pfiesteriaceae)
(Gloeodiniales)
(Gloeodiniaceae)
(Hemidinium)
(Zooxanthellaceae) 狭義のZooxanthella 広義には，共生性の渦鞭毛藻類を指す
(Endodinium)
(Zoorhabdella)
褐虫藻 (Zooxanthella)
ギムノディニウム亜綱 (Gymnodiniphycidae)
ギムノディニウム目 (Gymnodiniales)
レピドティニウム (Lepidodinium) プラシノ藻共生型葉緑体 クロロフィルa・b
ギムノディニウム科 (Gymnodiniaceae)
アンフィディニウム (Amphidinium) クリプト藻共生型葉緑体
(Cochlodinium)
(Erythropsis)
ヒメハダカオビムシ (Gymnodinium) プラシノ藻（一部ハプト藻）共生型葉緑体
(Gyrodinium)
(Katodinium)
ポリクリコス科 (Polykrikaceae)
ポリクリコス (Polykrikos)
ウォルノウィア科 (Warnowiaceae)
(Erythropsidinium)
(Greuetodium)
ネマトディニウム (Nematodinium)
(Nematopsides)
(Proterythropsis)
(Protopsis)
ウォルノウィア (Warnowia)
アクティニスクス科 (Actiniscaceae)
アクティニスクス (Actiniscus)
?(Entomosigmaceae)
(Entomosigma)
プティコディスクス目 (Ptychodiscales)
ブラキディニウム科 (Brachydiniaceae)
プチコディスクス科 (Ptychodiscaceae)
プチコディスクス (Ptychodiscus)
スエシア目 (Suessiales)
シンビオディニウム科 (Symbiodiniaceae)
シンビオディニウム (Symbiodinium) 共生性 褐虫藻の代表
ペリディニ藻亜綱 (Peridiniphycidae)
ゴニオラクス目 (Gonyaulacales)
スピニフェリテス (Spiniferites)
ツノモ科 (Ceratiaceae)
ツノモ（ツノオビムシ） (Ceratium)
ケラトコリス科 (Ceratochoriaceae)
ケラトコリス (Ceratochoris)
クラドピクシス科 (Cladopyxiaceae)
(Plaeophalacroma)
ゴニオドマ科 (Goniodomaceae)
ゴニオドマ (Goniodoma)
ゴニオラクス科 (Gonyaulacaceae)
ゴニオラクス (Gonyaulax)
アレクサンドリウム (Alexandrium)
(Amylax)
(Lingulodinium)
(Protoceratium)
ピロキスティス科 (Pyrocystaceae)
(Fragilidium)
ピロキスティス (Pyrocystis)
ペリディニウム目 (Peridiniales)
ヘテロカプサ科 (Heterocapsaceae)
ヘテロカプサ (Heterocapsa)
ペリディニウム科 (Peridiniaceae)
プロトペリディニウム (Protoperidinium)
(Gotoius)
(Oblea)
(Diplopsalis)
(Peridiniopsis)
(Zygabikodinium)
マルウズオビムシ (Peridinium) 主要属 ケイ藻共生型葉緑体(三重膜)，クロロフィルa・c
コングルエンティディニウム科 (Congruentidiaceae)
ポドランパス科 (Podolampaceae)
ポドランパス (Podolampas)
(Oxytoxaceae)
(Archaeosphaerodiniopsidaceae)
(Ceratoperidiniaceae)
(Dinosphaeraceae)
(Glenodiniaceae)
(Heteraulacaceae)
(Lophodiniaceae)
オキシトキサム科 (Oxytoxaceae)
オキシトキサム (Oxytoxum)
(Pyrophacaceae)
ディノフィシス植物綱 (Diniphysiphycidae)
ディノフィシス目 (Dinophysiales)
オルニトケルスク (Ornithocercus)
アンフィソレニア科 (Amphisoleniaceae)
アンフィソレニア (Amphisolenia)
ディノフィシス科 (Dinophysiaceae)
ディノフィシス (Dinophysis)
オルニトケルクス (Ornithocercus)
オキシフィシス科 (Oxyphysiaceae)
オキシフィシス (Oxyphysis)
プロロケントルム目 (Prorocentrales) 綱レベル
プロロケントルム科 (Prorocentraceae)
(Mesoporos)
プロロケントルム (Prorocentrum)
フィトディニウム（ディノコックス）目 (Phytodiniales (Dinococcales)) 綱レベル
フィトディニウム科 (Phytodiniaceae)
(Bourrellyella)
(Cystodinedria)
(Cystodinium)
(Dinastridium)
ディノコックス (Dinococcus)
(Dinopodiella)
(Hypnodinium)
(Manchudinium)
(Phytodinedria)
(Phytodinium)
(Rhizodinium)
スティロディニウム (Stylodinium)
(Tetradinium)
トラコスファエラ目 (Thoracosphaerales)
トラコスファエラ科 (Thoracosphaeraceae)
トラコスファエラ (Thoracosphaera)
ブラストディニウム綱 (Blastodiniophyceae)
ブラストディニウム目 (Blastodiniales)
アポディニウム科 (Apodiniaceae)
アポディニウム (Apodinium)
ブラストディニウム科 (Blastodiniaceae)
ブラストディニウム (Blastodinium)
カッショネラ科 (Cachonellaceae)
(Actinodinium)
カッショネラ (Cachonella)
ハプロゾーン科 (Haplozoaceae)
(Haplozoon)
プロトディニウム科 (Protodiniaceae)
プロトディニウム (Protoodinium)
オオディニウム科 (Oodiniaceae)
ディッソディニウム (Dissodinium)
オオディニウム (Oodinium)
夜光虫綱 (Noctiluciphyceae) 葉緑体持たず
夜光虫（ノクティルカ）目 (Noctilucales)
ヤコウチュウ（ノクティルカ）科 (Noctilucaceae)
ヤコウチュウ（ノクティルカ） (Noctiluca) ルシフェラーゼ発光 豚の尻形
(Pronoctiluca)
(Leptodiscaceae)
(Abedinium)
(Cachonodinium)
(Craspedotella)
(Cymbiodinium)
(Leptodiscus)
(Petalodinium)
(Scaphodinium)
コフォイディニウム科 (Kofoidiniaceae)
コフォイディニウム (Kofoidinium)
(Pomatodinium)
(Spatulodinium)
シンディニウム綱 (Syndiniophyceae)
シンディニウム目 (Syndiniales)
シンディニウム科 (Syndiniaceae)
シンディニウム (Syndinium)
(Amoebophryaceae)
(Amoebophrya)
(Duboscquellaceae)
(Duboscquella)
(Oxyrrhinaceae)
(Coccidiniaceae)
(Spiromonadaceae)
アピコンプレクサ門 (Apicomplexa/Sporozoa) 現生3500種 退化した葉緑体を持つ
?(Colponema)
?マヌベリスポラ亜門 (Manubrispora)
メチニコヴェラ綱 (Metchnikovellea/Rudimicrosporea)
メチニコヴェラ目 (Metchinikovellida)
メチニコヴェラ科 (Metchnikovellidae)
(Amphiacantha)
(Amphiamblys)
メチニコヴェラ (Metchnikovella)
(Sphaeriparaceae)
コルポデラ目 (Colpodellida)
アルファモナス (Alphamonas)
コルポデラ (Colpodella)
ヴォロモナス (Voromonas)
無コノイド綱 (Aconoidasida) 無性期にコノイドを欠く
ヘモスポピダ目 (Haemospororida)
プラスモディウム科 (Plasmodiidae)
プラスモディウム (Plasmodium) マラリア原虫
(Haemoproteus)
(Hepatocystis)
(Leucocytozoon)
(Mesnilium)
(Nycteria)
(Polychromophilus)
(Rayella)
(Saurocytozoon)
バベシア目 (Piroplasmorida)
(Anthemosomatidae)
(Anthemosoma)
バベシア科 (Babesiidae)
バベシア (Babesia)
(Echinozoon)
(Entopolypoides)
(Theileriidae)
(Theileria)
(Haemohormidiidae)
?アセトスポラ上綱 (Ascetospora) 現生30種
ステラトスポラ綱 (Stellatospora)
オクルソスポラ目 (Occlusosporida)
バラノスポラ目 (Balanosporida)
ミンキニア (Minchinia)
パラミクサ綱 (Paramyxa)
パラミクサ目 (Paramyxida)
パラミクサ科 (Paramyxidae)
パラミクサ (Paramyxa)
コノイド綱 (Conoidasida)
コクキディウム亜綱 (Coccidiasina)
リティドキスティス目 (Agamococcidiorida)
リティドキスティス科 (Rhytidocystidae)
リティドキスティス (Rhytidocystis)
(Gemmocystidae)
目 (Ixorheorida)
(Ixorheidae)
エレウテロスキゾン目 (Protococcidiorida)
エレウテロスキゾン科 (Eleutheroschizonidae)
エレウテロスキゾン (Eleutheroschizon)
(Myriosporidae)
(Angeiocystidae)
(Grelliidae)
(Coelotropha)
(Defretinella)
(Grellia)
(Mackinnonia)
(Myriospora)
(Myriosporides)
コクキディウム目 (Eucoccidiorida)
(Adeleorina)
(Adeleidae)
(Legerellidae)
(Klossiellidae)
(Hepatozoidae)
(Haemogregarinidae)
(Karyolysidae)
(Dactylosomatidae)
エイメリア亜目 (Eimeriorina)
(Spirocystidae)
(Spirocystis)
(Selenococcidiidae)
(Selenococcidium)
(Aggregatidae)
(Aggregata)
(Grasseella)
(Merocystis)
(Ovivora)
(Pseudoklossia)
(Selysina)
クリプトスポリディウム科 (Cryptosporidiidae)
クリプトスポリディウム (Cryptosporidium) ミトコンドリア喪失，水道水汚染
(Lankesterellidae)
(Atoxoplasma)
(Lankesterella)
(Schellackia)
エイメリア科 ((Eimeriidae)
エイメリア (Eimeria)
(Barrouxia)
(Caryospora)
(Cyclospora)
(Diaspora)
(Dorisa)
(Gousseffia)
(Hoarella)
(Isospora)
(Mantonella)
(Octosporella)
(Pythonella)
(Sivatoshella)
(Skrjabinella)
(Tyzzeria)
(Wenyonella)
(Calyptosporiidae)
(Sarcocystidae)
(Sarcocystinae)
(Arthrocystis)
(Frenkelia)
(Sarcocystis)
トキソプラズマ亜科 (Toxoplasmatinae)
(Besnoitia)
トキソプラズマ (Toxoplasma)
(Elleipsisomatidae)
グレガリナ亜綱 (Gregarinasina)
エクソスキゾン目 (Archigregarinorida)
セレニディオイデス科 (Selenidioididae)
セレニディオイデス (Selenidioides)
エクソスキゾン科 (Exoschizonidae)
エクソスキゾン (Exoschizon)
グレガリナ目 (Eugregarinorida)
(Blastogregarinorina)
(Siedleckiidae)
(Siedleckia)
(Aseptatorina)
(Selenidiidae)
(Lecudinidae)
(Urosporidae)
(Aikinetocystidae)
(Monocystidae)
(Diplocystidae)
(Allantocystidae)
(Schaudinnellidae)
(Enterocystidae)
(Ganymedidae)
(Septatorina)
(Porosporicae)
グレガリナ上科 (Gregarinicae)
(Cephaloidophoridae)
(Cephalolobidae)
(Uradiophoridae)
(Gregarinidae)
グレガリナ (Gregarina)
(Metameridae)
(Didymophyidae)
(Hirmocystidae)
(Stenophoricae)
(Stenophoridae)
(Leidyanidae)
(Cnemidosporidae)
(Monoductidae)
(Sphaerocystidae)
(Trichorhynchidae)
(Dactylophoridae)
(Amphiplatysporidae)
(Stylocephalidae)
(Actinocephalidae)
(Brustiophoridae)
(Acutidae)
(Monoicidae)
(Fusionicae)
(Fusionidae)
(Fusiona)
カウレリエラ目 (Neogregarinorida)
(Gigaductidae)
(Gigaductus)
カウレリエラ科 (Caulleryellidae)
カウレリエラ (Caulleryella)
(Tipulocystis)
(Ophryocystidae)
(Ophryocystis)
(Syncystidae)
(Syncystis)
(Schizocystidae)
(Lymphotropha)
(Machadoella)
(Schizocystis)
(Lipotrophidae)
(Farinocystis)
(Lipocystis)
(Lipotropha)
(Mattesia)
(Menzbieria)
繊毛虫門 (Ciliophora) Ciliates 現生7200種 Denis Lynn による分類
亜門 (Postciliodesmatophora) Tubulicorticata
原始大核綱 (Karyorelictea)
?(Ciliofaurea)
?(Corlissia)
ホロフリア目 (Protostomatida)
ケントロフォルス科 (Kentrophoridae)
ケントロフォルス (Kentrophoros)
(Prototrachelocerca)
(Trachelolophos)
(Trachelonema)
(Tracheloraphis)
トラケロケルカ科 (Trachelocercidae)
トラケロケルカ (Trachelocerca)
(Gruvelina)
(Nephrocerca)
(Protrichophora)
ロクソデス目 (Loxodida)
ロクソデス科 (Loxodidae)
ロクソデス (Loxodes)
(Cryptopharyngidae)
(Protoheterotrichida)
ゲレイア科 (Geleiidae)
(Avelia)
ゲレイア (Geleia)
(Gellertia)
異毛綱 (Heterotrichea)
?(Pediostomum)
リクノフォラ目 (Licnophorida)
リクノフォラ科 (Licnophoridae)
ラッパムシ目 (Heterotrichida)
(Folliculinidae)
(Ampullofolliculina) Hadzi, 1951
(Ascobius) Henneguy, 1884
(Aulofolliculina) Hadzi, 1951
(Botticula) Dioni, 1972
(Claustrofolliculina) Hadzi, 1951
(Donsia) Hadzi, 1951 [obj. syn. for Plicophrya]
(Echinofolliculina) Dons, 1934
(Epifolliculina) Hadzi, 1951
(Eufolliculina) Hadzi, 1951
(Folliculina) Lamarck, 1816
(Folliculinopsis)
(Lagotia) Wright, 1858 [1857]
(Latifolliculina) Hadzi, 1951
(Metafolliculina) Dons, 1925 [1924]
(Mirofolliculina) Dons, 1927 [1928]
(Pachyfolliculina) Hadzi, 1951
(Parafolliculina) Dons, 1914
(Pebrilla) Giard, 1888
(Pedifolliculina) Hadzi, 1951 [obj. syn. Pseudofolliculina]
(Perifolliculina) Hadzi, 1951
(Planifolliculina) Hadzi, 1951
(Platyfolliculina) Hadzi, 1938
(Priscofolliculina) Deflandre & Deunff, 1957
(Pseudofolliculina) Dons, 1914
?(Pseudoparafolliculina) Andrews & Nelson, 1942 [?]
(Stentofolliculina) Hadzi, 1938
(Tapetofolliculina) Andrews & Nelson in Hadzi, 1951 (Pseudoparafolliculina?)
(Valletofolliculina Andrews, 1953
(Peritromidae)
(Peritromus)
ミドリラッパムシ科 (Stentoridae)
?(Parastentor)
?(Stentoropsis)
ミドリラッパムシ (Stentor)
(Blepharismidae)
(Blepharisma)
(Anigsteinia)
(Blepharisma)
(Parablepharisma)
(Pseudoblepharisma)
(Spirostomidae)
?(Diplogmus)
?(Propygocirrus)
(Gruberia)
(Spirostomum)
(Condylostomatidae)
(Condylostoma)
(Condylostomides)
(Linostoma/Linostomella)
(Dellochus)
(Climacostomidae)
(Climacostomum)
(Copemetopus)
(Fabrea)
(Chattonidiidae)
(Chattonidium)
亜門 (Intramacronucleata)
旋毛綱 (Spirotrichea)
(Licnophora)
プロトクルジア亜綱 (Protocruziidia)
プロトクルジア目 (Protocruziidia)
プロトクルジア科 (Protocruziidae)
プロトクルジア (Protocruziida)
ファコディニウム亜綱 (Phacodiniidia)
ファコディニウム目 (Phacodiniida)
ファコディニウム科 (Phacodiniidae)
ファコディニウム (Phacodinium)
ヒポトリキダ亜綱 (Hypotrichia)
(Kiitrichida)
?(Reichenowellidae)
(Reichenowella)
?(Transitellidae)
(Balantidioides)
(Transitella)
(Kiitrichidae)
(Caryotricha)
(Kiitricha)
(Euplotida)
(Discocephalina)
(Discocephalidae)
(Discocephalus)
(Marginotricha)
(Prodiscocephalus)
(Psammocephalus)
(Erionellidae)
(Erionella)
(Euplotina)
(Aspidiscidae)
?(Paraeuplotes)
(Aspidisca)
(Euplotaspis)
(Onychaspis)
(Certesiidae)
(Certesia)
(Euplotidae)
(Euplotes)
(Gastrocirrhidae)
(Cirrhogaster)
(Cytharoides)
(Euplotidium)
(Gastrocirrhus)
(Swedmarkia)
(Uronychiidae)
(Diophryopsis)
(Diophrys)
(Paradiophrys)
(Uronychia)
少毛亜綱 (Oligotrichia)
(Halteriida)
(Strombidiida)
コレオトリカ亜綱 (Choreotrichia) 以下未完
カラムシ目 (Tintinnida)
(Dictyocystidae)
(Tintinnidiidae)
(Tintinnidium)
(Codonellidae)
(Codonellopsidae)
(Nolaclusiliidae)
(Metacylididae)
(Ascampbelliellidae)
(Epiplocylididae)
(Rhabdonellidae)
(Ptychocylidae)
(Petalotrichidae)
(Cyttarocylididae)
(Xystonellidae)
(Undellidae)
(Tintinnidae)
(Amphorides)
(Daturella)
(Eutintinnus)
(Salpingella)
クダカラムシ (Tintinnus)
コレオトリカ目 (Choreotrichida)
(Strobilidiina)
(Strobilidiidae)
(Strobilidium)
(Strombidinopsina)
(Strombidinopsidae)
(Strombidinopsis)
(Leegaardiellina)
(Leegaardiellidae)
(Lohmanniellina)
(Lohmanniellidae)
棘毛亜綱 (Stichotrichia)
(Plagiotomida)
(Urostylida)
棘毛目 (Stichotrichida)
(Sporadotrichida)
綱 (Armophorea)
(Armophorida)
メトプス (Metopus)
クリーウランデラ目 (Clevelandellida)
櫛口目 (Odontostomatida)
リトストマ綱 (Litostomatea)
毒胞亜綱 (Haptoria)
(Cyclotrichida)
毒胞目 (Haptorida)
側口目 (Pleurostomatida)
毛口亜綱 (Trichostomatia)
有口庭目 (Vestibuliferida)
エントディニウム目 (Entodiniomorphida)
層状咽頭綱 (Phyllopharyngea)
??層状咽頭亜綱 (Phyllopharyngia)
(Chlamydodontida)
(Dysteriida)
(Cyrtophoria)
(Brooklynella)
(Chilodonella)
(Chonotrichia)
(Chilodochona)
(Spirochoma)
(Vasichona)
有吻亜綱 (Rhynchodia)
(Hypocomatida)
(Rhynchodida)
漏斗亜綱 (Chonotrichia)
(Cryptogemmida)
(Exogemmida)
吸管虫亜綱 (Suctoria) スイクダムシ
外生芽目 (Exogenida)
ハリヤマスイクダムシ科 (Ephelotidae)
ハリヤマスイクダムシ (Ephelota)
内生芽目 (Endogenida)
ボンボリスイクダムシ科 (Tokophryidae)
ボンボリスイクダムシ (Tokophrya)
外転芽目 (Evaginogenida)
ハナエダスイクチムシ科 (Dendrocometidae)
ハナエダスイクチムシ (Dendrocometes)
簗口綱 (Nassophorea)
単膜目 (Synhymeniida)
ナスラ目 (Nassulida)
(Nassula)
(Microthoracida)
(Discotricha)
コルポーダ綱 (Colpodea)
ブリオフリア目 (Bryophryida)
コルポーダ目 (Colpodida)
コルポーダ (Colpoda)
キルトロフォシス目 (Cyrtolophosidida)
フクロミズケムシ目 (Bursariomorphida)
(Bursaria)
(Sorogenida)
(Bryometopida)
前口綱 (Prostomatea/Filocorticata)
前口目 (Prostomatida)
(Apsiktratidae)
(Metacystidae)
(Metacystis)
(Pelatractus)
(Vasicola)
シオミズケムシ目 (Prorodontida)
(Plagiocampidae)
(Malacophryidae)
(Balanionidae)
(Urotrichidae)
(Placidae)
(Colepidae)
(Coleps)
(Lagynidae)
シオミズケムシ科 (Prorodontidae)
(Bursella)
(Bursellopsis)
(Placus)
(Plagiocampa)
シオミズケムシ (Prorodon)
(Pseudoprorodon)
(Rhagadostoma)
(Spathidiopsis)
(Thoracophrya)
(Urotricha)
(Holophryidae)
プラギオピラ綱 (Plagiopylea)
プラギオピラ目 (Plagiopylida)
(Trimyemidae)
(Sonderiidae)
(Sonderia)
プラギオピラ科 (Plagiopylidae)
少膜綱 (Oligohymenophorea/Epiplasmata)
ゾウリムシ亜綱 (Peniculia)
ゾウリムシ目 (Peniculida)
(Frontoniina)
(Lembadionidae)
(Maritujidae)
(Stokesiidae)
(Clathrostomatidae)
(Frontoniidae)
ゾウリムシ亜目 (Parameciina)
(Urocentridae)
(Neobursaridiidae)
ゾウリムシ科 (Parameciidae)
ゾウリムシ (Paramecium)
有スクティカ亜綱 (Scuticociliatia)
(Philasterida)
(Pleuronematida)
(Thigmotrichida)
膜口亜綱 (Hymenostomatia)
膜口目 (Hymenostomatida)
(Malacophridae)
(Malacophrys)
テトラヒメナ亜目 (Tetrahymenina) ミズケムシ亜目
(Curimostomatidae)
(Spirozonidae)
テトラヒメナ科 (Tetrahymenidae) ミズケムシ科
(Colpidium)
(Deltopylum)
(Lambornella)
(Melacophrya)
(Stegochilum)
テトラヒメナ (Tetrahymena) このRNAでリボザイムの発見（チェック）
(Turaniellidae)
(Glaucomidae)
(Ophryoglenina)
(Ichthyophthiriidae)
(Ophryoglenidae)
隔口亜綱 (Apostomatia)
ピリサクトリア目 (Pilisuctorida)
(Conidophryidae)
(Ascophrys)
(Askoella)
(Conidophrys)
欠口目 (Astomatophorida)
(Opalinopsidae)
クロミディナ (Chromidina)
(Opalinopsis)
メタコリニア目 (Apostomatida)
(Colliniidae)
(Collinia)
(Foettingeriidae)
(Foettingeria)
(Hyalophysa)
(Hyalospira)
(Phtorophrya)
(Polyspira)
(Spirophrya)
(Terebrospira)
縁毛亜綱 (Peritrichia)
固着目 (Sessilida)
(Termitophryidae)
(Astylozoidae)
(Opisthonectidae)
(Ophrydiidae)
(Vaginicolidae)
(Ellobiophryidae)
(Lagenophryidae)
(Usconophryidae)
(Rovinjellidae)
ツリガネムシ科 (Vorticellidae)
ツリガネムシ (Vorticella)
エダワカレツリガネムシ (Carchesium)
(Zoothamniidae)
(Operculariidae)
(Scyphidiidae)
(Epistylididae)
遊泳目 (Mobilida)
(Trichodinidae)
(Urceolariidae)
レイオトロカ科 (Leiotrochidae)
レイオトロカ (Leiotrocha)
(Polycyclidae)
(Trichodinopsidae)
無口亜綱 (Astomatia)
無口目 (Astomatida)
(Archiastomatidae)
アノプロフリア科 (Anoplophryidae)
アノプロフリア (Anoplophrya)
(Lomiella)
(Haptophryidae)
(Clausilocolidae)
(Maupasellidae)
(Intoshellinidae)
(Contophryidae)
(Radiophryidae)
(Hoplitophryidae)
＜進化＞
最古の真核生物
!グリパニア (Grypania spiralis) 21億〜14億年前の最古の真核生物化石，直径
数cmのらせん形（ミシガン州），多細胞?
18〜14億年前の地層からも発見されている．
!クアリア (Chuaria) 18億年前の40-200μmの球状真核化石（北京近郊）
!キドノスファエラ (Kidonosphaera) 上に似る（北京近郊）
バイオマーカーとしてのステラン（真核生物のみが作れるステロールが変質した
安定性の高い物質）17億年前
!アクリターク 19億年前以降 10〜20μm程度
!ロングフェンシャニア (Longfenshania) 8億年前 スプーン状形態
!タウイア (Tawuia)群集 8〜6億年前
確実な多細胞藻類 12億年前以降
最古の多細胞動物:
!環形動物様化石 中国東部8.5億〜7.4億年前 （柳湾層: Liulaobei Formation）
!クロウディナ (Cloudina) 最古の硬組織動物 ヴェンド紀 ナミビア 長さ2mm円筒形，方解石含む
!ヴェンド生物界 (Vendobiont) エディアカラ(Ediacara)生物群を別界の生物と
みなす考え方，世界各地（当時熱帯）で産する．
ヴェンド紀 (Vendian) 650Ma〜544Ma バランガー氷期後
!ネミアナ (Nemiana)
!ベルタネリフォルミス (Beltanelliformis)
!エオポルピタ (Eoporpita) ヒドロ虫綱盤水母目ギンカクラゲ (Porpita)に類似 Cyclozoa綱?
!オウァトスクトゥム (Ovatoscutum)
!コンドロプロン (Chondroplon)
!ディキンソニア (Dickinsonia) エアマット状 大きさは1m近いが厚さは3mm以下 Proarticulata門
!キムベレア (Kimberella) ヴェンド紀 4回対称 軟体動物／立方くらげに類似? ロシア・白海 Nature 388, 868.
!マウソニテス (Mawsonites) 刺胞動物?
!トリプラキディウム (Tribrachidium)
!コノメドゥシテス (Conomedusites) !コヌラリア目と近縁?
!スプリッギナ (Spriggina) 環形動物多毛類? 46mm
!カルニオディスクス (Charniodiscus) 葉状 花虫綱ヤギ類に似る Petaronamae門
!プテリディニウム (Pteridinium) 葉状
Small Shelly Fossils (SSF) カンブリア紀の産出する珪酸・石灰・燐酸塩からなる微小硬骨格
!澄江（チェンジャン Chengjiang）動物群 カンブリア紀前期 520Ma
!ミクロディクティオン (Microdyction) 有爪動物 ハルキゲニアと近縁 10対の円盤
!ハイコウエラ (Haikouella) 頭蓋動物? Yunananozoon
!カサイミルス (Cathaymyrus) 頭索動物?
!ミロクンミンギア (Myllokunmingia)
!ハイコウイクティス (Haikouichthys) 頭蓋動物
!ウィトゥリコリア門(Vetulicolia) Shu et al. 2001 Nature 414, 419.
澄江動物群中で，二分的体制と一列に並ぶ鰓裂(gill slit)を持ち，原始的な後口動物と思われる一群
!バンフィア (Banffia) Chen & Zhou 1997
!ウィトゥリコリア綱 (Vetulicolida) Chen & Zhou 1997
!キダズーン (Xidazoon) Shu et al. 1999 Nature 400, 746.
!ディガズーン (Digazoon) Shu et al. 2001
!ポマトラム (Pomatrum) Leu et al. 1999
!ウィトゥリコリア (Vetulicolia) Chen & Zhou 1997 節足動物との見方も，遊泳性
!Guanshan Formation
シリウスパセット (Sirius Passet)動物群 （グリーンランド北部） konservat-lagerst\"{a}tte 518〜505Ma
!(Kerygmachela) カンブリア紀中期 節足動物
!ハルキエリア (Halkieria) カンブリア紀中期 体表を被う石灰質微小硬骨格がSSFと考えられる
!(Buenellus) 三葉虫綱レドリキア目
!(Pauloterminus)
!バージェス(Burgess)頁岩動物群 カンブリア紀中期 505Ma
現存の全ての後生動物のグループを含む多様性
捕食動物の直接確認
脊索動物の出現
黒色泥岩に軟体部まで保存される
!オパビニア (Opabinia) 5つの眼? 象の鼻状のノズル
!ネクトカリス (Nectocaris) 一対の眼柄，二対の肢節の無い短触角
!オドントグリフス (Odontogryphs) 横方向にくびれのある楕円形 触手冠動物?
!アノマロカリス (Anomarocaris) 環形動物から節足動物への進化途上？
!マレッラ (Marrella) 三葉虫様節足動物
!バンフィア (Banffia) 原始的な後口動物
!ピカイア (Pikaia) 最古の脊椎動物
!オダライア (Odaraia)
!ワプティア (Waptia)
!ハルキゲニア (Hallucigenia) 棘の生えた円盤を持つ，有爪動物?
!ウィワクシア (Wiwaxia) ハルキエリア科
!マルレラ (Marrella) 節足動物
!アユシェアイア (Aysheaia) カイメン食? 有爪動物／節足動物
!ヨホイア (Yohoia) 節足動物
!カナダスピス (Canadaspis) 甲殻類
!ペルスピカリス (Perspicaris) 甲殻類
!サンクタカリス (Sanctacaris) 鋏角類
!ナラオイア (Naraoia) 古三葉虫
!古杯類 (Archaeocyathans)